عنوان

بازنگری موقعیت سیستماتیکی Salicornia europaea براساس توالی ژن matk

Number

پ۲۷۵۵۸

.Language of Text, Soundtrack etc

per

Title Proper

بازنگری موقعیت سیستماتیکی Salicornia europaea براساس توالی ژن matk

First Statement of Responsibility

گل‌آرا جعفري

Name of Publisher, Distributor, etc.

علوم طبیعی

Date of Publication, Distribution, etc.

۱۴۰۱

Specific Material Designation and Extent of Item

۵۹ص.

Accompanying Material

سی دی

Dissertation or thesis details and type of degree

کارشناسی ارشد

Discipline of degree

زیست شناسی گياهی گرایش سيستماتيك و بوم شناسی

Date of degree

۱۴۰۱/۰۶/۲۹

Text of Note

سرعت تکاملی بالا در حل روابط تکاملی در سطوح تاکسونومیکی در ژن matk بسیار کارآمد است. این ویژگی¬های منحصر به فرد باعث شده است که ژن matk در شناسایی گونه¬های گیاهی به عنوانDNA بارکد در نظر گرفته شود. از طرفی در بین گیاهان تنها ژن پلاستیدی هست که در پیرایش اینترون¬های گروه 2 نقش دارد و ناحیه¬ی mathurase را داراست. در این پژوهش نواحی DNA کلروپلاستی matk در گونه¬ی Salicornia europaea از تیره¬ی Chenopodiaceae که اخیرا به تیره¬ی Amarantaceae ملحق شده است، توالی¬یابی می¬شود. نکته بسیار مهم و حائز اهمیت در این تیره، تنوع ظاهری بسیار زیاد اعضای آن است و تشخیص گونه¬ها از طریق فنوتیپی میسر نیست. استفاده از آنالیز توالی نوکلئوتیدی ژن¬ها، می¬تواند رده¬بندی مبتنی بر مورفولوژی را بازنگری کند. در این پژوهش جنس¬ها و گونه¬های خواهر و بسیار خویشاوند سالیکورنیا با استفاده از ژن matk بازبینی شده است. که 6 گونه از جنس Salicornia به عنوان درون گروه و 2 گونه از جنس Salsola به عنوان برون گروه از سایت NCBI اخذو با استفاده از متد های Maximum parsimony ،Distance و Neighbor-joiningو با توالی حاصل از ژن های Its و rbcl آنالیز گردید . نتایج آنالیز حاضر نشان داد که گونه Slicornia europaea با سایر گونه های انتخاب شده بر اساس matk و rbcl فاصله ژنتیکی برابر صفر نشان می دهد و دارای بیشترین فاصله ژنتیکی با دو گونه Slsola kali و Salsola tragus می با شد و بر اساس ژن Its کمترین فاصله را با سه گونه ی S.maritima ، S.ramosissima و S.pusilla برابر 003/0 و بیشترین فاصله را با Salsola kali به اندازه 54/0 دارد. سالیکورنیا گیاهی دو یا چند ساله، هالوفیت، بوته¬ای هست.

Text of Note

High evolutionary speed is very efficient in resolving evolutionary relationships at taxonomic levels in the matk gene. These unique features have made the matk gene to be considered as a DNA barcode in the identification of plant species. On the other hand, there is only one plastid gene among plants that plays a role in splicing group 2 introns and has the mathurase region. In this research, matk chloroplast DNA regions in Salicornia europaea species from the Chenopodiaceae family are sequenced which recently joined the Amarantaceae family. A very important point in this family is high variety of appearance of its members and it is not possible to distinguish the species through phenotypic. The use of nucleotide sequence analysis of genes can revise the classification based on morphology. In this research, the closely related genera and species of Salicornia have been investigated using the matk gene. Six species of the genus Salicornia as in-group and two species of genus Salsola as out-group were obtained from the NCBI site and analyzed using Maximum parsimony, Distance and Neighbor-joining methods and the sequence of Its and rbcl genes. The results of the analysis showed that the species Slicornia europaea have zero genetic distance with other selected species based on matk and rbcl and it has the highest genetic distance with the two species Slsola kali and Salsola tragus and the lowest distance based on Its gene with the three species of S.maritima, S.ramosissima and S.pusilla equal to 0.003 and the biggest distance with Salsola kali is 0.54. Salicornia is a shrub halophyte biennial and perennial plant

Variant Title

A systematic revision of Salicornia europaea based on the matk gene sequencing

Entry Element

‏‏جعفري،

Part of Name Other than Entry Element

گل‌آرا

Relator Code

تهیه کننده

Entry Element

‏‏نصرتي،

Entry Element

حسین پور فیضی،

Part of Name Other than Entry Element

هوشنگ

Part of Name Other than Entry Element

محمد علی

Dates

استاد راهنما

Dates

استاد مشاور

Entry Element

‏ تبریز