عنوان

شناسایی ژن های عامل بیماری در ۵ خانواده ی مبتلا به فرم مغلوب بیماری رتینیت پیگمنتوزا با به کارگیری تکنیک توالی یابی کل اگزوم

IR

۲۹۶۰پ

فارسی

IR

شناسایی ژن های عامل بیماری در ۵ خانواده ی مبتلا به فرم مغلوب بیماری رتینیت پیگمنتوزا با به کارگیری تکنیک توالی یابی کل اگزوم

[پایان‌نامه]

.Identification of Causative Genes in 5 Iranian Families Affected to Autosomal Recessive Form of Retinitis Pigmentosa (RP) Using Whole Exome Sequencing

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

، ۱۳۹۸

و،۱۲۲ص.

پیوست

چاپی

کارشناسی ارشد

ژنتیک انسانیHuman Genetics

۱۳۹۸/۰۷/۲۸

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

رتینیت پیگمنتوزا (RP) گروه بزرگی از بیماری های هتروژن ژنتیکی تخریبی شبکیه است که با تخریب گیرنده های نوری استوانه ای و به دنبال آن تخریب گیرنده های نوری مخروطی سراسر شبکیه مشخص می شود .علائم این بیماری شامل شب کوری و به دنبال آن کاهش میدان دید محیطی است که منجر به دید تونلی می شود و در نهایت نقص در دید مرکزی و یا در بعضی موارد کوری مطلق را در پی دارد .الگوی وراثت RP می تواند آتوزوم غالب(۳۰-۴۰) ، آتوزوم مغلوب(۵۰-۶۰) و وابسته به)X ۵-۱۵) باشد .در این مطالعه ۵ خانواده ی مبتلا به فرم آتوزوم مغلوب RP را بررسی شده تا علت مولکولی بیماری در آن ها شناسایی شود .روش اجرا :در ابتدا با استفاده از تکنیک توالی یابی کل اگزوم (WES) ورینت ژنی احتمالی بیماریزا شناسایی شد .در مرحله بعد، با استفاده از روش توالی یابی سنگر ورینت پیدا شده در پروباند تایید و آنالیزsegregation - coدر دیگر افراد خانواده انجام شد .یافته ها :ورینت احتمالی بیماریزا در چهار خانواده از پنج خانواده مورد بررسی شناسایی شد .ورینت بیماریزا در دو خانواده یکسان بودCNGA۱_NM:۰۰۰۰۸۷c.A:۱۴۸۷C:p.Q۴۹۶ Pو دو خانواده دیگر نیز واجد دو ورینت بیماریزای جدید در دو ژن متفاوت دیگر بودند،RPGRIP ۱_NM:۰۲۰۳۶۶.c:۲۷۱۰+۱ G>TوPDE ۶_B:NM۰۰۰۲۸۳.c:۱۹۲۰+۲ .T>Gتمام واریانت ها در پروباند ها و اعضای خانواده ی آنهاsegregate - co شدند .نتیجه گیری :نتایج این مطالعه بیانگر این است که بیماران RP جمعیت ایرانی واجد لوکوس هتروژنیتی بالایی می باشند .همچنین یافتن تغییرات نوکئوتیدی شبیه در خانواده های مختلف شبیه آنچه در مورد ورینتCNGA ۱ دیدیم می تواند فرصت هدفمند کردن غربالگری اولیه را برای پیدا کردن افراد ناقل در آن جمعیت فراهم سازد .یافته های این مطالعه می تواند در مشاوره ی ژنتیک، شناسایی افراد ناقل و تشخیص پیش از تولد مورد استفاده قرار گیرد .کلید واژه‌ها :رتینت پیگمنتوزا، توالی یابی کل اگزوم، توالی یابی سنگر، ژنRPGRIP ۱، ژنCNGA ۱و ژنPDE ۶ B

Introduction and Objectives: Retinitis pigmentosa (RP) refers to a large group of genetically heterogeneous retinal degenerative disorders characterized by degeneration of rod photoreceptors followed by cone photoreceptors death throughout the retina. Typical symptoms include night blindness followed by decreasing visual fields, leading to tunnel vision and eventually impaired central vision or, in many cases, complete blindness. The inheritance pattern can be autosomal dominant (about 40-30 ), autosomal recessive (60-50 ), and X-linked (15-5 ). In this study, we investigated five Iranian families with Autosomal Recessive Retinitis Pigmentosa to identify possible inherited disease-causing variants related to RP. Methods: Initially, using the whole exome sequencing(WES) technique, a candidate pathogenic variant was identified. Subsequently, the identified variant in the proband was verified using the Sanger sequencing. And segregation analysis was performed on other family members. Results: The probable pathogenic variant was identified in four of the five families. The pathogenic variant was identical in the two families CNGA1:NM_000087: c.A1487C:p.Q496P, and the other two families also had two new pathogenic variants in two different genes, RPGRIP1:NM_020366: c.2710+1G>T and PDE6B:NM-000283: c.1920+2T>G, that were pathogenic according to ACMG guideline. All of variants were co-segregated in affected individuals and other family members. Conclusions: The results of this study indicate that Iranian RP patients have a high locus heterogeneity. Also, finding similar nucleotide variations in different families, like the one we saw in the CNGA1 variant, could provide the opportunity to target early screening to find carriers in that population. The findings of this study can be used in genetic counseling, carrier identification, and prenatal diagnosis. Keywords: Retinitis Pigmentosa, Exome sequencing, Sangar sequencing, RPGRIP1 gene, CNGA1gene, PDE6B gene,

ba

.Identification of Causative Genes in 5 Iranian Families Affected to Autosomal Recessive Form of Retinitis Pigmentosa (RP) Using Whole Exome Sequencing

Retinitis Pigmentosa

رتینت پیگمنتوزا

Retinitis Pigmentosa

دهانی، محمد

Dehani, Mohammad

زارع، داود

خرم خورشید، حمیدرضا

ایران

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

2960t.pdf

محرمانه

محرمانه

2960t.pdf

6015365

مرجع

متن

0

۰۶۹۲پ

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

نمایه‌سازی قبلی

چاپی-الکترونیکی

TF

1

a

Y