عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
محل استقرار
۹۸۱۸۲پ
فارسی
انتخاب MicroRNA جدید به عنوان بیومارکر تشخیصی سرطان پانکراس با استفاده از روش Systems biology
[پایان نامه]
مریم عبدی
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
۱۳۹۹
کارشناسی ارشد
زیست فناوری پزشکی
PC) Pancreatic cancer) یک بیماری تهاجمی و بسیار مرگبار می باشد. فقدان بیومارکرهای مناسب برای تشخیص وضعیت بیماران محدودیتی برای درمان به موقع ایجاد می کند و به همین دلیل نرخ بقای آن در 30 سال گذشته بهبود چشمگیری نیافته است. امروزه نقش miRNAs) microRNAs) در گردش، به عنوان دسته ای از تنظیم کننده های ژن که باعث رشد، تمایز و آپوپتوز می شوند بسیار مورد توجه قرار گرفته و یک کلاس جدید از بیومارکرهای غیرتهاجمی را برای تشخیص PC ایجاد کرده است.هدف ما در این مطالعه بررسی پروفایل بیانی miRNAs درگیر درPC با استفاده از رویکرد Systems Biology و ساخت شبکه زیستی بوده تا مطالعه عناصر و اجزای تشکیل دهنده ی چنین ساختارهای پیچیده ای آسانتر شده و تاثیر و اهمیت اجزا بر یکدیگر با منطق بیشتری قابل تجزیه و تحلیل باشد و در نهایت منجر به شناسایی بیومارکری مناسب در پلاسمای بیماران PC برای تشخیص زودهنگام بیماری شود.مواد و روش کار: به این منظور پس از بررسی پروفایل بیانی miRNAs درگیر در PC از سایت های GEO و Array express ، 5 dataset انتخاب شد و مراحل pre-processing این داده ها با استفاده از نرم افزار MATLAB (R2016b) برای کاندید کردن miRNAs با بیشترین تغییرات پروفایل بیانی انجام شد و پس از پردازش، نرمالیزاسیون و فیلتر کردن داده های آرایه خام و مقایسه نمونه های PC در مقابل نمونه های سالم، miRNA های up و down-regulated در هر Dataset مشخص شدند.شبکه زیستی با استفاده از ابزار Cytoscape به منظور تجزیه و تحلیل و آنالیز مسیرها و Gene ontology (GO) ساخته شد.در مرحله بعدی، مطالعات آزمایشگاهی برای تایید نتایج بیوانفورماتیکی بر روی 11 نمونه پلاسمای بیماران دارای PC و 22 نمونه پلاسمای افراد سالم به عنوان کنترل صورت گرفت، با استخراج RNA و استفاده از qRT-PCR، اندازه گیری سطح بیان miRNAs کاندید شده در نمونه های پلاسما انجام شد.نتایج: نتیجه بدست آمده صحت مطالعات Systems Biology را نشان داد که بر طبق آن سطح بیان miR-135b و miR-222-3p افزایش یافته و بدین ترتیب میتوان نقش up-regulated این دو miRNA را در انتخاب آنها به عنوان بیومارکرهایی مناسب جهت تشخیص PC درمراحل اولیه بیماری درنظر گرفت.کلمات کلیدی: سیستم بیولوژی; سرطان پانکراس; نشانگرهای زیستی; پلاسما; miRNAs
لوزالمعده
Pancreas
a09
a09
Micro RNA
System Biology
سرطان پانکراس
، پدیدآور
عبدی، مریم
، استاد راهنما
، استاد راهنما
، استاد مشاور
عسگری، یزدان
طاوسی دانا، غلامرضا
روشن، نادر
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
ایران
20220924
۲۳۲۱ف
دانشگاه علوم پزشکی تهران، کتابخانه دانشکده پزشکی
p
TF
92029
a
Y
