تشخیص ناهنجاری های کروموزمی از روی تصاویر کاریوتایپ با استفاده از روشهای پردازش تصویر
Karyotype Images using Image Processing Methods
/عالیه توسلیان
: علوم ریاضی
، ۱۳۹۷
، راشدی
۸۲ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
علوم کامپیوتر گرایش سیستم های هوشمند
۱۳۹۷/۱۱/۳۰
تبریز
تا امروز حدود بیست هزار ناهنجاری کروموزوم در بانک های اطلاعات آزمایشاه به ثبت رسیده است .اگرچه هر یک از این بیماری ها به تنهایی بسیار نادر هستند، ول روی هم رفته در ایجاد بیماری های متعدد و مرگ و میر انسان ها نقش بسزایی دارند .شناسایی ناهنجاری های کروموزوم بخش ضروری از تشخیص و درمان اختلالات ژنتی و تعدادی از انواع سرطان هاست .سیتوژنتی ابزار ارجح در تشخیص بیماری های ژنتی است .در سیتوژنتی ،کاریوتایپ که آرایه نظام مندی از کروموزوم های ی انسان است و کروموزوم ها در آن بر اساس ویژگ های مورفولوژی جفت و مرتب م شوند، مورد تجزیه و تحلیل قرارم گیرد .در حال حاضر این تجزیه و تحلیل توسط تکنسین های آزمایشاه و به صورت چشم انجام م شود، که فرآیندی وقت گیر و دارای احتمال خطاهای انسان است .هدف اصل در این پایان نامه به کارگیری روش های پردازش تصویر برای تجزیه و تحلیل و شناسائ ناهنجاری بر روی کروموزوم ها است .برای این منظور، کروموزوم های فرد با استفاده از تکنی های پردازش تصویر مورد بررس قرار گرفته، سپس ناهنجاری های عددی و ناهنجاری های ساختاری هر جفت شناسایی م شود .شناسایی ناهنجاری های عددی و ناهنجاری های ساختاری به ترتیب با شمارش تعداد هر جفت و محاسبه ی طول و تفاوت طول هر جفت کروموزوم و مقایسه آن با آستانه به دست آمده توسط تفاوت طول هر جفت نرمال ، صورت م گیرد .بعد از اعمال روش پیشنهادی بر روی تصاویر برای شناسایی ناهنجاری ها، نتایج حاصل حاک از آن بود که تمام ناهنجاری های عددی قابل شناسایی است و ناهنجاری های ساختاری وابسته به تفاضل طول کروموزوم های هر جفت قابل شناسایی می باشند
To date, around 20,000 chromosomal abnormalities have been reported in laboratory data banks. Although each of these diseases is rare on their own,but they are generally associated with many diseases and deaths of humans. Identification of chromosomal abnormalities is an essential part of the diagnosis and treatment of genetic disorders and a number of cancers. Cytogenetics is the preferred tool for detecting genetic diseases. In cytogenetics, the karyotype, in which the array is based on the chromosomes of a human being and the chromosomes are arranged in accordance with morphological characteristics, are analyzed. At present, this analysis is done by laboratory technicians and by naked eye, which is a time-consuming process with a great possibility of human errors. The main purpose of this thesis is to use image processing methods to analyze and identify chromosomal abnormalities. For this purpose, individual chromosomes are investigated by using image processing techniques then numerical abnormalities and structural anomalies of each pair are identified. Identification of numerical abnormalities and structural abnormalities is done respectively by counting the number of each pair, calculating the length and longitudinal difference of each pair of chromosomes and comparing it with the threshold obtained by the longitudinal difference of each normal pair. After applying the proposed method to the images to identify abnormalities, the results indicated that all numerical abnormalities are identifiable structural abnormalities dependent on the longitudinal difference between the chromosomes of each pair are also identifiable
Karyotype Images using Image Processing Methods