شناسایی بیوملکول براساس خصوصیات ترابردی و نوری مواد دوبعدی
The detection of biomolecule based on transport and optical properties of ۲D material
/مهدیه زینالی
: فیزیک کاربردی
، ۱۳۹۷
، میرزائی
۱۱۹ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
فوتونیک گرایش الکترونیک
۱۳۹۷/۰۶/۱۹
تبریز
در طی دههصی اخیر مواد دو بعدی مانند گرافن و شبه فلزات دی کلکوجنایدی، با توجه به خصوصیات مکانیکی، الکترونیکی و اپتیکی منحصر به فرد، توجه زیادی را به خود جلب کرده اند .در این تحقیق نانوابزارهایی بر پایهصی مواد دوبعدی و نانونوار مولیبدنصدیصسولفید شبیه سازی شده و برای مهندسی ساختار باند آن از روش غیر فعالصسازی لبهصها استفاده کردیم .اخیرا نشان داده شده است به دلیل تحرک پذیری بالای حاملین در این نوع ساختارها ، شناسایی مولکولصها دارای دقت بالاتری است .شناسایی و تشخیص مولکولصها دارای کاربردهای متعددی از جمله تعیین توالی دی ان ای، شناسایی انواع مولکولصهای زیستی ، انواع پروتیئن ها و ... است .در این پایانصنامه از نانونوار مولیبدن دی سولفید که لبه های آن با اتمصهای غیر فلزی مختلف غیر فعال شده است، استفاده کردهصایم و با توجه به نوع غیر فعالصسازی که انجام دادیم، ساختار رفتاری فلزی یا نیم رسانایی از خود نشان میصدهد .بعد از بهینهصسازی ساختار، مولکلولصهای تیمین، سیتوزین و گلوتامین را در فاصله ی مشخصی از نانونوار قرار دادیم و مشاهده کردیم با قرارگیری مولکولصهای زیستی مختلف چگالی حالات کل و ساختار باندی تغییر پیدا میصکند و پیک جذبی متفاوتی به ازای حضور مولکول های مختلف مشاهده شد .با استفاده از پکیج شبیه سازی و محاسباتی کوانتوم اسپرسوو،VNL ، متلب، قوانین و فرمول های حاکم بر فیزیک الکترونیک و نور، از این مواد نظیر ساختار نواری، چگالی حالات کلی(DOS) ، چگالی حالات جزئی(PDOS) ، چگالی الکترونی، طیف جذبی، قسمت موهومی و حقیقی تابع دی الکتریک ،ضریب شکست و ضریب بازتاب محاسبه شده است
2D material, MoS2, Nanoribbon, density functional theory (DFT), DOS, band structure, bio molecule, dielectric function, Absorption, quantum espresso Abstract: Over the past decades, two-dimensional materials, such as graphene transition metal dichalcogenides (TMDs), have attracted a lot of attention due to their unique mechanical, electronic, and optical properties. In this research, Nano-tools based on two-dimensional materials and molybdenum disulfide Nano-ribbon were simulated and we used the edge-passivation method to engineer the band structure. Recently, it has been shown that due to the high sensitivity of the electrical properties of molybdenum disulfide, the identification of molecules using these structures has a higher accuracy coefficient. Identification and detection of molecules with several different applications, including the determination of digital DNA, the identification of various biological molecules, types of proteins, and so on. In this study, molybdenum disulfide Nano-ribbon were used to identify cytosine, thymine and glutamine molecules. By placing the molecules on the molybdenum disulfide nanoribbon, band structure and density of states curve changes. By comparing the band structure and density of states in the absence of any molecules on the nanoribbon, the molecule can be identified by its type of bond with the nanoribbon. Using the simulation and computational quantum Espresso, Visual Nano Lab, MATLAB, rules and formulas the governing electronics and light physics, from materials are calculated such as band structure, total density of state (DOS), partial density of state (PDOS), absorption spectra, real and imaginary parts of the dielectric function and refractive index and reflection
The detection of biomolecule based on transport and optical properties of ۲D material