بررسی ارتباط بین پلی¬مورفیسم¬هاي ژن (rs2013162 , rs2235375) IRF6 و همراهی اطلاعات دموگرافیکی (سن، جنس، مصرف اسید فولیک) باشکاف لب و کام غیرسندرومی در جمعیت ایرانی
General Material Designation
[پایان نامه]
Parallel Title Proper
Association study between IRF6 gene polymorphisms (rs2013162, rs2235375) and demographic charateris including gender, age and consumption of Folic acid with non-syndromic cleft lip and palate in Iranian populationa
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۳۹۷
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
ی ,۱۲۵ص.
GENERAL NOTES
Text of Note
پبوست
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
ژنتيك انساني Humans Genetics
Date of degree
۱۳۹۷/۰۷/۱۰
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
شکاف¬های دهانی- صورتی از شایع¬ترین ناهنجاری¬های مادرزادی ناحیه صورت هستند. این ناهنجاری در اثر نقص در مراحل تکامل جنینی ایجاد می¬شود که به دو دسته شکاف لب وکام سندرومی و غیرسندرومی تقسیم می-شوند. شکاف لب و کام دارای سبب شناسی چند عاملی می¬باشند، بدین معنی که فاکتورهای محیطی و ژن¬های متعددی در ایجاد آن دخیل¬¬اندکه از جمله فاکتور ژنتیکی آن می¬توان به ژنIRF6 اشاره و ازجمله فاکتورهای محیطی می¬توان به مصرف اسید فولیک توسط مادران و کشیدن سیگار والدین در زمان بارداری اشاره کرد. در این مطالعه همراهی دو پلی¬مورفیسم تک نوکلئوتیدی rs2013162 و rs2235375 از ژن IRF6با بروز شکاف لب و کام غیرسندرومی در جمعیت ایرانی بررسی می¬گردد. علاوه براین ارتباط مصرف اسید فولیک مادران و استعمال سیگار والدین با بروز شکاف لب و کام غیرسندرومی نیز مدنظر قرار گرفته است. روش پژوهشنمونه¬¬ها شامل 105 کودک مبتلا به شکاف لب و کام غیرسندرومی و200 کودک سالم به عنوان کنترل برای ارزیابی پلی¬مورفیسم¬های عنوان شده ژن IRF6 می¬باشد. تعیین ژنوتیپ با روش PCR- RFLP و الکتروفورز بر روی ژل پلی -آکریل¬آمید8% صورت گرفت. نتایجدر مورد پلی¬مورفیسم rs2013162 اگرچه تفاوت معنی¬داری در بررسی آللی مشاهده نشد (P =0.98 )، بین ژنوتیپ-های هموزیگوت واریانت (AA) و هتروزیگوت (CA) درگروه مبتلایان به شکاف لب و کام غیرسندرومی و گروه کنترل سالم، ارتباط معنی داری مشاهده شد (به ترتیب، P = 0.018و P = 0.004). در واقع این ارتباط در مورد ژنوتیپ هموزیگوت ورینت (AA) سبب افزایش احتمال خطرابتلای این نقص (OR = 2.36) ولی در مورد ژنوتیپ هتروزیگوت این ارتباط در جهت مخالف و به صورت کاهش خطر بروز شکاف لب و کام غیرسندرومی مشاهده گردید (OR = 0.47). در مورد پلی مورفیسم rs2235375 ، در حالت آللی تفاوت معنی¬داری مشاهده شد (P = 0.04). آلل واریانت G توزیع قابل توجهی در گروه افراد با شکاف لب و کام غیرسندرومی نسبت به گروه سالم نشان داد. در واقع ژنوتیپ هموزیگوت GG فرکانس بالاتری در گروه مبتلایان به شکاف لب و کام غیرسندرومی نسبت به گروه سالم داشت (P = 0.04) که بیانگر افزایش ریسک ابتلا به شکاف لب و کام غیرسندرمی در حضور آلل واریانت G می¬باشد (OR = 2.36).دیده شد که مصرف اسید فولیک توسط مادران در زمان بارداری می¬تواند عامل محافظتی قوی در ابتلاء فرزند به شکاف دهانی باشد (P < 0.001). علاوه براین ریسک ابتلا به شکاف لب و کام غیرسندرومی در بارداری والدین با سابقه مصرف سیگار و ازدواج فامیلی افزایش قابل توجه دارد (P < 0.001) .بحث و نتیجه¬گیریپلی¬مورفیسم¬های rs2013162 و rs2235375 ژن IR6 با افزایش ریسک ابتلا به شکاف لب وکام غیرسندرومی همراه بوده و عدم مصرف اسید¬فولیک مادردان قبل از شروع و اوایل بارداری و استعمال دخانیات والدین می¬¬توانند این افزایش ریسک ابتلا به شکاف لب و کام غیرسندرومی را همراهی یا تشدید نمایند. مطالعه حاضر و مطالعات آینده در جهت روشن¬تر شدن نقش ژنتیک در سبب شناسی شکاف لب و کام غیرسندرومی بوده و پس از تایید نتایج این مطالعات، می¬تواند در مشاوره ژنتیک قبل بارداری و در جهت کاهش ریسک ابتلا به شکاف لب و کام غیرسندرومی کمک کننده باشد. واژه¬های کلیدی: پلی¬مورفیسم،IRF6 ، شکاف دهانی-صورتی، شکاف لب و کام غیرسندرومی
Text of Note
Introduction:Orofacial clefts, including cleft lip with or without cleft palate (CL/CP), are one of the most common congenital anomalies in human arising from defects in the stages of embryonic development. Based upon involvement of the other organs, CL/CP can divided into two forms of syndromic and non-syndromic. The cleft lip and palate have a multifactorial etiology, which means environmental and genetic factors are involved. One of the genetic factors is the IRF6 gene, which is a member of the interferon regulating family of IRFs. In this study, We aimed to analyze the association between two common polymorphism of IRF6 (rs2013162 and rs2235375) and non-syndromic CL/CP in Iranian population. In addition, the relationship between consumption of maternal folic acid and parental smoking with the incidence of non-syndromic CL/CP is also considered.Material and methods:We recruited a cohort of 105 non-syndromic CL/CP and compared the result with 200 normal controls to analyze the selected polymorphism. Genotyping was done using PCR-RFLP and Sanger sequencing confirmed the results randomly.Results:For rs2013162, although we didn’t have different allele distribution among our patient and controls (P =0.98), there was a significant correlation between homozygous variant (AA) and heterozygote (CA) genotypes in the group of non-syndromic CL/CP and healthy control group, P = 0.018 and P = 0.004, respectively. In fact, homozygosity for the variant (AA) increases the risk of non-syndromic CL/CP, (OR = 2.36), but in the heterozygote genotype (CA), this relation was observed in the opposite direction and as a protective against the risk of occurrence, (OR = 0.47).About the rs2235375, there was a significant difference between distribution of allelic variants among the group with non-syndromic CL/CP compared to healthy group (P = 0.04). In fact, GG genotype was higher in non-syndromic CL/CP group (P = 0.04), indicating increased risk of non-syndromic CL/CP in the presence of G allelic allele (OR = 2.36). Considering the environmental factors, compared with healthy group, in children with non-syndromic CL/CP and mothers who did not mention the history of acid-folic supplementation during pregnancy, it was found that folic acid consumption can be a strong protective factor for normal development of oral cavity (P <0.001). In addition, there was a significant increase in the risk of non-syndromic CL/CP in pregnant women with a history of smoking and familial marriage (P < 0.001).Conclusion:Regarding the results mentioned above, IRF6 gene polymorphisms (rs2013162 and rs2235375) are associated with an increased risk of non-syndromic CL/CP and the lack of mothers' folic acid consumption before and during the pregnancy and the parental smoking can exacerbate this risk noticeably. Based upon the multifactorial inheritance of non-syndromic CL/CP the risk of reoccurrence risk is calculated based on the empirical risk. This study and future studies in this line are necessary to clarify the role of genetics in the etiology of the non-syndromic CL/CP. After verifying the result, it can be exploited in before and through pregnancy to reduce the reoccurrence risk of non-syndromic CL/CP. Key words: Polymorphisms; IRF6; Orofacial clefts; Non-syndromic cleft lip and palate; Folic acid