تنوع زیستی مخمرهای برونزی و درونزی خوشه درختچههای انگور در مناطق منتخب انگورخیز استانهای آذربایجانشرقی، غربی و اردبیل
Parallel Title Proper
Biodiversity of epiphytic and endophytic yeasts of grape berries from the selective vineyards in East and West Azarbaijan and Ardabil provinces
First Statement of Responsibility
/بهاره قنبرزاده
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: کشاورزی
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۹
Name of Manufacturer
، میرزائی
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۱۳۷ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی - الکترونیکی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
دکتری
Discipline of degree
بیماریشناسی گیاهی گرایش قارچشناسی و بیماریهای قارچی گیاهان
Date of degree
۱۳۹۹/۰۶/۲۶
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
کشت و تولید انگور در کشور ما از سابقه بسیار طولانی برخوردار است .انگور نیز همانند سایر گیاهان توسط عوامل میکروبی مختلف برونزی یا درونزی کلنیزه میشود .از جمله این عوامل میکروبی میتوان به مخمرها اشاره کرد .مخمرها نقش مهمی در صنایع مختلف نظیر نانوایی، صنایع تخمیری و سنتز مواد شیمیایی دارند .برخی گونههای مخمر، بیمارگرهای مهم انسانی و یا گیاهی میباشند و تعدادی نیز به عنوان عوامل کنترل زیستی بیماریهای گیاهی پس از برداشت هستند .جمعیت مخمرهای انگور توسط عوامل مختلف زنده و غیرزنده تحت تأثیر قرار میگیرد .بنابراین بررسی تنوع زیستی مخمرهای انگور در مناطق مختلف کشت انگور و تعیین هویت این عوامل امری ضروری میباشد .تاکنون مطالعه جامعی در خصوص تنوع زیستی مخمرهای انگور در ایران صورت نگرفته است .این پژوهش با هدف بررسی تنوع زیستی مخمرهای برونزی و درونزی حبههای انگور در شمالغرب ایران و بررسی تأثیر مرحله رسیدگی انگور در جمعیت مخمرها صورت گرفت .بدین منظور در شهریور ماه سال ۱۳۹۵ نمونهبرداری از انگورهای رسیده از مراکز میوه و ترهبار شهر تبریز و در سال ۱۳۹۶ نمونهبرداری از پنج منطقه منتخب انگورخیز استانهای آذربایجانشرقی) مراغه، مرند(، آذربایجانصغربی) ارومیه، سردشت (و اردبیل) لاهرود (در دو مرحله قبل و بعد رسیدن انگورها انجام شد .پس از جداسازی و خالصسازی، ویژگیهای مرفولوژیکی جدایهها بررسی شد و برای گروهبندی اولیه مورد استفاده قرار گرفت .هر گروه مرفولوژیکی به روش انگشتنگاری DNA با استفاده از مارکرPCR - MSPدوباره گروهبندی شدند و از بین جدایههای با الگوی مشابه، یک یا دو جدایه برای توالییابی ناحیه D۱/D۲ ژن ۲۸S rDNA انتخاب شدند .هویت جدایهها بر اساس تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک دادههای توالی ناحیه D۱/D۲ تعیین و تأیید شد .علاوه بر این از شاخصهای اکولوژی کلاسیک برای به دست آوردن غنا، تنوع زیستی، غالبیت و یکنواختی گونههای شناسایی شده و مناطق مورد بررسی استفاده شد .در تحقیق حاضر، ۱۶ گونه مخمر برونزی در سال ۱۳۹۵ و در سال ۱۳۹۶ نیز ۱۵ گونه مخمر برونزی از انگورهای نارس و ۲۳ گونه مخمر از انگورهای رسیده شناسایی شدند .پس از رسم درخت فیلوژنتیک، هویت تمام جدایهها در سطح گونه تعیین گردید .با این وجود، امکان شناسایی جدایه۱U۲ - ۱۹متعلق به جنس Metschnikowia در سطح گونه فراهم نگردید .درصد جداسازی مخمر در انگورهای رسیده در مقایسه با انگورهای نارس بیشتر بود .همچنین میزان جداسازی مخمرهای آسکومیستی در انگورهای رسیده بیشتر از مخمرهای بازیدیومیستی بود، درحالیکه در انگورهای نارس مخمرهای بازیدیومیستی فراوانی بیشتری داشتند .قارچ شبه مخمر) مخمر سیاه Aureobasidium pullulans (به عنوان گونه غالب از انگورهای نارس و رسیده و در هر دو سال نمونهبرداری جداسازی شد .تجزیه و تحلیل آماری مناطق مورد بررسی نشان داد که در مرحله قبل از رسیدن انگورها، دو منطقه ارومیه و لاهرود و بعد رسیدن انگورها نیز این دو منطقه همراه با منطقه سردشت بیشترین شاخص تنوع زیستی و بیشترین یکنواختی را در بین مناطق مورد بررسی داشتند .در بین گونههای جداسازی شده نیزA. pullulans ، Naganishia uzbekistanensis و Naganishia adeliensis در مرحله قبل رسیدن انگورها و گونه Hanseniaspora uvarum بعد از رسیدن انگورها بیشترین شاخص تنوع زیستی را به خود اختصاص دادند .در سال ۱۳۹۵ نیز گونههایMetschnikowia sinensis ، H. uvarum و A. pullulans به ترتیب بیشترین فراوانی را در بین مخمرهای شناسایی شده داشتند .در مقایسه با مخمرهای برونزی، مخمرهای درونزی درصد جداسازی کمتری داشته، تنها از انگورهای رسیده قابل جداسازی بودند و به استثنای یک مورد، همه گونهها متعلق به گروه آسکومیست بودند .در بین گونههای شناسایی شده در این مطالعه، گونههایCandida membranifaciens ،Clavispora lusitaniae ،Cyberlindnera fabianii ،Candida tropicalis ، Candida peoriensis و Sporisorium graminicola برای اولین بار از روی انگور در دنیا معرفی شدند و گونههایYamadazyma mexicana ،Wickerhamomyces anomalus ،C. lusitaniae ،C. fabianii ،Papiliotrema fuscus ،Starmerella bacillaris ،C. peoriensis ،C. tropicalis ،Candida californica ، Vishniacozyma foliicola،S. graminicola ، Pichia sporocuriosa و Pichia terricola نیز برای اولین بار در ایران جداسازی شدند .در بین نمونههای مورد بررسی، قارچ رشتهای Quambalaria cyanescens نیز جداسازی شد .گونه Debaryomyces hansenii و چهار جدایه از گونه A. pullulans دارای بیشترین قدرت بازدارندگی از رشد در برابر قارچ Botrytis بودند
Text of Note
The cultivation and production of grape has a long history in Iran. Grape, as like as other plants, is colonized by various epiphytic and endophytic microbial agents including yeasts. Yeasts play an important role in different industries such as bakery, fermentation industries and chemical synthesis. Some yeasts are important human or plant pathogens and some others are biological control agents of post-harvest plant diseases. The distribution of yeast population on grapes is influenced by various biotic and abiotic factors. Therefore, it is necessary to study the biodiversity of grape yeasts in different vine growing regions and determine the identity of these microorganisms. There is not any comprehensive study conserning the biodiversity of grape yeasts in Iran therefore, this study was conducted to investigate the biodiversity of epiphytic and endophytic yeasts on grape berries in northwest of Iran and the impact of the grape maturity on the community of yeasts. For this purpose, sampling was performed from mature grape bunches in markets of Tabriz city during September 2017 and in 2018, grapes were collected from five selected vine growing regions of East Azarbaijan (the Maragheh and Marand regions), West Azarbaijan (the Urmia and Sardasht regions) and Ardabil (the Lahrud region) provinces, before and at harvest time of grapes. After isolation and purification, the morphological characteristics of the isolates were investigated and used for initial classification. Then, each morphological group was reclassified by DNA fingerprinting method using MSP-PCR and then one or two isolates with the same pattern were selected for sequencing the D1/D2 region of 28S rDNA. Identification of the isolates was confirmed by phylogenetic analysis of D1/D2 sequences. Also, the classic ecological indexes were used to obtain the richness, the biodiversity, the dominance and the evenness of the identified species and the studied regions. As a result, 16 epiphytic yeast species were identified during 2017 while, 15 and 23 different yeast species were respectively isolated from mature and immature grapes in 2018. Based on the phylogenetic tree, all of the isolates, except 19-1U2 belong to the genus Metschnikowia, were identified at species level. The percentage of yeast isolation in mature grapes was higher than immature grapes. Also, the isolation of ascomycetous yeasts was higher than in basidiomycetous yeasts on mature grapes while, basidiomycetous yeasts had the most frequency on immature grapes. The yeast-like (black yeast) Aureobasidium pullulans was identified as the dominant species isolated from mature and immature grapes and both years of sampling. Statistical analysis of the studied regions dedicated that before grape ripening, the Urmia and Lahrud regions had the highest biodiversity index and after grape ripening these two regions together with the Sardasht region showed the highest biodiversity and evenness indexes. Among the identified species, A. pullulans, Naganishia uzbekistanensis and Naganishia adeliensis had the highest biodiversity index on immature grapes while Hanseniaspora uvarum showed the highest biodiversity index on mature grapes. The species, Metschnikowia sinensis, H. uvarum and A. pullulans were the most frequently isolated species during 2017. In compare with epiphytic yeasts, endophytes had a lower percentage of isolation, could only be isolated from mature grapes and with one exception, all species belonged to the ascomycetous group. To our knowledge, this is the first report of Candida membranifaciens, Candida tropicalis, Cyberlindnera fabianii, Clavispora lusitaniae, Candida peoriensis and Sporisorium graminicola as the inhabitants of grape in the world and the species Yamadazyma mexicana, Wickerhamomyces anomalus, C. lusitaniae, C. fabianii, Papiliotrema fuscus, Starmerella bacillaris, C. peoriensis, C. tropicalis, Candida californica, Vishniacozyma foliicola, S. graminicola, Pichia sporocuriosa and Pichia terricola are new for the mycobiota of Iran. Among the identified species, Quambalaria cyanescens was also isolated. Debaryomyces hansenii and four isolates of A. pullulans had the most antagonistic effect against Botrytis
PARALLEL TITLE PROPER
Parallel Title
Biodiversity of epiphytic and endophytic yeasts of grape berries from the selective vineyards in East and West Azarbaijan and Ardabil provinces