عنوان

مطالعه عملکردی ئو تکاملی تکرارهای GTTT هسته مرکزی ژن CYTH4 انسانی

کد کشور

IR

شماره

۱۹۳۱پ

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

فارسی

کشور محل نشر

IR

عنوان اصلي

مطالعه عملکردی ئو تکاملی تکرارهای GTTT هسته مرکزی ژن CYTH4 انسانی

نام عام مواد

[پایان‌نامه]

عنوان اصلي به زبان ديگر

Functional and evolutionary analysis of the human CYTH4 core promoter GTTT repeat

نام ناشر، پخش کننده و غيره

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ۱۳۹۳

نام خاص و کميت اثر

۱۲۲ص

متن يادداشت

چاپی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

دکترا

نظم درجات

ژنتیک پزشکی Medical Genetic

زمان اعطا مدرک

۱۳۹۳/۱۲/۱۱

کسي که مدرک را اعطا کرده

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

متن يادداشت

تکامل متمایزSTR های (Short Tandem Repeat) پروموترمرکزی در گونه های پریمات نسبت به غیر پریمات ها، نقش گونه زایی این تکرارها را حمایت می کند .در واقع، STR ها می توانند کدهای تکاملی موثرتری در گونه زایی، نسبت به بلوک های نوکلئوتیدی DNA در توالی های غیر تکراری باشند .اخیرا ژن های انسانی گزارش گردیده اندکه، در توالی پروموتر مرکزیشان دارایSTR های به طور استثنایی طولانی بودند، که این تکرارها احتمالا مزیت تکاملی(Evolutionary advantage) به گونه های دارای آنها می دهند .یکی از این ژن ها سایتوهزین (CYTH4) 4است که دارای طولانی ترین تکرار 4 نوکلئوتیدی،7(GTTT) ، شناسایی شده در پروموتر مرکزی ژن های انسانی است .در این مطالعه، پروموتر این ژن در تمامی گونه های گزارش شده در سایت) Ensemble Genome Browser شامل 9 پریمات، 25 پستاندار غیرپریمات، 4 پرنده، 1 خزنده، 2 دوزیست و 8 ماهی(، غربالگری گردید .این مطالعه نشان داد که موتیف GTTT به طور استثنایی در پریمات ها از 4 تا 7 تکرار گسترش یافته است( p0.00001, df=1 ، .Fisher exact test) در میان پریمات ها ماکاک ( Macaque) دورترین تکرار را به ناحیه شروع رونویسی (TSS) دارد .دورترین تکرار در میان میمون های بزرگ (Hominidae) نسبت به TSS در اورانگوتان دیده شد، در حالیکه در گوریل و شامپانزه موقعیت تکرار یکسان است .طولانی ترین و نزدیکترین تکرار نسبت به TSS در انسان دیده شد .در مطالعه حاضر، پایینترین تکرار دیده شده در جمعیت مطالعه شده) شامل 495 نمونهDNA ی انسانی6 (، و بالاترین تکرار 9 موتیف بود .با استفاده از سیستمGlo - Dualی لوسی فراز در سلول های HEK293 به نقش مهار بیان ژنی این موتیف ها پی برده شد ( p0.0006 ،test). - tتفاوت معنی داری از نظر میزان بیان ژن در بالاترین و پایین ترین تکرار ( 6 و 9 تکرار ( p0.003) (مشاهده گردید، CYTH4 در ذخیره پروتئین و انتقالات غشایی درگیر است .پیشنهاد می شود که در طول تکامل کاهش بیان CYTH4 به واسطه وارد شدن تکرارهای GTTT در توالی پروموتری این ژن، بتواند در تکامل پریمات ها نقش داشته باشد . معنی داری از نظر میزان بیان ژن در بالاترین و پایین ترین تکرار ( 6 و 9 تکرار ( p0.003) (مشاهده گردید، CYTH4 در ذخیره پروتئین و انتقالات غشایی درگیر است .پیشنهاد می شود که در طول تکامل کاهش بیان CYTH4 به واسطه وارد شدن تکرارهای GTTT در توالی پروموتری این ژن، بتواند در تکامل پریمات ها نقش داشته باشد .

متن يادداشت

Abstract Differential evolution of core promoter short tandem repeats (STRs) in primates vs. nonprimates supports a role for STRs in primate speciation. Indeed, STRs may provide more efficient evolutionary codes for speciation than the quaternary codes provides by DNA nucleotide blocks in non-repetitive DNA sequences. Recent studies unravel human genes that are exceptionally rich in long STRs in their core promoter, and may be of adaptive evolutionary advantage in this species. One of those genes, cytohesin 4 (CYTH4), contains the longest tetra-nucleotide repeat, (GTTT)7, identified in a human gene core promoter. In the current study, The promoter of this gene in six major orders across vertebrates was screened, including primates (N=9), non-primate mammals (N=25), birds (N=4), reptiles (N=1), amphibians (N=2), and fish (N=8). We found that the GTTT motif has been exceptionally expanded in primates, ranging from 4- to 7-repeats (Fishers exact test, p<0.00001, df=1). Across primates, Macaca mulatta (macaque) monkey had the farthest GTTTrepeat to the +1 transcription start site (TSS). Within apes, Pongo abelii (orangutan) had the farthest GTTT-repeat to the +1 TSS, whereas in Gorilla gorilla gorilla (gorilla) and Pan troglodytes (chimpanzee), the location of the repeats was identical, and in H. sapiens, the GTTT repeat was nearest to the +1 TSS. In a population of 495 unrelated humans, the minimum length of GTTT-repeat was at 6-repeats, and the maximum length at 9- repeat. Using luciferase Dual-Glo system in HEK=293 cells, we found that the GTTT-repeat significantly down-regulated gene expression, per se (p<0.0006, ttest). A significant trend was observed for expression repression from 6 toward 9 repeat allele (p0.003). CYTH4 is involved in the regulation of protein sorting, and membrane trafficking. We propose that, at the crossroads of evolution, down-regulation of CYTH4, mediated by the core promoter GTTT-repeats, may have contributed to the emergence and evolution of the primate order. Keywords: CYTH4 ; promoter ; STR ; GTTT ; HEK293 ; TSS

خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه

ba

عنوان اصلي به زبان ديگر

Functional and evolutionary analysis of the human CYTH4 core promoter GTTT repeat

موضوع مستند نشده

CYTH4

متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی

۴CYTH

متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی

CYTH4

مستند نام اشخاص تاييد نشده

رضازاده، مریم

مستند نام اشخاص تاييد نشده

Rezazadeh,Maryam

مستند نام اشخاص تاييد نشده

اوحدی، مینا

مستند نام اشخاص تاييد نشده

خرم خورشید، حمیدرضا

کشور

ایران

سازمان

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

نام ميزبان

1931.pdf

شماره دسترسي

محرمانه

اطلاعات مختصر

محرمانه

تاريخ و ساعت مذاکره و دسترسي

1931.pdf

بيت در ثانيه

4293747

ارتباط براي تسهيلات دسترسي

مرجع

نوع فرمت الکترونيکي

متن

اندازه فايل

0

شماره کنترل رکورد

۱۳۹۱پ

شماره فيلد فرمت مبدا

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی

فرمت انتشار

چاپی-الکترونیکی

نوع ماده

TF

پیشوند ISBD اعمال شده است

1

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y