بررسی جمعیت ایرانی دچار جنون( سایکوز) وابسته به متامفتامین بهروش همراهی گسترد ژنوم
General Material Designation
[پایاننامه]
Parallel Title Proper
Genome Wide Association Study in an Iranian Population with Methamphetamine Induced Psychosis
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
علوم بهزیستی و توانبخشیUniversity of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۵
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
ج،۱۲۴ص.
GENERAL NOTES
Text of Note
پیوست
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
ژنتیک انسانی Genetics
Date of degree
۱۳۹۵/۱۲/۱۸
Body granting the degree
علوم بهزیستی و توانبخشیUniversity of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
مطالع همراهی گسترد ژنوم، تنوع ژنتیکی مرتبط با یک بیماری خاص را با مارکرهای مولکولی که کل ژنوم را پوشش میدهند، در بین تعداد زیادی از افراد پیدا میکند .در این مطالعات، تنوع ژنتیکی چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی به عنوان مارکر بررسی میشود .با مقایس فراوانی اللی و ژنوتیپی چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی در افراد سالم و بیمار، چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی مؤثر برروی بیماری شناسایی میشود .وقتی متامفتامین وارد بدن میشود باعث افزایش دوپامین میشود و علائمی چون توهمات، هذیانات و درنهایت سایکوز را در پی دارد .سایکوز وابسته به متامفتامین یک اختلال ژنتیکی پیچیده است که عوامل محیطی و ژنتیکی بر روی آن اثر میگذارد و نوع فارماکولوژیکی اسکیزوفرنی معرفی شده است .تاکنون ۲۱۳ پلیمورفیسم در ژنهای مختلف در ارتباط با این بیماری گزارش شده است .از این رو ما بر آن شدیم تا با استفاده از این مطالعات، چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی افراد دارای سایکوز وابسته به متامفتامین و افراد سالم را از نظر فرکانس اللی مورد مقایسه قرار دهیم .روش بررسی مطالع همراهی گسترد ژنوم برای شناسایی فرکانسهای اللی و ژنوتیپی برروی ۲۰۰ فرد ایرانی مبتلا به سایکوز وابسته به مت آمفتامین و جمعیت نرمال حاصل از پروژ ۱۰۰۰ ژنوم .یافتهها با استفاده از لیستی که از پلیمورفیسمهای مرتبط با سایکوز وابسته به متامفتامین در جمعیتهای دیگر گزارش شده بود توانستیم ۷۳ پلیمورفیسم مشابه در جمعیت خود پیدا کنیم و با مقایس MAF آنها با MAF جمعیت نرمال پایگاه داد ۱۰۰۰ ژنوم و حذف پلیمورفیسمهای با تفاوت MAF کمتر از ۱۰ ، به ۹ پلیمورفیسم مرتبط با این بیماری رسیدیم .نتیجهگیری با بررسی ۹ پلیمورفیسم با تفاوت MAF بیشتر از ۱۰ دریافتیم که این پلیمورفیسمها تفاوتهای قابل توجهی با یکدیگر دارند .دلیل این تفاوت زیاد میتواند دو مسئل قومیت و حجم نمونه باشد .همچنین با بررسی ژنهایی که این پلیمرفیسمها در آن قرار دارد دریافتیم که اکثر آنها با انتقالدهند عصبی دوپامین و گیرند دوپامین درارتباطند .کلیدواژهها :متامفتامین، دوپامین، پلیمورفیسم، فرکانس اللی حداقل (MAF) ، تعیین ژنوتیپ، سایکوز وابسته به متامفتامین، اسکیزوفرنی
Text of Note
Genome-wide association study (GWAS) is an approach that involves rapidly scanning markers across the complete sets of DNA, or genomes, of many people to find genetic variations associated with a particular and complex disease. In GWA study, single nucleotide polymorphism (SNPs) investigated as markers. By comparison allele and genotype frequencies of SNPs in cases and controls, significant SNPs related to disease will be identified. When methamphetamine enters to body, causes dopamine increase. Then symptoms like hallucination, delusions and finally psychosis appeared. Methamphetamine associated psychosis(MAP) is likely a complex genetic disease in which environmental factors interact with multiple polymorphic genes to influence susceptibility and pharmacologically it resembles to schizophrenia. Up to now 213 polymorphisms in different gene has been reported related this disorder. Hence, we decided to detect the allele and genotype frequencies of SNPs in an Iranian population using GWAS and compare the results in two groups; individuals with methamphetamine associated psychosis as cases and normal controls. Materials and Methods Genome-wide association study (GWAS) was used for identification of allele and genotype frequencies of SNPs in 200 individuals with MAP and normal Iranian population as well as the results of 1000 genome project. Results By using a list of SNPs related to MAP that have been reported from other population till now, we found 73 similar SNPs in our population. Finally 9 SNPs remained to be associated with MAP by comparison of Minor Allele Frequency (MAF) of these SNPs with normal population and ignoring of MAF difference less than 10 . Conclusion By studying 9 polymorphisms with MAF >10 , we found these polymorphisms have significant differences with each other. Ethnicity or samples volume could be reason of these differences. By investigating genes related to polymorphisms we got that most of them related to dopamine neurotransmitters and dopamine receptors. Keywords: Methamphetamine, Dopamine, Polymorphism, Minor Allele Frequency, Genotyping, Methamphetamine Associated Psychosis, Schizophrenia
ba
PARALLEL TITLE PROPER
Parallel Title
Genome Wide Association Study in an Iranian Population with Methamphetamine Induced Psychosis