برآورد فراسنجه های ژنتیکی صفات زنده مانی در سنین مختلف و طول عمر درگوسفند نژاد مغانی با استفاده از مدلهای خطی و تجزیه و تحلیل بقا
First Statement of Responsibility
مريم امامعلي پور
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
کشاورزی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۴۰۰
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۸۹ص.
Accompanying Material
سی دی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
علوم دامي گرايش ژنتيك و اصلاح دام
Date of degree
۱۴۰۰/۴/۲۲
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
هدف: هدف از مطالعه حاضر برآورد فراسنجه¬های ژنتیکی صفات طول عمر و زنده¬مانی در سنین تولد تا دو سالگي در گوسفند نژاد مغانی با استفاده از مدلهای خطی و تجزیه و تحلیل بقا بود. روششناسی پژوهش: در اين تحقيق داده¬هاي جمع آوري شده در مرکز اصلاح نژاد گوسفند مغانی واقع در جعفرآباد مغان برای برآورد فراسنجه¬های ژنتیکی صفات طول عمر و زنده¬مانی در سنین مختلف با استفاده از مدلهای خطی و تجزیه و تحلیل بقا استفاده گردید. صفات مورد مطالعه شامل طول عمر و زنده مانی در سنین 3، 6، 9، 12، 15، 18، 21و 24 ماهگی بود. برای شناسایی عوامل غيرژنتيكي موثر بر صفت طول عمر از رویه GLM نرم¬افزار SAS استفاده شد. اثرات ثابت سال تولد، ماه¬تولد، سن میش، نوع تولد، جنس بره، و وزن تولد به صورت متغییر کمکی خطی تاثير معني¬داري بر صفات تحت بررسي داشتند. اجزای واریانس و پارامترهاي ژنتيكي صفات طول عمر با استفاده از شش مدل مدل حيواني كه از لحاظ اثرات تصادفي با هم متفاوت بودند و روش حداکثر درستنمایی محدود شده توسط نرم افزار Wombat برآورد گرديد. برای تعیین مناسب ترین مدل از معیار آکائیک استفاده شد. برای شناسایی عوامل غيرژنتيكي مؤثر بر صفت زنده¬ماني با استفاده از مدل غيرخطي از رویه Lifereg نرم افزار SAS استفاده گرديد. براي تجزيه و تحليل ژنتيكي صفات زنده ماني با استفاده از مدل غير خطي و تابع توزيع ويبول از نرم افزار Survival Kit و مدل پدري استفاده گرديد. یافتهها: میانگین کل طول عمر و زنده مانی تجمعی بره ها از تولد تا دوسالگی به ترتیب 6/34 ± 19/408 روز و 06/0 ± 24 درصد بود. طول عمر و زنده ماني بره¬هاي متولد شده از آذر ماه تا اسفند ماه روند كاهشي داشتند. خطر مرگ تک قلو ها از دوقلوها كمتر بوده و بره¬های دوقلو نسبت خطر بیشتری از تک قلوها داشتند. میانگین حداقل مربعات طول عمر و میزان زنده مانی در بره های نر همیشه كمتر از ماده ها بود و نسبت خطر حذف نرها بیشتر بود. افزايش وزن تولد بره با افزايش طول عمر دام در سنين مختلف همراه بود. وراثت پذیری مستقیم برای صفت طول عمر از تولد تا دو سالگي با استفاده از بهترین مدل خطی منتخب براي هر صفت در محدوده 02/0 تا 03/0 بود. با توجه به اينكه مدل منتخب براي سنين 3 و 6 ماهگي شامل اثر ژنتيكي مادري نيز بود، وراثت پذيري مادري براي اين صفات به ترتيب 039/0و 042/0برآورد گرديد. همچنین با توجه به وجود اثر محيطي دائمي مادري در مدل منتخب براي سنين 15، 18 و 24 ماهگي، نسبت واریانس محیطی دائمی مادری به واریانس فنوتیپی برای صفت طول عمردر اين سنين به ترتيب 019/0، 024/0 و 025/0 بود. وراثت پذيري لگاريتمي حاصل از تابع خطر نسبي براي صفات زنده ماني تا سن يكسالگي در حد متوسط و در محدوده 22/0 تا 25/0 بود ولي پس از سن يكسالگي در حد پايين و در محدوده 03/0 تا 15/0 برآورد گرديد. برآوردهاي حاصل از وراثت پذيري موثر در مقايسه با وراثت پذيري لگاريتمي در سطح بالاتري بوده و براي سنين قبل از يكسالگي در محدوده 36/0 تا 40/0 و براي سنين بعد از يكسالگي در محدوده بين 06/0 تا 24/0 قرار داشت. برآوردهاي وراثت پذيري حاصل از تابع ویبول بيشتر از برآوردهاي وراثت پذيري حاصل از مدلهاي خطي بود.نتیجهگیری: بر اساس نتايج اين تحقيق وراثت پذيري صفات زنده ماني تا سن يكسالگي با استفاده از تابع خطر نسبي و تابع ویبول در حد متوسط به بالا و از سن يك تا دو سالگي در حد پايين تا متوسط مي¬باشد. بر اين اساس مي¬توان از اين صفات در شاخص انتخاب گوسفندان نژاد مغاني در جهت بالابردن پتانسيل ژنتيكي دامها براي اين صفات بهره برد.
Text of Note
AbstractResearch Aim: The aim of the present study was to estimate genetic parameters of longevity and survival traits from birth to two years of age in Moghani sheep using linear models and survival analysis.Research method: In this study, data collected at Moghani Sheep Breeding Center located in Jafarabad Moghan were used to estimate genetic parameters of longevity and survival traits at different ages using linear models and survival analysis. The studied traits included longevity and survival at the ages of 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21 and 24 months. Non-genetic factors affecting longevity were identified using the GLM procedure of SAS. The fixed effects of year of birth, month of birth, age of ewes, type of birth, lamb sex, and linear covariate of birth weight had a significant effect on the studied traits. Variance components and genetic parameters of longevity traits were estimated using six animal models that were different in terms of random effects by restricted maximum likelihood method of Wombat software. Akaike information criterion was used to determine the most appropriate model. The Lifereg procedure of SAS software was used to identify non-genetic factors affecting the survival trait using the nonlinear model. Survival Kit software and sire model were used for genetic analysis of survival traits using nonlinear model and Weibull distribution function.Findings: The mean longevity and cumulative survival of lambs from birth to two years of age were 408.19 ± 34.6 days and 24 ± 0.06%, respectively. Longevity and survival of lambs born from December to March had a decreasing trend. The risk of culling for single lambs was lower than that of twins, and twins were at higher risk of culling. The least square mens of longevity and survival rate in male lambs were always lower than in females and the risk of male culling was higher. Increasing the birth weight of lambs was associated with increasing the longevity of animals at different ages. Direct heritability of longevity from birth to two years of age using the best selected linear model for each trait ranged from 0.02 to 0.03. Considering that the selected model for 3 and 6 months of age also included maternal genetic effect, maternal heritability for these traits was estimated to be 0.039 and 0.042, respectively. Also, due to the existence of permanent maternal environmental effect in the selected model for 15, 18 and 24 months of age, the ratio of permanent maternal environmental variance to phenotypic variance for longevity at these ages was 0.019, 0.024 and 0.025, respectively. The logarithmic heritability estimated from the proportional hazard function for survival traits up to one year of age was moderate and ranged from 0.22 to 0.25, but after one year of age was low and ranged from 0.03 to 0.15. Estimates of effective heritability were higher than logarithmic heritability and ranged from 0.36 to 0.40 for ages before one year and between 0.06 and 0.24 for ages after one year. The heritability estimates obtained from the Weibull function were higher than the heritability estimates obtained from the linear models.Conclusion: According to the results of this study, the heritability of survival traits up to one year of age using the proportional hazard function and Weibull function is moderate to high and from one to two years of age is low to moderate. Based on this, these traits can be used in the selection index of Moghani sheep in order to increase the genetic potential of animals for these traits.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
Estimation of genetic parameters for survival at different ages and longevity in Moghani sheep using linear models and survival analysis