عنوان

Identification of mutations and single nucleotide polymorphisms of BRACA1, BRACA2 and mir-146 genes in breast cancer patients

شماره

T26064

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

انگلیسی

عنوان اصلي

Identification of mutations and single nucleotide polymorphisms of BRACA1, BRACA2 and mir-146 genes in breast cancer patients

نام عام مواد

Dissertation

نام نخستين پديدآور

Thulfiqar Nidhal Mutar Almarjanee

نام ناشر، پخش کننده و غيره

Natural Sciences _ Department of Plant Sciences

تاریخ نشرو بخش و غیره

1400

نام خاص و کميت اثر

81p.

ساير جزييات

cd

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

M.S.

نظم درجات

field of Cellular and Molecular Biology

زمان اعطا مدرک

1400/11/17

متن يادداشت

Abstract About 5–10% of all breast cancers are estimated to arise from hereditary predisposition. Recent large-scale mutation analyses indicate that, in most populations, only _30 to 60% of familial breast cancers are attributable to mutations in either BRCA1 or BRCA2, the two currently known major breast cancer predisposing genes. Therefore, in a substantial fraction of patients, other, still unidentified, factors are probably responsible for the increased familial risk. Among these genes, recent evidence point at pre-microRNA (pre-miRNA) genes as possible candidates. In fact, it has been shown that miRNAs play an important role in cancer development by modulating the expression of both oncogenes and tumor suppressor genes. We focus our attention on miRNAs, miR-146a, BRCA1and BRCA2 and their localization on chromosome regions commonly deleted in those tumors. The analysis was performed on 60 breast cancer in population of Najaf city. Genomic DNA was extracted from peripheral blood samples by using standard high-salt extraction. Screening for mutations in the BRCA1, BRCA2 and miR-146a genes will carried out by polymerase chain reaction (PCR)-direct sequencing. Primer sequences and PCR conditions were designed with gene runner software.Tetra ARMS-PCR method was an efficient detection for genotyping of (BRCA1 c.4132G>A) and (BRCA2 c.1385A>). No sufficient proof to conclude that BRCA1 and BRCA2 mutation happens at a lower frequency in Iraq, compared to the rest of the world. Tetra ARMS-PCR method is a simple rapid and a cost-effective molecular technique that could be used for the detection miR-146a gene rs2910164 C/G polymorphisms.The study included 120 participants, including 60 patients and 60 controls, and the mutation was detected by Tetra ARMS_PCR for the BRAC1 gene, BRAC2MiR_146a rs2910164C/G, and the result was normal for the GG allele of 100% for both patients and the control group for the BRAC1 gene, which means that they It does not differ from the rest of the results in previous research for breast cancer patients in countries of the world.As for the BRAC2 gene, the result showed the percentage of the control GG allele (0%), and for the patients, it was 5 (8.3%) for the A/G allele of the 60 control (100%). As for patients, it reached 55 (91.7%), where the results showed that there is a difference for the residents of Najaf with breast cancer from previous studies in other cities or countries in the world.As for the MiR_146a rs2910164C/G polymorphism, the genotype frequencies of GG patients were 40.40%, GC 48.3% and CC11. 7% and control had GG 13.3%, GC 51.7%, CC 35%. Where the results showed that there is a big difference for the population of the city of Najaf from other cities or countries of the world, as in previous studies.As for age, the results showed that the infection rate for women under the age of 40 was (n = 11) 11.7%, while the infection rate for women over 40 years (n = 53) was 88.3%.The crp analysis was done for all participants, 60 controls and 60 patients, and it appeared in the control at normal levels, and the mean of the analysis was = 2.7650 mg/L. In the patients, the results of the analysis appeared very high, and the average for the analysis of crp = 94.6617 mg/L, p value *0.00. Noting that the normal value is less than 10 mg/L. The ESR test was conducted for the participants, 60 controls and 60 patients, and the control ratios were normal, where the average was equal to = 17.8583 ml/h. As for the patients, it was very high, where the average = 93.7167 ml/h, and the p-value was = 0.212, noting that the normal percentage of the ESR analysis is less than 20 ml/h.

متن يادداشت

تخمین زده می شود که حدود 5 تا 10 درصد از تمام سرطان های سینه از استعداد ارثی ناشی می شوند. تجزیه و تحلیل‌های اخیر جهش در مقیاس بزرگ نشان می‌دهد که در اکثر جمعیت‌ها، تنها 30 تا 60 درصد سرطان‌های پستان خانوادگی به جهش در BRCA1 یا BRCA2، دو ژن مستعد کننده اصلی سرطان پستان در حال حاضر، نسبت داده می‌شوند. بنابراین، در بخش قابل توجهی از بیماران، عوامل دیگری که هنوز شناسایی نشده اند احتمالاً مسئول افزایش خطر خانوادگی هستند. در میان این ژن‌ها، شواهد اخیر به ژن‌های pre-microRNA (pre-miRNA) به عنوان کاندیدای احتمالی اشاره می‌کنند. در واقع، نشان داده شده است که miRNA ها با تعدیل بیان هر دو انکوژن و ژن های سرکوبگر تومور، نقش مهمی در توسعه سرطان دارند. ما توجه خود را بر روی miRNA ها، miR-146a، BRCA1 و BRCA2 و محلی سازی آنها در مناطق کروموزومی که معمولاً در آن تومورها حذف می شوند، متمرکز می کنیم. تجزیه و تحلیل بر روی 60 سرطان پستان در جمعیت شهر نجف انجام شد. DNA ژنومی از نمونه های خون محیطی با استفاده از استخراج استاندارد با نمک بالا استخراج شد. غربالگری جهش در ژن‌های BRCA1، BRCA2 و miR-146a با توالی‌یابی مستقیم واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) انجام می‌شود. توالی های پرایمر و شرایط PCR با نرم افزار gene runner طراحی شدند.روش Tetra ARMS-PCR یک تشخیص کارآمد برای تعیین ژنوتیپ (BRCA1 c.4132G>A) و (BRCA2 c.1385A>) بود.هیچ مدرک کافی برای این نتیجه گیری وجود ندارد که جهش BRCA1 و BRCA2 با فرکانس کمتری در عراق نسبت به سایر نقاط جهان اتفاق می افتد.روش Tetra ARMS-PCR یک تکنیک مولکولی ساده و سریع و مقرون به صرفه است که می تواند برای تشخیص پلی مورفیسم های ژن miR-146a rs2910164 C/G استفاده شود.این مطالعه شامل 120 شرکت‌کننده، از جمله 60 بیمار و 60 گروه کنترل بود، و جهش توسط Tetra ARMS_PCR برای ژن BRAC1، BRAC2MiR_146a rs2910164C/G شناسایی شد و نتیجه برای آلل GG 100% برای هر دو بیمار و گروه کنترل طبیعی بود. برای ژن BRAC1، به این معنی که آنها با بقیه نتایج تحقیقات قبلی برای بیماران مبتلا به سرطان سینه در کشورهای جهان تفاوتی ندارد. در مورد ژن BRAC2، نتیجه درصد آلل GG کنترل (0%) و برای بیماران 5 (8.3%) برای آلل A/G 60 شاهد (100%) بود. در مورد بیماران به 55 نفر (91.7 درصد) رسید که نتایج نشان داد که برای ساکنین نجف مبتلا به سرطان سینه با مطالعات قبلی در سایر شهرها یا کشورهای جهان تفاوت وجود دارد.در مورد پلی مورفیسم MiR_146a rs2910164C/G، فراوانی ژنوتیپ بیماران GG 40.40٪، GC 48.3٪ و CC11 بود. 7% و شاهد GG 13.3%، GC 51.7%، CC 35% داشتند. جایی که نتایج نشان داد که جمعیت شهر نجف با سایر شهرها یا کشورهای جهان مانند مطالعات قبلی تفاوت زیادی دارد.در مورد سن، نتایج نشان داد که میزان آلودگی برای زنان زیر 40 سال (11 نفر) 11.7٪ بود، در حالی که میزان عفونت برای زنان بالای 40 سال (n = 53) 88.3٪ بود.آنالیز crp برای همه شرکت‌کنندگان، 60 گروه کنترل و 60 بیمار انجام شد و در گروه شاهد در سطوح نرمال ظاهر شد و میانگین آنالیز 2.7650 میلی‌گرم در لیتر بود. در بیماران، نتایج تجزیه و تحلیل بسیار بالا به نظر می رسد و میانگین برای آنالیز crp = 94.6617 میلی گرم در لیتر، مقدار p * 0.00. با توجه به اینکه مقدار نرمال کمتر از 10 میلی گرم در لیتر است.آزمون ESR برای شرکت کنندگان، 60 گروه کنترل و 60 بیمار انجام شد و نسبت کنترل نرمال بود که میانگین آن برابر با 17.8583 میلی لیتر در ساعت بود. در مورد بیماران، بسیار بالا بود، جایی که میانگین = 93.7167 میلی لیتر در ساعت، و p-value = 0.212 بود، با توجه به اینکه درصد نرمال آنالیز ESR کمتر از 20 میلی لیتر در ساعت است.

عنوان گونه گون

شناسایی موتاسیون و پلی مورفیسم تك نوکلئوتیدی ژن های BRACA1, BRACA2 و mir-146 در بیماران مبتلا به سرطان سینه

اصطلاح موضوعی

Breast cancer, DNA polymorphism, mutation, miRNA, PCR

اصطلاح موضوعی

سرطان سینه، پلی مورفیسم DNA، جهش، miRNA، PCR

عنصر شناسه اي

Nidhal Mutar Almarjanee,

ساير عناصر نام

Thulfiqar

کد نقش

Producer

عنصر شناسه اي

Razeghi,

عنصر شناسه اي

Aldujaili,

ساير عناصر نام

Jafar

ساير عناصر نام

Nawfal

کد نقش

Thesis advisor

کد نقش

Consulting advisor

عنصر شناسه اي

Tabriz

کشور

ایران

سازمان

central library tabriz

تاريخ عمليات

20220612

شماره بازیابی

ارشد پایاننامه QK371.A5 1400

نام الکترونيکي

Thulfiqar Nidhal Mutar Almarjanee

ارتباط براي تسهيلات دسترسي

قاسمی

فرمت انتشار

e

نوع ماده

TL

کد کاربرگه

276903

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y