بررسی میزان مقاومت به ایمی پنم و توزیع کارباپنماز های مختلف در جدایه های بالینی اشریشیا کلی
نام نخستين پديدآور
سمانه برموده
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
۱۴۰۱
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۹۷ص.
مواد همراه اثر
سی دی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
میکروبیولوژی گرایش میکروب های بیماری زا
زمان اعطا مدرک
۱۴۰۱/۰۶/۲۹
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
ظهور انتروباکتریاسه مقاوم به کارباپنم به دلیل گزینه های درمانی محدود همچنان سلامت عمومی را تهدید میکند. در مطالعه حاضر، فراوانی مقاومت به کارباپنم در بین 104 جدایه بالینی اشریشیا کلی و ویژگی های ژنومی جدایه های مقاوم به کارباپنم مورد بررسی قرار گرفت.حساسیت به ایمی پنم، تایگی سایکلین، و کولیستین به روش broth dilution بررسی شد. حساسیت به سایر گروه های ترکیبات ضد میکروبی با استفاده از تست انتشار از دیسک مورد بررسی قرار گرفت. حضور ژنهای کارباپنماز blaOXA-48، blaKPC، blaNDM و blaVIM با روش PCR بررسی شد. ویژگی های مولکولی جدایه های مقاوم به کارباپنم با توالی یابی کل ژنوم مورد مطالعه قرار گرفت.در چهار جدایه(3.8%) کمترین غلظت بازدارنده ایمی پنم برابر یا بیشتر از 32 میلیگرم در لیتر بود که به عنوان E. coli مقاوم به کارباپنم طبقه بندی شدند. تایگی سایکلین، نیتروفورانتئین، فسفومایسین و کولیستین فعالترین عوامل در برابر تمامی جدایه های مورد مطالعه بودند (میزان حساسیت کل به ترتیب 100، 99، 96 و 99 درصد) که 3 ترکیب اول به عنوان فعالترین ترکیبات ضد میکروبی علیه جدایه های مقاوم به کارباپنم مشخص شدند (میزان حساسیت 100 درصد). با توجه به تجزیه و تحلیل مبتنی بر Multilocus Sequence Type (MLST) ، 4 جدایه مقاوم به کارباپنم به ST167 (n=2)، ST361 (n=1) و ST648 (n=1) تعلق یافتند. آنزیم NDM (NDM-1, NMD-5) به عنوان شایع ترین ژن کارباپنماز مشخص شد که در تمام جدایه های مقاوم به کارباپنم شناسایی شد و NDM-5 به عنوان رایج ترین واریانت از این گروه از متالوبتالاکتامازها شناسایی شد. در یک ایزوله مقاوم به کارباپنم دو انزیم کارباپنماز OXA-181 و NDM-5 تواما شناسایی شد. تمام جدایه های مقاوم به کارباپنم دارای بتالاکتامازهای وسیع الطیف (ESBL) دیگر از جمله CTX-M-15، CMY-145 و TEM-1 بودند. در دو جدایه متعلق به ST167 و ST648 کارباپنماز نوع NDM و 16S rRNA متیل ترانسفراز RmtB و RmtC تواما یافت شدند. در یک سویه مقاوم به کولیستین وکارباپنم که فاقد ژن مقاومت به کولیستین پلاسمیدی mcr بود، جایگزینیهای آمینو اسیدی مختلفی در پروتئینهای PmrB و PhoPQ مشاهده شد.در نهایت نتایج بررسی ها در این تحقیق نشان داد که حدود 9/1 درصد از جدایه های E. coli مورد مطالعه در این تحقیق به کارباپنم ها، کولیستین و/یا آمینوگلیکوزیدها مقاوم بودند که نگرانی هایی را در مورد شیوع عفونت های مقاوم به اکثر انتی بیوتیک ها توسط این ابر میکروب های نوظهور در آینده ایجاد می کند.
متن يادداشت
Abstract:The emergence of carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) continues to threaten public health due to limited therapeutic options. In the current study the incidence of carbapenem resistance among the 104 clinical isolates of Escherichia coli and the genomic features of carbapenem resistant isolates were investigated.The susceptibility to imipenem, tigecycline and colistin was tested by broth dilution method. Susceptibility to other classes of antimicrobials was examined by disk diffusion test. The presence of blaOXA-48, blaKPC, blaNDM, and blaVIM carbapenemase genes was examined by PCR. Molecular characteristics of carbapenem resistant isolates were further studied by whole-genome sequencing.Four isolates (3.8%) revealed imipenem MIC of ≥32mg/l and categorized as carbapenem resistant E. coli (CREC). Tigecycline, nitrofurantoin, fosfomycin, and colistin were the most active agents against all isolates (total susceptibility rate of 100%, 99%, 96% and 99% respectively) with the first 3 compounds being found as the most active antimicrobials for carbapenem resistant isolates (susceptibility rate of 100%). According to Multilocus Sequence Type (MLST) analysis the 4 CREC isolates belonged to ST167 (n=2), ST361 (n=1) and ST648 (n=1). NDM (NDM-1 and NMD-5) was the most frequent carbapenemase gene detected in all CREC isolates with NDM-5 being the most commonly found variant. The OXA-181 variant was detected in one CREC isolate co-harboring NDM-5 carbapenemase. All CREC isolates carried other ESBLs including CTX-M-15, CMY-145 and TEM-1. Co-occurrence of NDM-type carbapenemase and 16S rRNA methytrnsferase RmtB and RmtC was found in two isolates belonging to ST167 and ST648. A colistin-carbapenem resistant isolate which was mcr-negative, revealed various amino acid substitutions in PmrB and PhoPQ proteins. A ca. of 1.9 % of E. coli isolates studied here were resistant to carbapenems, colistin and/or aminoglycosides which raises the concern about the impossible-to-treat infection outbreaks by these emerging superbugs in the future.
عنوانهای گونه گون دیگر
عنوان گونه گون
Evaluating the imipenem resistance rate and distribution of different carbapenemases among clinical isolates of Escherichia coli
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )