بررسی توزیع توالی اللی بسیار بلندRepeat - CAپروموتر مرکزی ژنNHLH ۲ در بیماران آلزایمری و گروه کنترل
نام عام مواد
[پایاننامه]
عنوان اصلي به زبان ديگر
COMPARISON OF ALLELIC DISTRUBUTION OF THE EXCEPTIONALLY LONG NHLH2 CORE PROMOTER CA-REPEATIN ALZHEIMER'S DISEASE V.S CONTROL POPULATION
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitationscience))
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۶
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۸۶ص.
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دکترا
نظم درجات
سالمندی Aging))
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۶/۰۶/۲۹
کسي که مدرک را اعطا کرده
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitationscience))
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
بزرگ شدن استثنایی مغز انسان در مقایسه با سایر گونهها، با مصرف بیش از حد گلوکز و انرژی دریافتی ارتباط دارد که منجر به اختلالات مرتبط با مکانیسمهای تطابقی مثل دیابت نوع دو و آلزایمر میگردد .به تازگی شناسایی" توالیهای کوتاه تکراری بسیار بلند "در ناحیهی مهم و حساس بین +۶تا -۶۲۱جفت باز از نقطه شروع رونویسی در ژنهای کد کننده پروتئین انسانی آغاز شده است .طولانی شدن یک توالی در طی روند تکامل میتواند شواهدی از مزیت انتخابی( (Selective Advantage در گونه انسان را نشان دهد .در این مطالعه روند تکاملی یکی از طولانیترینRepeat- CAهای شناخته شده در پروموتر مرکزی ژنهای کد کننده پروتئین انسانی واقع در ژنNHLH ۲گزارش خواهد شد .آنالیزهای بیوانفورماتیک بر اساس پایگاه اطلاعاتیEnsemble طولانی شدن این توالی واقع در پروموتر مرکزی( (Transcript ID: ENST ۱.۰۰۰۰۰۳۶۹۵۰۶را در طی روند تکامل به خوبی نشان میدهد .توزیع توالی اللی اینRepeat- CAدر ۲۱۱انسان شامل ۶۱۱فرد آلزایمری و ۶۹۱فرد سالم مورد بررسی قرار گرفت .نتایج این مطالعه وجود یک موتاسیون جدیدC>T در ناحیه پایین دست اینRepeat- CAو در فاصله -۱از نقطه شروع رونویسی را نشان داد .در این مطالعه، به طور کلی یک اختلاف معنادار بین تعداد ژنوتیپ هایی که دارای حداقل یک الل استثنایی بودند در نمونههای آلزایمر و گروه کنترل مشاهده گردید > (.(P value ۰۴.۰ ژنوتیپهای ۲۱/۲۱،۶۳/۲۱،۶۳/۲۹و ۲۱/۲۶نیز فقط در نمونههای آلزایمر دیده شد( (Disease Onlyکه از این میان، ارتباط ژنوتیپ ۶۳/۶۳با ابتلا به آلزایمر معنادار بود > ( .(Mid P, P value ۰۲۶.۰در گروه شاهد نیز ژنوتیپهای ۲۱/۶۳ ۶۱،/۲۹و ۶۳/۲۶مختص گروه شاهد بوده و در گروه آلزایمر مشاهده نشد ((Control Only که ارتباط معناداری با حفاظت در برابر بیماری آلزایمر نشان ندادند<(. (Mid P, P value۰۵.۰ کلیدواژه ها :مزیت انتخابی، توالی کوتاه تکراری، ،NHLH۲آلزایمر،Repea- , CA
متن يادداشت
n this thesis, the exceptional growth of the human brain in comparison with other species has been association with the overconsumption of glucose and calorie intake, which, in turn, have led to disorders linked to the required adaptive mechanisms e.g. type II diabetes mellitus and Alzheimers disease (AD). Recently has started identification of exceptionally long short tandem repeat in the critical interval between the -120 to 1 of the transcription start site. Across the human protein-coding genes, expansion of a number of which may confer selective advantage to the human species. In the present study we report the evolutionary status of one of the longest CA-repeats identified in a human protein-coding gene core promoter, belonging to NHLH2. We report that a human specific transcript of NHLH2 contains this exceptionally long CA-repeat in its core promoter (transcript ID: ENST00000369506.1). The bioinformatics analysis based on the ensemble database revealed that this CA-repeat is directionally expanded in humans. The allelic distribution of the CA-repeat and immediate SNP were investigated by sequencing of a total of 300 human subjects consisting of AD (n=105) and matched controls (n=135).A novel C>T mutation hotspot was also detected at the immediate downstream of this CA-repeat at -4 to the TSS. In this study, there was a significant difference between the number of genotypes with at least one exceptional allele between Alzheimer's and Control groups (P value <0.04). In this study, 19/19, 20/23, 20/24 and 21.25 genotypes were only found in Alzheimer's (Disease Only) genotype. Among them, genotype 19/19 was significantly associated with Alzheimer's disease (Mid P, P value <0.026). In the control group, only 18/23, 19/20 and 19/21 genotypes were found and not observed in the Alzheimer's group (Control Only). Among them did not show significant correlation with protection against Alzheimer's disease (Mid P, P value> 0.05). Keywords: Selective Advantage, STR, NHLH2, Alzheimer, CA- Repeat, SNP
خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه
ba
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
COMPARISON OF ALLELIC DISTRUBUTION OF THE EXCEPTIONALLY LONG NHLH2 CORE PROMOTER CA-REPEATIN ALZHEIMER'S DISEASE V.S CONTROL POPULATION
موضوع (اسم عام یاعبارت اسمی عام)
موضوع مستند نشده
Selective Advantage
مقوله موضوعی
متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی
مزیت انتخابی
متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی
توالی کوتاه تکراری
متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی
Selective Advantage
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )