Investigation of circRNA expression levels as potential biomarkers in breast cancer
بررسی سطوح بیان circRNA به عنوان نشانگرهای زیستی بالقوه در سرطان پستان
[Dissertation]
RANGARIRAI MAKUKU
رنگاریرای ماکوکو
Tehran University of Medical Sciences, Medicine school
2022
95p
Doctor of Medicine(MD)
2022/05/08
Background and aim: Female breast cancer has recently surpassed lung cancer as the most commonly diagnosed cancer in both sexes and the leading cause of cancer deaths in women. Affordable and more accurate screening services will improve the efficiency and universal accessibility of BC screening services. Novel biomarkers such as circular RNAs (circRNAs) that facilitate the diagnosis and treatment of breast cancer are required to assist the goal of reducing mortality of breast cancer. In this study, we assessed the expression of four circRNAs in breast cancer. Method: Tumor tissues and adjacent normal tissues were obtained from 39 patients with sporadic breast cancer. Divergent primers were designed to amplify the target transcripts of circCSPP1 (hsa_circ_0001806), circNRIP1 (hsa_circ_0004771), circSMAD2 (hsa_circ_0000847), and circFOXP1 (has_circ_0008234) by quantitative real-time PCR. Sanger sequencing was performed to verify the back-splicing junction and the circular structure of circRNAs. The expression level of circRNAs in tumor tissues compared with adjacent normal tissues and the association between the expression of circRNAs and clinicopathological characteristics were analyzed. Results: We observed significant upregulation of circCSPP1, circNRIP1, and circSMAD2 while the upregulation of circFOXP1 was not statistically significant. The top upregulated circRNA was circNRIP1 in our study. There was a significantly higher expression of circCSPP1 in estrogen receptor (ER) negative, progesterone receptor (PR), and HER2 negative subgroups and a significantly higher expression of circNRIP1 in ER-negative subgroup. Conclusion: Our study revealed the upregulation of circCSPP1 circNRIP1 and circSMAD2 in breast cancer tissue. These circRNAs can be potential biomarkers for breast cancer. Further studies to determine their level in serum samples of patients with breast cancer and their evaluation as a diagnostic or predictive biomarker are required.
مقدمه و هدف: (Introduction): سرطان پستان زنان اخیراً از سرطان ریه به عنوان شایع ترین سرطان تشخیص داده شده در هر دو جنس و عامل اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در زنان پیشی گرفته است. خدمات غربالگری مقرون به صرفه و دقیق تر، کارایی و دسترسی جهانی به خدمات غربالگری سرطان پستان را بهبود می بخشد. نشانگرهای زیستی جدیدی مانند RNA های حلقوی (circRNAs) که تشخیص و درمان سرطان پستان را تسهیل می کنند، برای کمک به هدف کاهش مرگ و میر سرطان پستان مورد نیاز هستند. در این مطالعه، بیان چهار circRNA را در سرطان پستان ارزیابی کردیم.روش (Methodology) از 39 بیمار مبتلا به سرطان پستان پراکنده، بافت های تومور و بافت های طبیعی مجاور آن به دست آمد. آغازگرهای واگرا برای تقویت رونوشت های هدف circCSPP1 (hsa_circ_0001806)، circNRIP1 (hsa_circ_0004771)، circSMAD2 (hsa_circ_0000847)، و circFOXP1 (has_circ. توالییابی سانگر برای تأیید اتصال پسپیچ و ساختار دایرهای circRNAها انجام شد. سطح بیان circRNA ها در بافت های تومور در مقایسه با بافت های طبیعی مجاور و ارتباط بین بیان circRNA ها و ویژگی های بالینی آسیب شناسی مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها (Results): ما دخیل قابل توجهی در circCSPP1، circNRIP1، و circSMAD2 مشاهده کردیم در حالی که تنظیم مثبت circFOXP1 از نظر آماری معنیدار نبود. circRNA بالا تنظیم شده در مطالعه ما circNRIP1 بود. بیان بیشتر circCSPP1 در زیرگروه های گیرنده استروژن (ER) منفی، گیرنده پروژسترون (PR) و HER2 منفی و بیان قابل توجهی بالاتر circNRIP1 در زیرگروه ER منفی وجود داشت. نتیجه گیری (Conclusion): مطالعه ما دخیل بودن circCSPP1 circNRIP1 و circSMAD2 را در بافت سرطان پستان نشان داد. این circRNA ها می توانند نشانگرهای زیستی بالقوه ای برای سرطان سینه باشند. مطالعات بیشتری برای تعیین سطح آنها در نمونه های سرمی بیماران مبتلا به سرطان پستان و ارزیابی آنها به عنوان یک نشانگر زیستی تشخیصی یا پیش بینی مورد نیاز است.
breast cancer
سرطان پستان
circular RNA
RNA دایره ای
circCSPP1
circNRIP1
circSMAD2
circFOXP1
Estrogen receptor
گیرنده استروژن
گیرنده پروژسترون
Progesterone receptor
HER2
triple negative
سه بار منفی
, Author
, Author
MAKUKU, RANGARIRAI
ماکوکو، رنگاریرای
, Thesis advisor
, Thesis advisor
, Consulting advisor
, Consulting advisor
Rezaei, Nima
رضایی، نیما
Mosadeghrad, Ali Mohammad
مصدق دار، علی محمد
Tehran University of Medical Sciences, Medicine school