Determining the Effects of Lichen and Endolichenic Bacteria Extracts on Pseudomonas aeruginosa Quorum Sensing and Biofilm Form
[Thesis]
Başaran, Tunahan Irmak
Sesal, Nüzhet Cenk
Marmara Universitesi (Turkey)
2019
187 p.
Master's
Marmara Universitesi (Turkey)
2019
Pseudomonas aeruginosa fırsatçı patojeninin antibiyotiklere karşı geliştirdikleri dirençler, insan sağlığına ciddi tehdit oluşturmaktadır. Oluşturdukları biyofilm sayesinde antibiyotiklere karşı direnç kazanabilmekte ve kronik enfeksyonlara sebep olarak ölümcül zararlar verebilmektedir. Biyofilm oluşumunu ve virulans faktörlerin salınımını quorum sensing (QS) mekanizmasını aktive ederek kontrol edebildiği bilinmektedir. Ayrıca, P. aeruginosa üzerinde ölüm stresi yaratmadan hücreler arasındaki iletişimin ve QS bağlantılı biyofilm formunun doğal kaynaklardan elde edilebilen metabolitlere inhibe edilebileceği literatürde yer almaktır. Bu bağlamda çalışmamızda, özgün sekonder metabolitleri ürettiği ve bunlardan bazılarının antimikrobiyal etki gösterdiği tespit edilen liken ve endolikenik bakteri (ELB) özütlerinin quorum sensing inhibitörü (QSI) potansiyelleri araştırılmıştır. Bursa, Bolu ve Kastamonu bölgelerinden toplanan likenlerin aseton ve likenlerin talluslarından izole edilen ELB'lerin etil asetat özütlerinin QS mekanizması ve biyofilm formu üzerine etkileri incelenmiştir. Çalışmamızda, Pseudevernia furfuracea, Platismatia glauca ve Parmelia sulcata likenlerinin morfolojik tür tayinleri yapılmış ve talluslarından ELB'ler izole edilmiştir. ELB'lerin moleküler tür tayinleri yapılmış ve çoğunluğu Bacillus cinsi bakteriler ile benzerlik göstermiştir. Moleküler tanımlama sonrası, likenlerin ve ELB'lerin özütleri elde edilmiştir. Özütlerin antibakteriyel ve antibiyofilm etkilerinin belirlenebilmesi için P. aeruginosa PAO1 suşu üzerinde, QS inhibisyonu oranlarının belirlenebilmesi için lasB-gfp, rhlA-gfp ve pqsA-gfp suşları üzerinde testler yapılmıştır. Elde edilen verilere göre, liken ve ELB özütlerinin potansiyel QSI özellikte olabilecekleri ve bu tez çalışmasının literatüre katkı sağlayarak gelecekteki çalışmalara ışık tutacağı düşünülmektedir.