عنوان

شناسایی واریانت های نادر در پنج بیمار ایرانی مبتلا به اتیسم با استفاده از روش ترادف یابی تمام اگزوم

کد کشور

IR

شماره

۲۶۰۸پ

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

فارسی

کشور محل نشر

IR

عنوان اصلي

شناسایی واریانت های نادر در پنج بیمار ایرانی مبتلا به اتیسم با استفاده از روش ترادف یابی تمام اگزوم

نام عام مواد

[پایان‌نامه]

عنوان اصلي به زبان ديگر

Identification of Rare variants in Five Iranian patients with Autism using whole exome sequencing (WES)

نام ناشر، پخش کننده و غيره

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ۱۳۹۶

نام خاص و کميت اثر

ط،۱۸۴ص.

متن يادداشت

پیوست

متن يادداشت

چاپی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

ژنتیک انسانی Genetics

کسي که مدرک را اعطا کرده

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))

متن يادداشت

اتیسم از جمله اختلالات پیچیده رشد عصبی است که هم از لحاظ ژنتیکی و هم از لحاظ فنوتیپی هتروژن است و با دو علامت عمده که اغلب قبل از سه سالگی بروز می یابند مشخص می شود ۱- نقص در ارتباطات و تعاملات اجتماعی ۲- علایق و رفتارهای کلیشه ای و محدود .شیوع این اختلال در جوامع مختلف حدود ۱ است و در مردان تقریبا پنج برابر بیشتر از زنان دیده می شود .مطالعات روی خانواده ها و دوقلوها شواهد قوی از دخالت عوامل ژنتیکی در اتیولوژی اتیسم نشان داده است .تا به امروز علت حدود ۲۰-۲۵ درصد موارد اتیسم از لحاظ ژنتیکی مشخص شده است و علت بیش از ۷۰ درصد موارد هنوز شناخته نشده است .بعد از دهه ها مطالعه با رویکردهای مختلف نظیر مطالعات همراهی ، آنالیز پیوستگی و مطالعات ژن کاندید ژن های نادر با نفوذ بالا، ناهنجاری های کروموزومی نادر، ژن های مرتبط با حالات سندرمیک اتیسم و واریانت های ساختاری زیادی در ارتباط با اتیسم شناسایی شده است .این حقیقت که هیچ عامل ژنتیکی علت بیش از یک درصد موارد اتیسم را در بر نمی گیرد نشانگر هتروژنی ژنتیکی بسیار بالا در این بیماری و چالش های پیش رو در شناسایی ژن های مسبب آن است .هدف این مطالعه شناسایی ژن های کاندید اتیسم از طریق آنالیز واریانت های نادر در خانواده های چندموردی یا حاصل از ازدواج خویشاوندی بود .ما توالی یابی کل اگزوم را بر روی پنج فرد مبتلا از پنج خانواده انجام دادیم و واریانت های نادر یا گزارش نشده ای که پیش بینی می شد پاتوژن باشند و در خانواده نیز همراه با فنوتیپsegregate - coمی شد، را مورد توجه قرار دادیم .در میان این واریانت ها یک واریانت تک نوکلئوتیدی جدید بدمعنی و هموزیگوت در ژنRAPGEF ۱_(NM ۰۰۵۳۱۲c.C :۶۱۷T: p.T۲۰۶ I)در یک خانواده با دو فرزند مبتلا حاصل از ازدواج خویشاوندی شناسایی شد که در اعضای خانوادهsegregte - coگردید .نتایج ما نشان می دهد که این واریانت ممکن است در اتیولوژی ژنتیکی اتیسم نقش داشته و یا حداقل به عنوان یک ریسک واریانت در افزایش خطر ابتلا به اتیسم مطرح باشد .به هر حال به طور کل یافته های ما نشان می دهد که به دلیل هتروژنی بسیار بالا و معماری پیچیده در ژنتیک اختلالات طیف اتیسم، اثبات ارتباط جهش های نادر جدید با اتیسم در خانواده های کوچک بسیار دشوار است و برای شناسایی جهش های مغلوب، می بایست خانواده های بزرگتر با تعداد افراد مبتلا و سالم زیاد و دارای انشعاب های مختلف دربرگیرنده افراد مبتلا مورد توجه قرار گیرند .کلیدواژه ها :اختلالات طیف اتیسم، توالی یابی کل اگزوم، واریانت های نادر، اختلالات رشدی عصبی

متن يادداشت

Autism spectrum disorder (ASD) is a complex and common neurodevelopmental disorder that is both genetically and phenotypically heterogeneous. It's characterized by deficits in two core domains: 1-social interaction and communication, 2- repetitive, restrictive behaviors and interests. The age of onset is usually before three years. It affects about 1 of the population and is five times more common in males than in females. ASD has a strong genetic basis. Family and twin studies have provided strong evidence that genetic factors have a major role in the etiology of ASD. However the ASD heritability is estimated to be 0.79-0.87. To date, the genetic cause of ASD is recognized in only 20-25 of cases, while the rest is still unknown. After decades of efforts, genome-wide linkage and association studies, and candidate gene approaches have identified many ASD-related syndromic genes, rare penetrant genes, chromosome abnormalities and structural variants.The fact that no single genetic aberration accounts for more than 1 of cases suggests extreme genetic heterogeneity , posing a major challenge in identifying causative genes. The aim of this study was to uncover new ASD candidate genes by analysing the rare variants in multiplex families including consanguineous marriage. We performed WES on 5 individuals, considering those variants which were either rare or not reported in different public databases. These variants were predicted to be damaging and co-segregating in the affected siblings. Among these variants, one homozygous missense novel SNV in RAPGEF1 gene (NM_005312:c.C617T:p.T206I) was inherited by two affected siblings from normal parents with consanguineous marriage in one family, co-segregateing with ASD. These results suggest that RAPGEF1:c.C617T:p.T206I may play a role in the genetic etiology of ASD, at least as an ASD-associated risk variant candidate. However, in general our findings show because of high heterogeneity and complex architecture in autism genetics it is very difficult to prove the relevance of new rare mutations for ASD in small families. For the identification of recessive mutations, more extended and branched-families with several affected individuals should be considered. Keywords: Autism Spectrum Disorders, Whole Exome Sequencing, Rare Variants, Neurodevelopmental Disorders

خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه

ba

عنوان اصلي به زبان ديگر

Identification of Rare variants in Five Iranian patients with Autism using whole exome sequencing (WES)

موضوع مستند نشده

Autism Spectrum Disorders

متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی

اختلالات طیف اتیسم

متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی

Autism Spectrum Disorders

مستند نام اشخاص تاييد نشده

کریمیان، جواد

مستند نام اشخاص تاييد نشده

Karimian, Javad

مستند نام اشخاص تاييد نشده

بهجتی، فرخنده

مستند نام اشخاص تاييد نشده

علوی، آفاق

کشور

ایران

سازمان

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

نام ميزبان

2608x.pdf

شماره دسترسي

محرمانه

اطلاعات مختصر

محرمانه

تاريخ و ساعت مذاکره و دسترسي

2608x.pdf

بيت در ثانيه

5139991

ارتباط براي تسهيلات دسترسي

مرجع

نوع فرمت الکترونيکي

متن

اندازه فايل

0

شماره کنترل رکورد

۸۰۶۲ط

شماره فيلد فرمت مبدا

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی

فرمت انتشار

چاپی-الکترونیکی

نوع ماده

TF

پیشوند ISBD اعمال شده است

1

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y