عنوان

بررسی عملکردی توالی تکراری پروموتر مرکزی ژنSCGB2B2 انسانی

کد کشور

IR

شماره

۲۰۷۸پ

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

فارسی

کشور محل نشر

IR

عنوان اصلي

بررسی عملکردی توالی تکراری پروموتر مرکزی ژنSCGB2B2 انسانی

نام عام مواد

[پایان‌نامه]

عنوان اصلي به زبان ديگر

Functional Analysis of the Human SCGB2B2 Gene Core Promoter CA Repeat

نام ناشر، پخش کننده و غيره

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare & Rehabilitation Sciences))

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ۱۳۹۳

نام خاص و کميت اثر

۹۵ص.

متن يادداشت

چاپی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

ژنتیک Genetics

کسي که مدرک را اعطا کرده

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare & Rehabilitation Sciences))

متن يادداشت

Secretoglobins(SCGBs)از یک خانواده پروتئینی کوچک ترشحی تشکیل شده است SCGB .با غلظت بالایی در ترشحات پستانداران از جمله مایع ریوی وغدد اشکی وغده بزاقی وپروستات ورحم یافت می شود .بر خلاف بیشتر ژنهای یوکاریوتی که در ناحیه پروموتر مرکزی خود دارای جعبه TATA و یا عناصر آغازگر (INR) هستند، پروموتر مرکزی) SCGB2B2فاصله بین + 1تا- ( 120فاقد عناصر TATA ،like - TATA، INR و همینطور توالی هایrich - GCجهت رونویسی ژن می باشد .در واقع ناحیه ی پروموتر مرکزی ژن SCGB2B2 به جای این توالی های شناخته شده ، غنی شده از تکرارهای .CA در بررسی های انجام گرفته بر روی پروموتر مرکزی همه ی ژن های کد کننده ی پروتئین، SCGB2B2 بلندترینSTR - CAانسانی(/(25CA را به خود اختصاص می دهد .تکرارهای CAبه دلیل بی ثباتی و جهش پذیری بسیار بالا ، نقش بارز و قابل توجهی را در تکامل ژنوم ، از طریق ایجاد و حفظ تنوع ژنتیکی ، ایفا می کند .هدف از این مطالعه بررسی عملکردی تکرارهای CA موجود در پروموتر مرکزیSCGB2B2 است .نتایج حاصل از این مطالعه نشان دهنده ی تفاوت معنادار بیان ژن در سلول HEK293T است که نتیجه ای از آلل های متفاوت پروموتر مرکزیSCGB2B2 از نظر طول تکرارهای CA می باشد .و همینطور با بررسی پروموتر مرکزیSCGB2B2 در بین گونه ها، حفاظت شدگی تکرارهای CA این ناحیه در طی تکامل در میان گونه ها، اهمیت عملکردی این تکرارها را بیش از پیش تقویت می کند .اطلاعات ما مکانیسم جدیدی را در ارتباط با نقش توالی های تکراری پروموتر مرکزی در تنوع بیان ژن و فنوتیپ های چند عاملی معرفی می نماید و پیشنهاد می کند که تکرارهای CA پروموتر مرکزی می توانند مکانیسم جدیدی برای تنوع بین فردی و بین گونه ای در بیان ژن باشد .

متن يادداشت

Short tandem repeats (STRs) can provide more flexible codes for speciation and adaptive revolution than the quaternary codes provided by the DNA nucleotide blocks (G, T, A, and C) in non-repetitive sequences. We have recently published a genome-scale catalog of H. sapiens protein-coding gene core promoters that contain STRs of 6-repeats, and may confer selective advantage to humans. At the top of that list, SCGB2B2 (also known as SCGBL), contains one of the longest CA-repeat STRs identified in a human gene core promoter, at 25-repeats. In the current study, we used the Ensembl database to analyze the evolutionary trend of the SCGB2B2 core promoter CA-STR, and deduced protein sequence across mammals. The functional implication of this STR in modulating gene expression was also studied in vitro. We found that the SCGB2B2 core promoter CA-repeat is exceptionally expanded across Hominidae (great ape) family members as follows: H. sapiens: (CA)25, G. gorilla: (CA)19, P. troglodytes: (CA)16, and P. abelii; (CA)15, whereas CA-repeats of >2-repeats were not detected in any non-primate order (p<1x10-6, df=1). This is the only CA-repeat identified in a human gene core promoter, which specifically links to Hominidae speciation, and reaches maximum length in H. sapiens. The SCGB2B2 deduced protein sequence was found to be >91 homologous across Hominidae, whereas homology between Hominidae and other mammals was <39 . Different alleles of this CA-repeat were found to significantly alter gene expression in the HEK-293 cell line, in the Luciferase Dual Glo system. We propose that at the crossroads of evolution, the expansion of the SCGB2B2 gene core promoter CA-repeat may have contributed to the emergence and evolution of Hominidae. A role for the SCGB2B2 gene in Hominidae speciation is further supported by the uniquely homologous annotated protein sequence across this family of primates

خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه

ba

عنوان اصلي به زبان ديگر

Functional Analysis of the Human SCGB2B2 Gene Core Promoter CA Repeat

مستند نام اشخاص تاييد نشده

نیکخواه،مولود

مستند نام اشخاص تاييد نشده

Nikkhah,Molood

مستند نام اشخاص تاييد نشده

اوحدی، مینا

مستند نام اشخاص تاييد نشده

خرم خورشید، حمیدرضا

کشور

ایران

سازمان

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

نام ميزبان

2078t.pdf

شماره دسترسي

محرمانه

اطلاعات مختصر

محرمانه

تاريخ و ساعت مذاکره و دسترسي

2078t.pdf

بيت در ثانيه

3447145

ارتباط براي تسهيلات دسترسي

مرجع

نوع فرمت الکترونيکي

متن

اندازه فايل

0

شماره کنترل رکورد

۸۷۰۲پ

شماره فيلد فرمت مبدا

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی

فرمت انتشار

چاپی-الکترونیکی

نوع ماده

TF

پیشوند ISBD اعمال شده است

1

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y