پردیس کشاورزی و منابع طبیعی در سال ۱۳۰۱ با نام مدرسه عالی فلاحت تاسیس گردید. در سال ۱۳۰۹ کتابخانه مدرسه عالی فلاحت در بنای قدیمی سلیمانیه راه اندازی شد و در آن تا سال ۱۳۱۸ حدود هزار جلد کتاب جمع آوری شد. پس از الحاق دانشکده کشاورزی (دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی فعلی) به دانشگاه تهران در سال ۱۳۲۴ ، در طبقه دوم ساختمان امور دانشجویان اقدام به ساخت فضای مناسب کتابخانه شد.

در سال ۱۳۳۹ تا ۱۳۴۱ یک مشاور کتابداری از آمریکا در راه اندازی کتابخانه انجام وظیفه نموده است. از سال ۱۳۴۷ ساختمان کتابخانه مرکزی دانشکده کشاورزی با زیربنای ۷۰۰۰ متر مربع مطابق با استانداردهای کتابخانه ای آن زمان با سیستم بسته دسترسی به مخازن کتاب و بر اساس نقشه کتابخانه و مرکز اسناد ورسای پاریس در هشت طبقه ساخته شد که در سال ۱۳۵۰ به پایان رسید. این کتابخانه در حال حاضر، «کتابخانه مرکزی دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران» نام دارد. درتابستان سال ۱۳۸۵ کتابخانه مرکزی به سیستم دسترسی باز به مخازن تغییر حالت داد و تمامی کتابهای فارسی و لاتین از طبقات برج به طبقه همکف انتقال یافت. در خال حاضر طبقات برج کتابخانه به ترتیب به بخشهای منابع مرجع (ط 1)، خدمات فنی کتابهای فارسی و بخش آرشیو اسناد (ط 2)، خدمات فنی کتابهای لاتین و کار روی منابع نفیس و قدیمی (ط 3)، پایان‌نامه ها (ط 4)، و نشریات (ط 6) اختصاص یافته است

.