T26815
انگلیسی
Comparison of the expression of non-coding GAS5 and HEIH genes in tissue samples of patients with hepatocellular carcinoma and investigation of the relationship with the presence of HBV
Dissertation
Malak Imad
Natural Sciences
1401
124p.
cd
M.S.
Cellular and Molecular Biology
1401/04/01
Although most of the human genome is able to transcription but the small percentage of the RNAs in this process is translated to protein. Recent findings shows that a part of RNAs that are not translated has major roles in difference regulation of cells. One of these RNA particles are long and non-coding RNAs (lncRNA). Recent researches suggest that they are widely involved in or effected during different cancers, so studying them as potential biomarkers or therapeutic targets in cancers, especially deadly and asymptomatic cancers in their early stages like hepatocellular carcinoma is needed. So here in this thesis we studied two lncRNA coding genes called GAS5 and HEIH to investigate their expression rates in cancerous tissue versus marginal tissue and most importantly, the change of the expression rate in HBV-mediated hepatocellular carcinoma. For this, we have been collected samples from patients with hepatocellular carcinoma without considering if they were HBV infected or not. Then samples were divided into HBV positive and negative by pathologist approval. qRT-PCR method were used to determine the expression rates and statistical tests were done on data.Statistical analysis of these data and comparison of gene expression in cancerous and marginal tissues as well as in tumor tissue of different groups of cancer patients showed that the difference in GAS5 gene expression in tumor and marginal tissue was significant. Also, by examining the ROC, we find that they are strong as biomarkers in this type of cancer. There was also a significant difference in the expression of GAS 5 gene in different tissues of cancer origin. In contrast, the expression of HEIH gene in two types of marginal and tumor tissues is not significant.
اگرچه بیشتر ژنوم انسان قادر به رونویسی است، اما درصد کمی از RNA ها در این فرآیند به پروتئین تبدیل می شود. یافتههای اخیر نشان میدهد که بخشی از RNAهایی که ترجمه نشدهاند، نقش عمدهای در تنظیم تفاوت سلولها دارند. یکی از این ذرات RNA های طولانی و غیر کد کننده (lncRNA) هستند. تحقیقات اخیر نشان می دهد که آنها به طور گسترده در سرطان های مختلف دخالت دارند یا در طول آن تأثیر می گذارند، بنابراین مطالعه آنها به عنوان نشانگرهای زیستی بالقوه یا اهداف درمانی در سرطان ها، به ویژه سرطان های کشنده و بدون علامت در مراحل اولیه آنها مانند کارسینوم سلول های کبدی ضروری است. بنابراین در اینجا در این پایان نامه ما دو ژن کدکننده lncRNA به نامهای GAS5 و HEIH را مورد مطالعه قرار دادیم تا میزان بیان آنها را در بافت سرطانی در مقابل بافت حاشیهای و مهمتر از همه، تغییر میزان بیان در کارسینوم سلولهای کبدی با واسطه آلودگی HBV را بررسی کنیم. برای این کار، نمونههایی را از بیماران مبتلا به کارسینوم سلولهای کبدی بدون در نظر گرفتن اینکه آیا آنها آلوده به HBV هستند، جمعآوری کردهایم. سپس نمونه ها با تایید پاتولوژیست به دو دسته HBV مثبت و منفی تقسیم شدند. برای تعیین میزان بیان از روش qRT-PCR و آزمون های آماری بر روی داده ها استفاده شد.تجزیه و تحلیل آماری این دادهها و مقایسه بیان ژن در بافتهای سرطانی و حاشیهای و همچنین در بافت تومور گروههای مختلف بیماران سرطانی نشان داد که تفاوت بیان ژن GAS5 در بافت تومور و حاشیه معنیدار است. همچنین با بررسی ROC متوجه می شویم که آنها به عنوان نشانگرهای زیستی در این نوع سرطان قوی هستند. همچنین تفاوت معنی داری در بیان ژن GAS5 در بافت های مختلف با منشاء سرطانی وجود داشت. در مقابل، اختلاف میزان بیان ژن HEIH در دو نوع بافت حاشیه ای و توموری معنی دار نیست.
مقایسه بیان ژنهای غیرکد کننده GAS5 و HEIH در نمونه بافتی بیماران مبتلا به کارسینوم هپاتوسلولار و بررسی ارتباط آن با وجود ویروس هپاتیت B
Hepatocellular carcinoma, Hepatitis B Virus (HBV), lncRNA, GAS3, HEIH
کارسینوم هپاتوسلولار، ویروس هپاتیت B (HBV)، lncRNA، GAS3، HEIH
Imad,
Malak
Producer
Safaralizadeh,
Farsad,
Reza
Nader
Thesis advisor
Consulting advisor
Tabriz
ایران
Central library of tabriz
ارشد پایاننامه QL351.I4 1401
Malak Imad
عبادی
e
TL
276903
a
Y
