بررسی بیانAS۱ - lncRNA TMPOدر بافت توموری و حاشیه تومور بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال
/هانیه محمدرضاخانی
: علوم طبیعی
، ۱۳۹۸
، راشدی
۶۲ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
زیست شناسی گرایش بیوشیمی
۱۳۹۸/۰۷/۱۶
تبریز
سرطان یک بیماری ژنتیکی در سلولصهای پیکری به دلیل تقسیم سلولی غیر طبیعی یا از دست رفتگی مرگ طبیعی سلول) آپوپتوز (میصباشد .سرطان امروزه پس از بیماریصهای قلبی عروقی به عنوان دومین عامل مرگ و میر شناخته میصشود .سرطان روده به عنوان دومین سرطان رایج در اکثر کشورهای توسعه یافته و با شیوع کمتر در بیشتر کشورهای در حال توسعه شناخته میصشود ۱۵ .تا ۲۰ درصد از موارد سرطان کلورکتال (CRC)به شکل توارثی است .انجام پروژهصهایی مانند ترانسکریپتوم نشان داد که اکثر ژنوم انسان به RNA غیر کدکننده رونویسی میصشود، که اینRNA ها دارای انواع متفاوتی هستند که اکثرا دارای نقش تنظیمی هستند .بزرگترین گروه ازRNA های غیرکدشونده، RNA غیر کدکننده بلند (lncRNA)هستند که نقشصهای متفاوتی در تنظیم بیان ژنصها و فعالیتصهای مختلف سلول نقش ایفا میصکند و همچنین نقش مهمی در رشد و پیشرفت سرطانصهای انسانی از جمله سرطان کلورکتال (CRC)دارند .ژنAS۱ - TMPOبه عنوان یک lncRNA آنتی سنس در سرطانصهای پروستات و ریه بررسی شده است و براساس مطالعات انجام شده میصتواند یک نشانگر مفید تشخیصی و پیش آگهی برای سرطانصهای فوق باشد .مواد و روشصها :در این پژوهش ۵۰نمونه از بافت تومور و ۵۰ نمونه حاشیه تومور بیماران سرطانی که شامل ۳۲ مرد و ۱۸ زن بودند، مورد بررسی قرار گرفت .از بافتصهای مورد نظر توسط کیت استخراج) ترایزول(، RNA را جدا کرده، از RNA استخراج شده سنتز cDNA انجام داده، سپس Real Time PCR برای ژنAS۱ - TMPOبه عنوان ژن هدف و GAPDH به عنوان ژن کنترل داخلی انجام داده و در نهایت آنالیز آماری را توسط نرم افزار انجام دادهصایم .نتایج :طبق نتایج مطالعهصی انجام شده، بیانAS۱- lncRNA TMPOدر بافت توموری سرطان کولورکتال نسبت به بافت سالم حاشیهصای به میزان چشمگیر و معنی داری افزایش پیدا کرد .بنابراین میصتوان با بررسیصهای بیشتر، ژنAS۱ - TMPOبه عنوان یکی از بیومارکرهای تشخیصی یا پیش بینی کننده برای سرطان کولورکتال استفاده کرد و به احتمال زیاد میصتواند افتراق دهنده بافت توموری و حاشیه توموری طی پروسه های جراحی کاربرد داشته باشد، اما برای اثبات این ادعا به مطالعات و بررسی-های بیشتری نیاز است .بحث و نتیجهصگیری lncRNA:ها به عنوان دسته ای از توالیصهای غیر کدشونده در ژنوم حضور دارند، که براساس مطالعات اخیر نقش آن در ارتباط با پیشرفت و توسعه سرطان بررسی شده است .در این مطالعه بر روی میزان بیانAS۱ lncRNA - TMPOمطالعاتی انجام شد که میزان بیان قابل توجهی در بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال مشاهده شد .برای بررسی بیشتر نقش lncRNA در سرطان پیشنهاد میصشود که در سایر سرطانصها و ردهصهای سلولی مورد مطالعه قرار گیرد
Colorectal cancer is the third common cancer in the world. Genes who are involved in the cell cycle, apoptosis, and other cell activities play critical roles in cancer progression. Long non-coding RNA (lncRNA) a different role in regulating the expression of various genes and activities of the cell, and also plays a significant role in the growth and development of human cancers, including CRC. TMPO-AS1 is an antisense lncRNA, which is transcribed in unlike the TMPO gene (Thymopoietin). Research Method: In this study, 50 pairs of tumor and marginal tumor samples of cancer patients will be investigated. From the tissues, we isolated the RNA with the extraction kit (trizol), next synthesize it to the cDNA, then perform Real-Time PCR and finally examine statistical analysis. Results: considering the significant of the outbreak of colorectal cancer and the consequential role of lncRNA in this cancer, it is hoped that genetic studies on lncRNAs can help prevent and remedy this cancer. However, due to the overexpression of TMPO-AS1 gene in cancer, tissue samples can be considered as a prognostic factor and one of the therapeutic expectations in CRC. Conclusion: In recent studies, lncRNA are a set of non-coding sequences in the genome that are involved in cellular processes including gene regulation and chromatin dynamics. Expression and mutation in them are closely related to tumorigenesis, metastasis, and tumor stage in cancer. Despite these evidences, their studies on cancer are important. In this study, due to the importance role of lncRNA in various cancers, TMPO-AS1 examined as lncRNA. Based on the results, further studies can be performed in other cancers particularly digestive system cancers, as well as in cell lines and drug sensitivity. To provide acceptable results at the pathological level