T27453
انگلیسی
Evaluation of the expression pattern of miR-19, miR-143, miR-223, miR-301a and miR-494 in two groups of SARS-CoV-2 virus-infected patients with high and normal D-dimer levels
Dissertation
Ammar Khalo Abass Kasho
Natural Sciences
1401
83p.
cd
M.S.
Cellular and Molecular Biology
1401/05/11
MicroRNAs, or miRNAs, may can involve in coagulation and inflammation pathway caused by severe Coronavirus disease (COVID-19). Accordingly, this attempt was made to explore the behavior of PBMC miRNAs as effective biomarkers to diagnose COVID-19 patients with normal and abnormal coagulation indices. We selected the targeted miRNAs (miR-19a-3p, miR-223-3p, miR-143-5p, miR-494-3p and miR-301a-5p) according to previous reports, whose PBMC levels were then determined by real-time PCR. Receiver operating characteristic (ROC) curve was obtained to clarify the diagnostic potency of studied miRNAs. The differentially expressed miRNA profiles and corresponding biological activities were predicted in accordance with bioinformatics data. The targeted miRNAs' expression profiles displayed a significant difference between COVID-19 subjects with normal and abnormal coagulation indices. Moreover, the average miR-223-3p level expressed in COVID-19 cases with normal coagulation indices was lower significantly than that in healthy controls. Based on data from ROC analysis, miR-223-3p and miR-494-3p are promising biomarkers to distinguish the COVID-19 cases with normal or abnormalcoagulation indices. Bioinformatics data highlighted the prominent role of genes targeted for selected miRNAs in the inflammation and TGF-beta signaling pathway.The differences existed in the expression profile of selected miRNA between the groups introduced the miR-494-3p and miR-223-3p as potent biomarkers to prognosis the incidence of COVID-19.
میکروآرنا یا miRNAها ممکن است در مسیر انعقاد و التهاب ناشی از بیماری شدید مرتبط با کروناویروس سندرم حاد تنفسی ۲ کروناویروس (COVID-19) دخیل باشند. بر این اساس هدف از این مطالعه بررسی الگوی بیانی miRNAها منتخب در PBMC به عنوان نشانگرهای زیستی مؤثر برای تشخیص بیماران COVID-19 با شاخص‌های انعقادی طبیعی و غیر طبیعی میباشد. ما miRNAهای منتخب که شامل miR-19، miR-143، miR-223، miR-301a و miR-494 را طبق گزارش‌های قبلی انتخاب کردیم و سطوح PBMC آن‌ها توسط ریل تایم PCR تعیین شد. همچنین برای بررسی حساسیت و اختصاصیت میکروآرناها به عنوان بیومارکرهای تشخیصی از تستROC استفاده شد. پروفایل بیانی miRNA منتخب و فعالیت‌های بیولوژیکی مربوطه مطابق با داده‌های بیوانفورماتیک نیز پیش‌بینی شدند. نمایه‌های بیان miRNAهای هدف، تفاوت معنی‌داری را بین افراد مبتلا به کووید-19 با شاخص‌های انعقاد طبیعی و غیرطبیعی نشان داد. علاوه بر این، میانگین سطح miR-223-3p بیان شده در موارد COVID-19 با شاخص های انعقادی طبیعی به طور قابل توجهی کمتر از افراد سالم بود. بر اساس داده‌های تجزیه و تحلیل ROC، miR-223-3p و miR-494-3p بیومارکرهای امیدوارکننده‌ای برای تشخیص موارد COVID-19 با شاخص‌های انعقادی طبیعی یا غیرطبیعی هستند. داده‌های بیوانفورماتیک نقش برجسته ژن‌هایی را که برای miRNAهای منتخب در التهاب و مسیر سیگنالینگ TGF-beta هدف قرار می‌گیرند، برجسته کرد
بررسی الگوی بیانی miR-19، miR-143، miR-223، miR-301a و miR-494 در دو گروه از بیماران آلوده به ویروس SARS-CoV-2 با سطوح D-دایمر بالا و طبیعی
Virus, SARS-CoV-2, COVID-19, D-dimer, microRNA
کووید-19، ویروس، دی-دایمر، بیومارکر، میکروآرناSARS-CoV-2
Kasho,
Ammar Khalo Abass
Producer
Farsad,
Bannazadeh Baghi,
Sadri Nahand,
Nader
Hossein
Javid
Thesis advisor
Thesis advisor
Consulting advisor
Tabriz
ایران
Central Library of Tabriz University
ارشد پایاننامه QL351.K38 1401
Ammar Khalo Abass Kasho
عبادی
e
TL
276903
a
Y
