بررسی ژنتیکی ۶ خانواده با سابقه ابتلای رتینیت پیگمنتوزا غیر سندرومی با توارث اتوزومی مغلوب به روش توالی یابی اگزوم
نام عام مواد
[پایان نامه]
نام نخستين پديدآور
شمسی صفری
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
تاریخ نشرو بخش و غیره
۱۳۹۹
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۱۲۱ص.
ساير جزييات
جدول،نمودار
مواد همراه اثر
سی دی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دکتری تخصصی PHD
نظم درجات
ژنتیک پزشکی
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۹/۰۲/۱۶
امتياز متن
۱۹/۹
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
مقدمه و هدف: رتينيت پيگمنتوزا (RP) يك مجموعه هتروژن از رتينوپاتي های توارثی با ژن ها و جهش های بيماريزای بسيار و علائم بالينی متغير است. پيشرفت در يافتن درمان های مؤثر و پيشگيری از بروز بيماری در افراد ديگر خانواده، وابسته به شناسايی ژن ها و جهش های ايجاد كننده اين بيماری است؛ كه شامل يافتن ژن عامل بيماری و غربالگری جهش ها در افراد و خانواده های درگير مي شود. در ایران با توجه به نرخ بالای ازدواج های خویشاوندی، پیش بینی می شود که اکثر موارد RP غیر سندرمی، به صورت مغلوب و با والدین ناقل آلل معیوب همراه باشند. پيشرفت های قابل توجهی كه در سالهای اخير در راستای شناسايی ژن ها و آلل های دخیل در بیماری زایی RP بوجود آمده، که عمدتا در نتيجه توسعه تکنیک های نقشه برداری و فناوری توالی يابی در مقياس انبوه بوده است کمک شایانی به شناسایی و توسعه ژنها و جهش های دخیل در بیماری زایی رتینیت پیگمنتوزا داشته است. با توجه به مطالب عنوان شده و ضرورت بررسی های دقیق تر و جامع تر، ما با به کارگیری تکنیک توالی یابی کل اگزوم، ژن های عامل بیماری RP را در 6 خانواده ایرانی با تشخیص بالینی RP غیر سندرمی و با توارث احتمالی اتوزومی مغلوب، شناسایی نمودیم. روش اجرا:1. انتخاب 6 خانواده كه دارای فرد مبتلا به رتینیت پیگمنتوزا مي باشند 2. انجام معاینات بالینی و فیزیکی 3. انجام مشاوره ژنتیک 4. آگاهی های لازم به خانواده های واجد شرایط جهت تصمیم گیری آگاهانه در زمینه مشارکت 5. نمونه گیری از فرد مبتلا و والدین و خواهران و برادران فرد مبتلا صورت گرفت.6. استخراج DNA .7. بررسی Whole exome در یک فرد مبتلا از هر خانواده به منظور تعیین واریانت های ژنی کاندید 8. سپس بررسی های بیو انفورماتیک 9. توالی یابی سنگر10. همچنین متناسب با واریانت یافت شده در خانواده RP04 مطالعه عملکردی صورت گرفت.یافته ها: دو خانواده RP01 و RP02 با جهش های متفاوت در ژن یکسان RPE65 معرفی شدند که تولید پروتئین را متاثر کرده و فنوتیپ را به صورت شدید و مادرزادی بروز می دهند. در خصوص خانواده RP03 ما به واریانت جدیدی در ژن شناخته شدهALMS1 رسیدیم که با نتیجه جالب توجهی مواجه شدیم که برخلاف موارد کلاسیک سندرم آلستروم که جهش های این ژن مسبب آن است ما در پروباند این خانواده با جهش در این ژن صرفا درگیری چشمی(RP) را داشتیم و هیچ درگیری دیگری در سایر ارگان ها وجود نداشت که تفسیر نتایج آن به تفصیل در فصل 5 آورده شده. در خانوادهRP04 دو جهش بیماریزا دیده شد که یکی از جهش های شناسایی شده در این خانواده در یکی از ژن های مرتبط با RP بوده که قبلا شناخته شده و به خوبی در بخشی از شجره با فنوتایپ همراهی نشان داده است. از طرفی در قسمت دیگری از این شجره جهش پیدا شده با فنوتیپ RP همراهی نشان نمی داد که در بررسی های بیشتری که در این مطالعه انجام شد ردپای ژن دیگری که ژن جدیدی است که اخیرا گزارش شده دیده شد در ادامه نیز بر روی ژن یافت شده در این خانواده مطالعه عملکردی انجام دادیم. در ارتباط با خانواده RP05 و RP06 به دو واریانت جدید در ژن شناخته شده و مهم EYS رسیدیم. نتایج: نتایج حاصل از این مطالعه، با توجه به شناسایی واریانت های جدید عامل بیماری در خانواده های مورد مطالعه، بیانگر پتانسیل بسیار زیاد روش توالی یابی کل اگزوم در زمینه کشف ژن های عامل بیماری و همچنین کشف ژن های جدید به ویژه در میان خانواده هایی با ازدواج خویشاوندی است. این امر کمک بسیار نتیجه بخشی به تشخیص بیماری و پیشگیری از بروز موارد جدید در خانواده ها، مشاوره ژنتیک هدفمند به خانواده های درگیر و کمک شایانی نیز به ارتقای سلامت جامعه و کاهش هزینه های درمانی خواهد کرد.
موضوع (اسم عام یاعبارت اسمی عام)
عنصر شناسه ای
خویشاوندی
عنصر شناسه ای
Kinship
عنصر شناسه ای
<القرابة=قرابة>
داده رابط بین فیلدها
a10
داده رابط بین فیلدها
a10
داده رابط بین فیلدها
a10
موضوع مستند نشده
رتينيت پيگمنتوزا
موضوع مستند نشده
غير سندرمی
موضوع مستند نشده
توالی یابی کامل اگزوم (WES)
موضوع مستند نشده
توالی یابی سنگر
موضوع مستند نشده
توارث اتوزومی مغلوب
موضوع مستند نشده
Retinitis Pigmentosa
موضوع مستند نشده
Non-syndromic
موضوع مستند نشده
Autosomal Recessive
موضوع مستند نشده
Whole Exome Sequencing
موضوع مستند نشده
Iranian population
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )