تعیین جنسیت مولکولی پرندگان زینتی با استفاده از PCR
First Statement of Responsibility
مسعود پیروی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
دامپزشکی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۴۰۱
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۵۵ص.
Accompanying Material
سی دی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
بیوشیمی گرايش بالینی
Date of degree
۱۴۰۱/۰۶/۲۷
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
تعیین جنسیت پرندگان برای دانشمندان، حافظان و پرورش دهندگان حائز اهمیت است .در بسیاری از گونههای پرندگان به ویژه پرندگان زینتی به دلیل نداشتن دوشکلی جنسی، تعیین جنسیت دقیق و کارآمد چالشبرانگیز است. روشهایی با درجات مختلف تهاجمی مانند تعیین جنسیت به روش جراحی، استروئیدی و بررسی کروموزومی(کاریوتایپینگ) برای شناسایی جنسیت در پرندگان تک شکل انجام میگیرد. یکی از امن ترین و مطمئن ترین راههای تشخیص جنسیت در پرندگان استفاده از تکنیک PCR به عنوان روشی راحت و کم هزینه برای تکثیر توالی خاصی از DNA است. این طرح با هدف شناسایی جنسیت پرندگان زینتی به روش PCR از روی نمونه پر به عنوان منبع DNA اجرا گردید. در این پروژه تعداد ۵۴ نمونه به صورت تصادفی از پرهای ارجاعی به آزمایشگاه ماجد تبریز در بازه زمانی شهریور تا اسفند سال ۱۳۹۹ انتخاب گردید. این نمونهها از ۷ گونه پرنده شامل عروس هلندی، قناری، طوطی، کاسکو، مرغ مینا، کاکادو و ماکائو بودند. نمونههای پر اصلی به شکل هم راستا با شفت پر کنده شده و درون کیسه پلاستیکی درب دار و در کنار یخ به آزمایشگاه منتقل و در دمای ۲۰- درجه سانتیگراد نگهداری شد. در آزمایشگاه بعد از جداسازی کالاموس پر DNA آن به روش فنل کلروفرم استخراج گردید. در مطالعه اخیر با استفاده از تکثیر ژن CHD واقع در کروموزومهای جنسی Z و W پرندگان و دو جفت آغازگر متفاوت به روش PCR و الکتروفورز محصول تکثیر شده جنسیت پرندگان را شناسایی کردیم. نتایج حاصل از الکتروفورز در پرندگان نر به صورت یک باند و در پرندگان ماده به صورت دو باند ظاهر شد. در این مطالعه با استفاده از آغازگرهای CHDF/R از ۵۴ نمونه پرنده مورد آزمایش ۲۷ نمونه نر و ۲۶ نمونه ماده(در کل بیش از ۹۸٪) شناسایی شد و یک نمونه قابل شناسایی نبود و نیز با استفاده از آغازگرهای P2/P8 از بین ۵۴ نمونه پرنده ۲۴ نمونه نر و ۲۱ نمونه ماده(در کل بیش از ۸۳٪) تشخیص داده شد و ۹ نمونه قابل تشخیص نبود. با توجه به نتایج این مطالعه به نظر میرسد استفاده از آغازگرهای CHDF/R برای تعیین جنسیت بهتر از آغازگرهای P2/P8 است.
Text of Note
Abstract: Determining the gender of birds is important for scientists, conservationists and breeders. In many species of birds, especially ornamental birds, accurate and efficient gender determination is challenging due to the lack of sexual dimorphism. Methods with different degrees of invasiveness such as sex determination by surgery, steroids and chromosomal examination(karyotyping) are performed to identify the sex in unimorph birds. One of the safest and most reliable ways to detect gender in birds is to use the PCR technique as a non-invasive, easy and inexpensive tool to reproduce a piece of DNA. This project was carried out with the aim of identifying the sex of ornamental birds by PCR method from a feather sample as a DNA source. In this project, 54 samples were randomly selected from feathers referred to Majed Tabriz laboratory between September and March 2019. These samples were from 7 species of birds including Dutch bride, canary, parrot, casco, minnow, cockatoo and macaw. The original feather samples were plucked in line with the feather shaft and transported to the laboratory in a plastic bag with a lid next to ice and stored at -20 degrees Celsius. In the laboratory, after separating the calamus, its DNA was extracted by the phenol-chloroform method. In a recent study, we identified the sex of the birds by using the amplification of the CHD gene located in the Z and W sex chromosomes of birds and two different pairs of primer by PCR and electrophoresis of the amplified product. The results of electrophoresis appeared as one band in male birds and two bands in female birds. In this study, using CHDF/R primers, out of 54 tested bird samples, 27 male samples and 26 female samples(over 98% in total) were identified, and one sample could not be identified, and also using P2/P8 primers out of 54 bird samples, 24 male and 21 female samples(more than 83% in total) were detected and 9 samples could not be detected. According to the results of this study, it seems that the use of CHDF/R primers for gender determination is better than P2/P8 primers.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
Molecular sex detection of ornamental birds by PCR