#شناسایی، توالییابی و بررسی ویژگیهای ایمونولوژیک یک پروتئین سطحی اختصاصی Acinetobacter baumannii با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
#۱۸۲ص.: جدول، نمودار
Specific Material Designation and Extent of Item
1
EXTERNAL INDEXES/ABSTRACTS/REFERENCES NOTE
Name of source
#Acinetobacter baumanniiیک باکتری گرم منفی، غیرصمتحرک و صهوازی اجباری است که به عنوان پاتوژن بیمارستانی شناخته شده و غالبا مقاوم به انواع آنتیصبیوتیکصهاست .این باکتری همچنین به عنوان یک عامل مهم شیوع و مرگ ومیر در بیمارستانصها مخصوصا در میان بیماران دارای نقص ایمنی شناسایی شده است .کنترل و درمان عفونت ناشی از آن به دلیل توانایی پاتوژن برای مقاومت به انواع آنتیصبیوتیکصها و زنده ماندن در شرایط محیطی مختلف و استفاده از طیف وسیعی از منابع غذایی، سخت است .تشخیص اولیه عفونت ایجاد شده بوسیله A. baumannii استراتژی مهمی برای کنترل کردن عفونت بیمارستانی ناشی از این پاتوژن است .روشصهای رایج شناسایی این باکتری بوسیله روشصهای کشت معمول و تستصهای بیوشیمیایی است که بدست آوردن نتایج آنصها بین ۲ تا ۵ روز طول میصکشد .بنابراین یک تست جدید، سریع، حساس، اختصاصی و اقتصادی که مدیریت سریع عفونتصهای A. baumannii را فراهم می کند، مورد نیاز است .ایجاد یک تست تشخیصی اختصاصی و حساس به یک بیومارکری نیاز دارد که واکنش تقاطعی با باکتریصهای دیگر نداشته و تنها برای A. baumannii اختصاصی باشد .براین اساس، هدف از این مطالعه شناسایی و توالیصیابی یک پروتئین غشای خارجی kDa 34.4 معرفی شده توسط Islam et al. از بین پروتئینصهای غشای خارجی (OMPs) A. baumannii ATCC 19606 است .در مطالعه حاضر ما از نرمصافزارهای مختلف بیوانفورماتیکی برای غربالگری کل پروتئوم باکتری استفاده کردیم .غربالگری پروتئینصها با توجه به ویژگیصهایی از جمله :وزن مولکولی، موقعیتصیابی، توپولوژی، همولوژی، آنتیصژنیسیته و آلرژیصزایی صورت گرفته است .در نهایت 201 پروتئین در وزن مولکولی بین36 - kDa 33پیدا شد که در این میان 11 پروتئین به عنوان پروتئین غشای خارجی شناسایی شدند و در نهایت ۳ مورد از پروتئینصها از نظر مکانی کاندیدای مناسبی برای انتخاب بودند .براساس آنالیزهای انجام شده با BLAST و پیشصبینیصهای آنتیصژنیسیته و دیگر بررسیصهای صورت گرفته تنها یکی از ۳ پروتئین به عنوان پروتئین آنتیصژن و اختصاصی A. baumannii شناخته شد .