عنوان

تعیین ناقلی برای دیستروفی های عضلانی اتوزومی مغلوب با استفاده از روش توالی یابی کل اگزون ها

کد کشور

IR

شماره

۲۰۴۸پ

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

فارسی

کشور محل نشر

IR

عنوان اصلي

تعیین ناقلی برای دیستروفی های عضلانی اتوزومی مغلوب با استفاده از روش توالی یابی کل اگزون ها

نام عام مواد

[پایان‌نامه]

عنوان اصلي به زبان ديگر

Carrier Detection in Autosomal Recessive Muscular Dystrophies in Human Genome by Next Generation Sequencing

نام ناشر، پخش کننده و غيره

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ۱۳۹۳

نام خاص و کميت اثر

و،۱۵۹ص.

متن يادداشت

پیوست

متن يادداشت

چاپی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

ژنتیک انسانی Genetic Human

کسي که مدرک را اعطا کرده

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

متن يادداشت

دیستروفی عضلانی، از شایع ترین اختلالات ارثی در سطح جهان و دومین معلولیت ژنتیکی شایع در ایران است .این گروه بیماری ها با ضعف پیشرونده ی ماهیچه ها همراه است و تاکنون درمان قطعی برای هیچ یک از شکل های آن شناخته نشده است .در کشور ما، به دلیل نرخ بالای ازدواج های خویشاوندی، دیستروفی های عضلانی با توارث اتوزوم مغلوب شیوع بالاتری نسبت به سایر کشورها دارد .از این رو به دلیل تنوع ژنتیکی ژن های مسئول و اهمیت بیماری، مسئله ی پیش بینی ناقل بودن والدین ایده ای ایمنی بخش محسوب می شود .هدف ما انجام توالی یابی کل اگزوم برای یک فرد نرمال و بررسی ژن های مسبب دیستروفی عضلانی اتوزومی مغلوب از نظر ناقلی برای نسل بعد می باشد .روش بررسی با توالی یابی کل اگزوم به روش توالی یابی نسل بعد، 285 واریانت در حدود 50 ژن MD دیده شد .تغییرات فاقد اهمیت عملکردی شامل واریانت های هموزیگوت، واریانت های با فاصله ی+ 2- جفت باز از ژن هایMD ، واریانت های همنام و واریانت های با فرکانس اللی بالای 1 حذف شدند .سپس عملکرد واریانت های باقی مانده از طریق ابزار های بیوانفورماتیکی مانند CADD و dbNSFP مورد ارزیابی قرار گرفت .کیفیت واریانت های باقی مانده توسط نرم افزار IGV بررسی شد و میزان پوشش دهی برای واریانت ها محاسبه شد .یافته ها در نهایت با مقایسه واریانت ها با بانک ژنومی جمعیت ایرانی و حذف واریانت ها ی شایع به دو واریانت بالقوه بیماری زا در ژن هایTTN و ITGA7 رسیدیم .نتایج توسط توالی یابی سنگر تایید شد .نتیجه گیری روش توالی یابی کل اگزوم در یک فرد نرمال از جامعه عملی گردید و دو واریانت بیماریزا در این فرد شناسایی شد .با در دست داشتن وضعیت ناقلی یک والد، والد دوم را از لحاظ ناقلی در ژن های مزبور چک کرده و با بررسی های پیش و حین بارداری، امکان پیش بینی تولد فرزند بیمار فراهم می شود .البته تشخیص جهش های موجود در میتوکندری، جهش های ساختاری مانند ترانس لوکاسیون و واژگونی و حذف و اضافه های بزرگ با این روش قابل شناسایی نیستند .در نتیجه روش توالی یابی کل اگزوم می تواند به شکل یک روش مکمل در کنار روش های دیگر برای تعیین ناقلین مورد استفاده قرار گیرد .همچنین در مورد جهش هایی که در حیطه ی تشخیص این روش می باشند نیز باید در نظر گرفته شود که انواعی از دیستروفی های عضلانی با توارث غالب به شکل د نو وو یا حتی کامپاند هتروزیگوت به ارث می رسند و در نتیجه بررسی اطلاعات حاصل از توالی یابی کل اگزوم تنها در یک والد) یا حتی هر دو والد (برای تشخیص قبل از تولد کافی نیست .کلید واژه ها :دیستروفی عضلانی، توالی یابی کل اگزون ها، ردیابی ناقلی

متن يادداشت

Muscular Dystrophies, one of the most common inherited disorders worldwide and the second most prevalent genetic disability in Iran, are a group of heterogeneous diseases characterized by progressive muscle weakness that there is no definite treatment for any form of it. In our country, autosomal recessive MDs are common due to high rate of consanguineous marriage, so, carrier screening has an important role in preventing the disease. Our objective was applying whole exome sequencing for an apparently normal individual in order to identify carrier status of autosomal recessive MD genes. Materials & Methods At the first step, we detected 285 variants in about 50 known MD genes then using different steps of filtration 5 variants were identified as possibly pathogenic variants. Comparison of these variants with Iranian cohort data was done in order to remove common variants. Results Finally 2 variants in TTN and ITGA7 genes remained. At last, our results underwent Sanger sequencing confirmation. Conclusion Knowing one parents carrier status, make it easier to check other parents carrier detection. We go for genes which had mutation in other parent and check them. Then using different tests before or during pregnancy, we will make sure about childs safety. Despite enormous progress in identifying MD genes underlying causes of this disease remain unknown in many cases and considering high heterogeneity of MDs, whole exome sequencing is an effective method in detection of possible variants in this type of disorders. Key Words: Muscular Dystrophy, Whole Exome Sequencing, Carrier Detection

خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه

ba

عنوان اصلي به زبان ديگر

Carrier Detection in Autosomal Recessive Muscular Dystrophies in Human Genome by Next Generation Sequencing

موضوع مستند نشده

Muscular Dystrophy

متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی

دیستروفی عضلانی

متن عنصر شناسه ای مقوله موضوعی

Muscular Dystrophy

مستند نام اشخاص تاييد نشده

وزیری، سعیده

مستند نام اشخاص تاييد نشده

Vaziri, Saeideh

مستند نام اشخاص تاييد نشده

کهریزی، کیمیا

مستند نام اشخاص تاييد نشده

نجم آبادی، حسین

کشور

ایران

سازمان

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

نام ميزبان

2048t.pdf

شماره دسترسي

محرمانه

اطلاعات مختصر

محرمانه

تاريخ و ساعت مذاکره و دسترسي

2048t.pdf

بيت در ثانيه

4446620

ارتباط براي تسهيلات دسترسي

مرجع

نوع فرمت الکترونيکي

متن

اندازه فايل

0

شماره کنترل رکورد

۸۴۰۲پ

شماره فيلد فرمت مبدا

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی

فرمت انتشار

چاپی-الکترونیکی

نوع ماده

TF

پیشوند ISBD اعمال شده است

1

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y