شناسایي حیوانات بنیانگذار و برآورد میزان مشارکت ژنتیکي آنها در برخي گلههاي هلشتاین استان آذربایجان شرقي با استفاده از آنالیز احتمال منشاء ژن
جلیل خرسندي خواجه
کشاورزی و منابع طبیعی اهر
۱۴۰۰
۹۰ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
علوم دامي گرايش ژنتيك و اصلاح دام
۱۴۰۰/۶/۳۰
هدف: در اين تحقيق از اطلاعات شجرهاي 11104 راس گاو هلشتاين متعلق به برخي گلههاي استان آذربايجان-شرقي جهت بررسي تنوع ژنتيكي جمعيت و شناسايي حيوانات بنيانگذار و اجداد اصلي تبيين كنندده خزانده آللديجمعيت استفاده گرديد.روششناسي پژوهش: اطلاعات شجرهاي گاوهاي تحت بررسي با استفاده از منابع اطلاعاتي قابل دسدترس درداخل و خارج كشور تا حد امكان تكميل گرديد، بطوريكه فايل شجره تكميل شده حاوي اطلاعدات مربدوب بده38926 حيوان بود. سطح كامل بودن شجره با محاسبه تعداد نسلهاي معدادل كامدل مدورد بررسدي قدرار گرفدت.همخوني دامها و روند ميانگين همخدوني جمعيدت در طدول سدالهاي مدورد مطالعده بررسدي گرديدد. انددازه مدو رجمعيت با استفاده از روش افزايش همخوني فردي برآورد گرديد. جهت برآورد فراسنجههاي احتمال منشداء ژن،5554 گاو متولد شده در بين سالهاي 1395 تا 1400 كه پدر و مادرشان معلوم بود بده عندوان جمعيدت مرجدع درنظر گرفته شدند.یافتهها: ميانگين همخون ي كل دامها و دامهاي همخون در جمعيت مرجع به ترتيب 59 / 0 و 96 / 0 درصد بدرآوردگرديد. ميانگين همخون ي دامها در طول سالهاي مورد مطالعه روند افزايشد ي داشدته و نوسدانات موجدود در رونددهمخون ي دامها با نوسانات تعداد نسلهاي معادل كامل دامها مطابقدت داشدت. انددازه مدو ر جمعيدت تحقدق يافتدهجمعيت مرجع با استفاده از روش افزايش همخون ي فردي 71 / 260 رأس برآورد گرديد. تعداد حيوانات بنيانگدذارو همچنين تعداد مو ر حيوانات بنيانگذار جمعيت مرجع بترتيب 2209 و 155 رأس برآورد گرديد، كده حداك ي ازمشاركت 7 درصدي حيوانات بنيانگذار در ايجاد جمعيت مرجع بود. تعداد مو ر اجدداد جمعيدت مرجدع 80 رأسبرآورد شد كه 100 ، 75 و 50 درصد مخزن ژن ي جمعيت به ترتيدب توسد 1678 ، 229 و 50 جدد تبيدين گرديدد.نسبت تعداد مو ر حيوانات بنيانگذار به تعداد مدو ر اجدداد درجمعيدت مرجدع در حددود 94 / 1 بدرآورد شدد، كدهنشاندهنده وقوع گلوگاهها در شجره و عدم تعادل مشاركت حيوانات در توليد نسل بعدد بدود. تعدداد مدو ر ژندومحيوانات بنيانگذار در جمعيت مرجع تحت بررسي 45 / 70 رأس تخمين زده شد. نسبت تعداد مو ر ژنوم حيواناتبنيانگذار به تعداد مو ر حيوانات بنيانگذار حداكي از وجدود ا در راندش ژنتيكد ي تصداد ف ي در كداهش تندوع آللديجمعيت مرجع بود.نتیجهگیري: بررسي اجداد اصدلي تبيدين كنندده تندوع آللدي جمعيدت مرجدع حداكي از اسدتفاده زيداد از برخدياسپرمهاي خاص با پتانسيل ژنتيكي بالا به طور مشترك در تمام گلههاي تحت بررسي بود. استفاده از اسپرمهداييكه از نوادگان و خويشاوندان اجداد اصلي تبيين كننده تندوع ژنتيكدي جمعيدت هدر گلده نباشدند جهدت مدديريتژنتيكي اين گلهها در آينده ضروري م يباشدد. محاسدبه متوسد ضدريب خويشداوندي هدر اسدپرم جديدد بدا كدلگاوهاي زنده )يا گاوهاي آماده تلقيح( هر گله در زمان انتخاب اسپرم براي خريد م يتواند براي نيل به اين هددبكار رود. همچنين استفاده از روشهايي همچون مشاركت بهينه والدين جهت مديريت تندوع ژنتيكدي جمعيدت دركنار رسيدن به پيشرفت ژنتيكي مطلوب در اين گلهها توصيه م يگردد كه فايل شجره تكميل شده در اين تحقيقم يتواند به تحقق اين اهدا كمك شاياني نمايد.
AbstractResearch Aim: Research Aim: In this study, pedigree information of 11104 Holstein breeds belonging to some herds in East Azerbaijan province was used to study the genetic diversity of the population and to identify the founder animals and the main ancestors of the population's allele treasury.Research method: Pedigree information of the studied cows was completed as much as possible using the available information sources inside and outside of the country, so that the completed pedigree file contained information about 38926 animals. The level of completeness of the pedigree was investigated by calculating the number of complete equivalent generations. Livestock inbreeding and the trend of mean inbreeding of population during the years studied were investigated. The effective population size was estimated using the method of individual increase in inbreeding. To estimate the parameters of the probability of gene origin, 5554 cows born between years 2016 and 2021 with known parents were considered as the reference population.Findings: The mean of inbreeding for all livestock and inbred animals in the reference population was 0.59% and 0.96%, respectively. The average inbreeding of animals over the years of study has an increasing trend, and the fluctuations in the inbreeding evolution of animals are consistent with fluctuations in criterion of the number of complete equivalent generations of animals. The Realized effective population size using the method of individual increase in inbreeding was estimated to be 260.71 heads. The number of founders and also the effective number of founders of the reference population were estimated at 2209 and 155 heads, respectively, which indicated the contribution of 7% of the founders in creating the reference population. The effective number of ancestors of the reference population was estimated to be 80, of which 100, 75 and 50% of the population's gene pool were explained by 1678, 229 and 50 ancestors, respectively. The ratio of the effective number of founder animals to the effective number of ancestors in the reference population under study was estimated to be about 1.94, which indicates the occurrence of bottlenecks in the pedigree and the imbalance of animal contribution in the creation of the next generation. The effective number of founder genomes of the reference population under study was estimated to be 70.45 heads. The ratio of the effective number of founder genomes to the effective number of the founder animals indicated the existence of effect of random genetic drift in the study population.
Detection of founder animals and estimation of their genetic contribution to the some Holstein herds of East Azerbayjan province using the probability of gene origin analysis