عنوان

شناسایی واریانت‌های ژنی نادر اختلال طیف اوتیسم از نوع فامیلیال در ۵ خانواده در جمعیت آذری آذربایجان شرقی با روش توالی یابی کل اگزوم

کد کشور

IR

شماره

۲۷۳۵پ

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

فارسی

کشور محل نشر

IR

عنوان اصلي

شناسایی واریانت‌های ژنی نادر اختلال طیف اوتیسم از نوع فامیلیال در ۵ خانواده در جمعیت آذری آذربایجان شرقی با روش توالی یابی کل اگزوم

نام عام مواد

[پایان‌نامه]

عنوان اصلي به زبان ديگر

Identification of rare genetic variants in Familial Autism Spectrum Disorder in five families from Azeri population in East Azarbaijan using Whole Exome Sequencing technique

نام ناشر، پخش کننده و غيره

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ۱۳۹۷

نام خاص و کميت اثر

۲۰۷ص.

متن يادداشت

پیوست

متن يادداشت

چاپی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

ژنتیک انسانی Genetic))

زمان اعطا مدرک

۱۳۹۷/۰۷/۰۸

کسي که مدرک را اعطا کرده

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

متن يادداشت

مقدمه و اهداف :اختلال طیف اوتیسم (ASD) با سه علامت اصلی شامل اختلال در تعامل و ارتباطات متقابل اجتماعی، الگوی رفتار تکراری و یا علایق محدود در اوایل دوران کودکی مشخص می‌شود .شیوع ASD در کودکان مذکر بیشتر از مونث است .اوتیسم به عنوان یک اختلال پیچیده رشد عصبی، به علت هتروژنی بالا، شدت و فنوتیپ‌های آن از یک بیمار به بیمار دیگر متفاوت است .ژنتیک نقش مهمی( ۶۲) در علل اوتیسم دارد .در این مطالعه، ما خانواده‌های ترک آذری دارای ASD فامیلیال را جهت شناسایی واریانت‌های ارثی احتمالی ایجاد کننده بیماری های مرتبط با ASD را مورد بررسی قرار دادیم .روش اجرا :ما افراد مبتلا به بیماری را کاریوتایپ کردیم تا مواردی که دارای اختلالات کروموزومی هستند را حذف کنیم .سپس، توالی یابی کل اگزوم (WES) را در پنج مورد از شکل فامیلیال ASD غیر سندرمی انجام دادیم .در مرحله بعد، با استفاده از روش توالی یابی سنگر آنالیزsegregation - coبرای ژن‌های نامزد در پروباند و دیگر افراد خانواده انجام دادیم .یافته ها :با استفاده از تکنیک توالی یابی کل اگزوم، ما سه واریانت احتمالی مسبب بیماری و مرتبط با فنوتیپ بیمار را در یک خانواده شناسایی کردیم .این سه واریانت از نوع بدمعنی و هوموزیگوت در ژنFBN ۱_(NM ۰۰۰۱۳۸c.G ۵۴۴۳A:p.G۱۸۱۵_S) TF (NM۰۰۱۰۶۳c.C ,۱۰۲۷T:p.R۳۴۳ W)وPLOD ۲_(NM ۱۸۲۹۴۳c.A ,۳۸۲G:p.K۱۲۸ E)قرار دارند .هر سه واریانت در اعضای خانوادهsegregate - coشدند و هر دو برادر مبتلا فنوتیپ‌های مرتبط با این سه واریانت را نشان می‌دهند .همچنین نقشه برداری ژنتیکی با استفاده از آرایه SNP یافته‌های ما را تایید کرد .نتیجه گیری :در این مطالعه، استفاده از تکنیک WES را در افراد مبتلا به بیماری های پیچیده و هتروژن نظیر اوتیسم را توصیف کردیم .از همه مهمتر نشان دادیم زمانی که فنوتیپ پیچیده است، WES می‌تواند تعداد قابل توجهی از واریانت‌های مربوطه را شناسایی کند که نشان دهنده فنوتیپ رشد عصبی و سایر فنوتیپ‌های حاضر در بیماران است .با این حال، استفاده از خانواده‌های بزرگ با چندین فرد مبتلا می‌تواند در شناسایی واریانت‌ها مسبب چنین بیماری‌های هتروژن و پیچیده مفید باشد .کلید واژه‌ها :اختلال طیف اوتیسم،FBN ۱،PLOD ۲،TF ، SNPژنوتایپینگ، توالی یابی کل اگزوم

متن يادداشت

Introduction and Objectives: Autism spectrum disorder (ASD) is characterized by three core symptoms with impaired reciprocal social interaction and communication, a pattern of repetitive behavior and/or restricted interests in early childhood. The prevalence is higher in male children than in female children. As a complex neurodevelopmental disorder, the phenotype and severity of autism are extremely heterogeneous with differences from one patient to another. Genetics has a key role (62 ) in the etiology of autism. In this study, we investigated Azeri Turkish families with familial ASD to identify possible inherited disease-causing variants related to ASD. Methods: We karyotyped the affected individuals in order to exclude the cases having chromosomal abnormalities. Then, we carried out whole exome sequencing (WES) in the five familial form of the non-syndromic ASD cases and implemented co-segregation analysis for the candidate genes in the proband and other individuals of the families using Sanger sequencing. Results: Using whole exome sequencing technique, we identified three possible causative variants in one family. These three homozygous missense variants NM_000138 c.G5443A:p.G1815S, NM_001063 c.C1027T:p.R343W and NM_182943 c.A382G:p.K128E lie in FBN1, TF and PLOD2 genes, respectively. All of the variants co-segregated in the family and both affected siblings manifest the phenotypes associated with these three variants. Homozygosity mapping using SNP array also confirmed our findings. Conclusions: Our study highlights the utility of WES in individuals of highly heterogeneous complex disease like autism. Importantly, we showed that when the phenotype is complex, WES can help identifing towards relevant variants that explain neurodevelopmental and other phenotypes of patients. However, larger family sibs with affected branch family members can be of benefit in narrowing down the causative variants in such heterogeneous and complex disorders. Keywords: Autism spectrum disorder, FBN1, PLOD2, TF, SNP genotyping, whole exome sequencin

خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه

ba

عنوان اصلي به زبان ديگر

Identification of rare genetic variants in Familial Autism Spectrum Disorder in five families from Azeri population in East Azarbaijan using Whole Exome Sequencing technique

موضوع مستند نشده

Autism spectrum disorder

متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی

اختلال طیف اوتیسم

متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی

Autism spectrum disorder

مستند نام اشخاص تاييد نشده

فرج زاده ولیلو، سعید

مستند نام اشخاص تاييد نشده

Farajzadeh Valilou,Saeed

مستند نام اشخاص تاييد نشده

بهجتی، فرخنده

مستند نام اشخاص تاييد نشده

کروزبی، اندر

مستند نام اشخاص تاييد نشده

شفقتی، یوسف

مستند نام اشخاص تاييد نشده

علوی، آفاق

کشور

ایران

سازمان

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

نام ميزبان

2735t.pdf

شماره دسترسي

محرمانه

اطلاعات مختصر

محرمانه

تاريخ و ساعت مذاکره و دسترسي

2735t.pdf

بيت در ثانيه

6406088

ارتباط براي تسهيلات دسترسي

مرجع

نوع فرمت الکترونيکي

متن

اندازه فايل

0

شماره کنترل رکورد

۵۳۷۲پ

شماره فيلد فرمت مبدا

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی

فرمت انتشار

چاپی-الکترونیکی

نوع ماده

TF

پیشوند ISBD اعمال شده است

1

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y