۱۵۸۳۶پ
per
مطالعات برهم‌کنش مشتقی از ترکیبات هیدرازون با DNA تیموس گوساله
/فرزانه شاکری
: مرکز تحقیقات علوم پایه
، ۱۳۹۵
چاپی
کارشناسی ارشد
بیوفیزیک
۱۳۹۵/۰۶/۲۰
تبریز
برهم‌کنش‌های دارو و DNA به طور وسیع در سال‌های اخیر مطالعه شده است .تکنیک‌های مختلفی برای بررسی این برهم‌کنشها به کار برده می‌شود DNA .به عنوان یک مولکول هدف بزرگ می‌تواند با داروها به طور اختصاصی یا غیراختصاصی برهم‌کنش داشته باشد و عملکردش دستخوش تغییر شود .برهم‌کنش بین مولکول‌های کوچک وDNA ، دو نوع هستند که شامل برهم‌کنش‌های کووالان و غیرکووالان می‌شود .سه حالت بر هم‌کنش غیرکووالان شامل برهم‌کنش‌های الکتروستاتیک، اتصال به شیار و اتصال درجشونده است(۴-(۱-N'-. (E)-هیدروکسی-۳-متوکسی فنیل (اتیلیدن (بنزوهیدرازید(HMEB) ، مشتقی سنتزی از ترکیبات کلاس هیدرازون است که فعالیت‌های بیولوژیکی مختلفی در زمینه بالینی دارد .در مطالعه پیش رو، مکانیسم برهم‌کنش این ترکیب را با DNA تیموس گوسالهDNA) - ( ctدر شرایط pH فیزیولوژیک به وسیله روش‌های طیف‌سنجی مختلف شامل طیف‌سنجی فرابنفش مرئی، فلورسانس و دو رنگ نمایی دورانی(CD) ، اندازه‌گیری‌های ویسکوزیته و داکینگ مولکولی بررسی می‌کنیم .نتایج فرابنفش مرئی نشان داد کهHMEB به طور ترجیحی به شیار کوچکDNA - ctمتصل می‌شود که ثابت اتصال آن (Kb) برابر با ۲ ۱۰۴ L mol - ۱در۲۹۸K بود .داده‌های فلورسانس در دماهای مختلف نشان داد که شدت فلورسانس HMEB در حضورDNA کاهش می‌یابد و خاموشی فلورسانس در نتیجه تشکیل کمپلکس HMEB DNA بوده است بنابراین مکانیسم خاموشی استاتیک است .بر اساس علائم و بزرگی تغییرات آنتالپی = ۱) -۴۹/۸۴۲ kJ mol- (Hو تغییرات آنتروپی۹۶/۸۶۶) -۱ S= -۱K- (J molدر فرآیند اتصال و نتایج داکینگ مولکولی می توان نتیجه گرفت که نیروهای اصلی در برهم‌کنش بین HMEB وDNA- ct، نیروهای واندروالس و پیوند هیدروژنی بوده است .نتایج بررسی‌های CD و ویسکوزیته نشان داد کهHMEB ، صورت‌بندی B ماکرومولکول DNA را آشفته نمی‌کند و ساختار آن را در هم نمی‌ریزد .مطالعات جانشین‌سازی متیلن بلو (MB) بیان‌کننده این بود که HMEB هیچ اثری روی MB متصل شده به DNA نداشت که نشان دهنده اتصال به شیار می‌باشد .این موضوع همچنین با مطالعات جانشین سازی هوخست ۳۳۲۵۸ که یک متصل شونده به شیار است تایید شد
104 L mol-1 at 298K. Fluorescence data at different temperatures revealed that the fluorescence intensity of HMEB is decreased in the presence of DNA and the fluorescence quenching was the result of the formation of the HMEBDNA complex, therefore the quenching mechanism was static. Base on the signs and magnitudes of the enthalpy change (H = -49.842 kJ mol-1) and entropy change ( S = -96.866 J mol-1K-1) in the binding process and the results of molecular docking, it can be concluded that the main interaction forces between HMEB and ct-DNA in the binding process were van der Waals force and hydrogen bonding interaction. The results of CD experiments and viscosity mesurement revealed that HMEB did not disturb native B-conformation of ct-DNA. Methylene Blue (EB) displacement studies revealed that HMEB did not have any effect on MB bound DNA which is indicative of groove binding. This was substantiated by displacement studies with Hoechst 33258, a known minor groove binder DrugDNA interactions have been extensively studied in the recent years. Various techniques have been employed to decipher these interactions. DNA is a major target for a wide range of drugs that may specifically or non-specifically interact with DNA and affect its functions. Interaction between small molecules and DNA are of two types, covalent interactions and non-covalent interactions. Three major modes of non-covalent interactions are electrostatic interactions, groove binding and intercalative binding. (E)-N'-(1-(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)ethylidene)benzohydrazide(HMEB) is a synthetic derivative of hydrazone class compounds that possesses different biological activities in clinical world. In the current study we have examined the interaction mechanism of HMEB with calf thymus DNA (ct-DNA) by using various spectroscopic methods including UVvis absorption, fluorescence and circular dichroism (CD) spectroscopy, viscosity measurement and molecular docking. UVvis absorption results revealed that HMEB preferred to bind to the minor groove of ct-DNA with the binding constant (Kb) of 2
شاکری، فرزانه
قلی‌زاده، اشرف، استاد راهنما
دهقان، غلامرضا، استاد راهنما
سیاه و سفید
نمایه‌سازی قبلی
