تنوع آللی نواحی ژنومی ژن های مقاومت به زنگ قهوهای و زنگ زرد در گندم نان
First Statement of Responsibility
/مرضیه بزرگمهر
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: پردیس بین المللی ارس
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۶۶ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
در رشته بیوتکنولوژی کشاورزی
Date of degree
۱۳۹۲/۰۶/۱۹
Body granting the degree
دانشگاه تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
زنگ قهوهای و زرد از جمله بیماریصهای مهم کاهنده کمیت و کیفیت محصول گندم در دنیا و ایران میصباشد .در این مطالعه با استفاده از ۱۸ جفت آغازگر اختصاصی و ۱۹ نشانگر ریزماهواره پیوسته با ژنصهای Lr وYr ، تنوع اللی در ۲۰ رقم مقاوم و حساس به زنگصهای زرد و قهوهصای گندم نان مورد بررسی قرار گرفت .با استفاده از چهار جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده براساس توالی ژنLr۱ ، قطعات۵۶۰ ،۲۴۴ ، ۲۶۶ و ۷۸۰ جفتصبازی بهصترتیب در هفت،۱۷ ، پنج و ۱۲ رقم مشاهده شد .برای ژنLr۹ ، علاوه بر قطعات مورد انتظار ۱۱۰۰ و ۸۰۰ جفتصبازی، قطعه جدید ۱۰۹۰ جفتصبازی در پنج رقم تکثیر گردید .برای ژنLr۲۴ ، اللصهای جدید ۶۵۰ و ۹۰۰ جفت بازی بهصترتیب در یک و ۱۸ رقم مشاهده شد .در ناحیه ژنومی مربوط به ژنLr۲۸ ، قطعه ۳۷۸ جفتصبازی در کلیه ارقام تکثیر گردید .با تکثیر ناحیه ژنومی حامل ژنصهایLr۳۴/Yr۱۸ ، دو قطعه ۱۵۰ و ۲۲۹ جفت بازی در هشت رقم مشاهده شد .قطعات۳۳۴ ، ۳۵۱ و ۳۴۰ جفتصبازی از ناحیه ژنومی ژن Lr۳۵ با استفاده از سه جفت آغازگر اختصاصی بهصترتیب در۱۹ ، ۱۷ و نه رقم تکثیر شد .برای ژن Lr۴۷ با استفاده از دو جفت آغازگر، قطعات۴۵۰ ، ۳۸۰ و ۳۹۶ جفتصبازی تکثیر گردید که ۱۸ رقم برای دو قطعه اول هتروزیگوت و ۱۸ رقم نیز حامل قطعه سوم بودند .با استفاده از آغازگر اختصاصی طراحی شده برای ژنYr۵ ، قطعه ۴۸۱ جفتصبازی در هشت رقم مشاهده گردید .تکثیر قطعاتی از ژن Yr۱۰ با استفاده از جفت آغازگرYr۱۰ - ۳منجر به مشاهده نوار ۲۴۶ جفتصبازی در ۱۶ رقم گردید .بررسی تنوع ژن Beta ۱ proteasome با استفاده از دو جفت آغازگر طراحی شده سبب تولید نوارهای ۲۴۸ و ۴۸۷ جفتصبازی به ترتیب در ۱۳ و ۱۸ رقم شد .گروه بندی ارقام با استفاده از دادهصهای این نشانگرها براساس الگوریتم Maximum Evolution و ضریب فاصله تکاملیCantor- Jukes، آنصهارا به دو گروه اصلی منتسب کرد که تا حدودی با پاسخ ارقام به زنگ قهوهصای مطابقت داشت .از ۳۵ آغازگر SSR مورد بررسی، ۱۹ آغازگر چندشکلی نشان دادند .در مجموع ۵۹ الل با دامنه دو تا پنج وئ میانگین ۱۱/۳ به ازای هر جایگاه تکثیر شد .تعداد ژنوتیپ از دو تا شش با میانگین ۴۲/۳ ژنوتیپ متغیر بود .میانگین تنوع ژنی، هتروزیگوتی مشاهده شده، میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) و فراوانی الل شایع بهصترتیب۵۵/۰ ،۰۵/۰ ، ۴۹/۰ و ۵۴/۰ برآورد گردید .تجزیه خوشهصای با استفاده از الگوریتم Maximum Evolution و ضریب فاصله تکاملیCantor - Jukesارقام را به چهار گروه منتسب کرد که این گروهصبندی تاحدودی با پاسخ ارقام به هر دو زنگ مطابقت داشت
Text of Note
Cantor evolution distance coefficient, divided varieties into fourgroups,and this classification was partly conformed with varieties response to both rusts-Cantor evolution distance coefficient, varietiesdividedinto two major groups, and this classification was partly conformed with their response to leaf rust. Through 35 analyzed SSR primers, 19 primers showed polymorphism.Totally 59 alleles were amplified with the domain of two through five and with the average of 3.11 per each position.The number of genotypes varied from one through six with the average of 3.42 genotype. Average gene diversity, maximum observed heterozygosity,maximum PIC valueand major allele frequency were 0.55, 0.05, 0.49 and 0.54, respectively. Cluster analysis with maximum evolution algorithm and Jukes-bp were observed in 13 and 18 varieties. Using data gained from these markers, and based onmaximum evolution algorithm andJukes-bp fragment in 16 varieties. Allelic variation of Beta1proteasome gene was investigated with two primers, and two fragments with size of 248 and 487-3specific primers, produced 246-bp was found in eight varieties. Amplification of Yr10 gene by usingYr10-bp fragment. Based on specific primer designed for Yr5 gene, one allele with 481-bp fragments, and 18 varieties were homozygous for 396-bp were found in 19, 17 and nine varieties, respectively. We used two specific primers for Lr47 gene, and we detected that 18 varieties were heterozygous for 450 and 380-bp. Based on three specific primers for genomic region of Lr35 gene, alleles with 334, 351 and 340-bp fragment was detected in all of the varieties. Using specific primers for genomic regions of Lr34/Yr18 genes, eight varietiesproducedtwo fragments with size of 229 and 150-bp were observed in one and 18 varieties, respectively. In the genomic region of Lr28 gene, only 378-bp. In Lr24 gene, new alleles with 650 and 900-bp,five varietiescarried a novel allele with 1090-Leaf rust and yellow rust are the most important wheat diseases,reducing the quantity and quality of wheat production in both Iran and world. In this study, we have investigated allelic variation of 20 resistant and sensitive varieties toward yellow and leaf rusts, using 18 specific and 19 SSR primers which are linked to Lr and Yr genes in bread wheat. Using four specific primers for Lr1 gene, fragments with size of 780, 560, 244 and 266 bp were found in 12, seven, 17 and five varieties, respectively. In Lr9 gene, in addition to expected fragments 1100 and 800