شناسایی ژن های جدید در ۱۰ بیمار مبتلا به دیستروفی عضلانی که در ژن های شناخته شده جهشی نداشته اند
نام عام مواد
[پایاننامه]
عنوان اصلي به زبان ديگر
Identification of novel genes in ten patients with muscular dystrophy, who have no mutations in known genes
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۵
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
ذ،۱۷۰ص.
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
ژنتیکGenetic
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۵/۱۱/۱۱
کسي که مدرک را اعطا کرده
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
بیماری های عصبی عضلانی یک گروه از اختلالات هتروژن پیشرونده هستند .از هر ۳۰۰۰ تا ۴۰۰۰ نوزادی که متولد شده یک نفر دچار یکی از بیماری های عصبی عضلانی شده است .دیستروفی های عضلانی شایع ترین فرم بیماری های عضلات می باشد .تظاهرات بالینی و شدت انواع مختلف دیستروفی عضلانی بسیار متفاوت، اعم از میوپاتی خفیف تا نارسایی قلبی می باشد .از آنجا که تجانس و فنوتیپ بیماران با هم تداخل دارند، باید قبل از دریافت تشخیص بالینی و مولکولی، آزمایشات الکترومیوگرافی) EMG ( و ایمونوهیستوشیمی) IHC ( و بیوپسی عضلات و سطح کراتین کیناز بررسی شود .پیشرفت های اخیر در تکنولوژی تعیین توالی شناسایی تعداد زیادی ژن عامل بیماری با هزینه نسبتا کم و در مدت زمان کمتر را ممکن ساخته است .روش بررسی برای شناسایی جهش های تاثیرگذار در این خانواده ها، افراد مبتلا با استفاده از روش توالی یابی کل اگزون با استفاده از کیتAgilent SureSelect V ۴ همراه با Illumina Hiseq ۲۰۰۰ آنالیز گردیدند .با روش توالی یابی نسل بعد، واریانت ها با تغییرات فاقد اهمیت عملکردی شامل واریانت ها با فاصله ی ۲+- جفت باز از ژن ها، واریانت های همنام و با فرکانس آللی بالای ۱ حذف شده اند .سپس عملکرد واریانت های باقی مانده را با ابزار های بیو انفورماتیکی مانند CADD و dbNSFPمورد ارزیابی قرار گرفت .یافته ها در نهایت با مقایسه واریانت ها با بانک ژنومی جمعیت ایرانی و حذف واریانت های شایع ۷ خانواده از ۱۳ خانواده به نتایجی رسیدند و واریانت هایی برای این بیماران کاندید شد و نتایج با توالی یابی سنگر تایید گشت .در این مطالعه که سه خانواده افزون بر مطالعه مورد بررسی قرار گرفت ۶ ژن کاندید جدید برای بیماری های عصبی عضلانی شناسایی شد که یک خانواده با دو کاندید جدید، ۴ خانواده با یک کاندید جدید، ۲خانواده با جهش جدید برای دو ژنSYNE ۱ وCLTCL ۱ که ژن های شناخته شده برای بیماری های عصبی عضلانی اند، شناسایی گردید .در این مطالعه ۶ خانواده بدون کاندید بودند .بحث با کاربرد روش WES می توان برای شناسایی جهش ها عامل بیماری هتروژن گامی رو به جلو برداشت، رویکرد مناسبتری برای ارتباط ژنوتیپ فنوتیپ و تشخیص مولکولی سایر خانواده های مبتلا ارائه داد .کلید واژه ها دیستروفی عضلانی، توالی یابی نسل بعد، توالی یابی کل اگزوم، توالی یابی سنگر
متن يادداشت
Neuromuscular disorders are a progressive heterogeneous group with considerable heterogeneity. The frequency of these diseases is one in 3000 to 4000 live births. Clinical demonstrations and severity of different types of muscular dystrophy are varying widely, ranging from mild myopathy to heart failure. Because of the heterogeneity and phenotypic demonstrations in patients before doing clinical diagnosis and appropriate molecular tests, Electromyography (EMG) and immunohistochemistry tests (IHC) and muscle biopsy and creatine kinase levels have been checked. Recent advances in sequencing technology by using next generation sequencing and microarrays, identified a large number gene in diseases with relatively low cost and in less time is possible. Materials and Methods To identify the causal mutations in these families WES by using Agilent SureSelect V4 exome enrichment kit combined with Illumina Hiseq2000 sequencing.With using the Next generation sequencinh technique, variants with no functional importance were deleated includes Variants with a distance of +/-2 bp from genes, Synonymouse variants with minor allele frequency up to 1 . Then the remaining variants were evaluated with bioinformatics tools such as CADD and dbNSFP. Results Finally, by comparing the genomic variants with Bank Iranian population and remove the common variants, 7 of 13 families were resulted and some variants for these patient were candidate and the results were confirmed by Sanger sequencing. In this study, 6 new candidate genes for neuromuscular disease which includes ASPH, KCNE4, BCORL1, MTMR8, SLC12A3, EXO1 and 2 new mutations in three genes known SYNE1 and CLTCL1for neuromuscular diseases were identified. In this study, 6 families were without a candidate. Discussion By using WES for identifying mutations responsible for heterogenous disease, we can obtain better understanding of the genotype-phenotype correlation and provide more focused approach for molecular diagnosis of other families who suffered from these diseases. Keywords Muscular Dystrophy, Next Generation Sequencing, Whole Exom Sequencing, Sanger Sequencing
خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه
ba
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
Identification of novel genes in ten patients with muscular dystrophy, who have no mutations in known genes
موضوع (اسم عام یاعبارت اسمی عام)
موضوع مستند نشده
Muscular Dystrophy
مقوله موضوعی
متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی
دیستروفی عضلانی
متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی
Muscular Dystrophy
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )