عنوان

بررسی بیان ژن RNA غیر کدکننده HAR1A وHAR1B در بیماری مالتیپل اسکلروزیس

شماره

پ۲۶۸۷۶

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

per

عنوان اصلي

بررسی بیان ژن RNA غیر کدکننده HAR1A وHAR1B در بیماری مالتیپل اسکلروزیس

نام نخستين پديدآور

سما اکبرزاده

نام ناشر، پخش کننده و غيره

علوم طبیعی

تاریخ نشرو بخش و غیره

۱۴۰۱

نام خاص و کميت اثر

۸۶ص.

مواد همراه اثر

سی دی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

علوم جانوری ژنتیک

زمان اعطا مدرک

۱۴۰۱/۰۳/۱۸

متن يادداشت

مالتیپل اسکلروزیس (MS) یک اختلال مزمن سیستم عصبی مرکزی (CNS) به¬واسطه سیستم ایمنی است که با التهاب، دمیلینه شدن و آسیب آکسون مشخص می¬شود. از نظر بالینی، سه زیرگروه مختلف MS به‌عنوان عودکننده - فروکش کننده (RR)، پیش¬رونده ثانویه (SP) و پیش¬رونده اولیه (PP) توصیف شده‌اند و در هر زیرگروه، یک تغییرات فردی قابل‌توجه¬ای ممکن است در سیر بیماری رخ دهد. ایران به دلیل شیوع بالای MS در جهان شناخته شده است، در¬حالی¬که 15 سال پیش ایران به عنوان یک منطقه کم¬ خطر شناخته می شد. MS اغلب در بزرگسالان جوان تشخیص داده می شود، بنابراین درک علل بیماری از اولویت قابل توجهی برخوردار است. با وجود تمام تلاش ها، علت مالتیپل اسکلروزیس هنوز ناشناخته است. عوامل ژنتیکی و محیطی متعددی می توانند سبب شروع و پیشرفت MS شوند. در چند سال اخیر، چندین شواهد حاکی از نقش کلیدی تغییرات اپی ژنتیکی در بیماری¬زایی MS برجسته شده است. در این میان، اخیراً گزارش شده است کهRNA های بلند غیر کدکننده (lncRNA) در تنظیم پاسخ های ایمنی شرکت دارند. در نتیجه، تغییر الگوی بیانیlncRNA ها به عنوان یک علت زمینه ای MS پیشنهاد شده است. اخیرا شواهدlncRNA های HAR1 را در ارتباط با اختلالات عصبی و روانپزشکی و همچنین انواع مختلف سرطان ها می دانند. در این مطالعه مورد-شاهدی، 100 بیمار مبتلا به MS و 100 فرد سالم با هدف ارزیابی بیان HAR1A و HAR1B در سلول‌های خونی در حال گردش، مورد بررسی قرار گرفتند. خون محیطی از همه شرکت کنندگان جمع آوری گردید. RNA کل با پروتکل Trizol جدا شد. RNA استخراج شده با استفاده از کیت سنتز cDNA به DNA مکمل (cDNA) تبدیل شد و پس از سنتز، Real-time PCR انجام شد. تجزیه و تحلیل های آماری با استفاده از SPSS نسخه 26 و GraphPad Prism انجام شد. مقادیر P کمتر از 0.05 معنی دار در نظر گرفته شد. تجزیه و تحلیل¬های آماری نشانگر کاهش بیان ژن HAR1A در بیماران مبتلا به MS است (P-value<0.0001) ؛ در¬حالی¬که هیچ افزایش بیان مثبت معنی داری باP-value = 0.06 ، از HAR1B lncRNA در بیماران مبتلا به MS با گروه کنترل یافت نشد. همچنین متفاوت در بیان اینlncRNA ها، حاکی از نقش آن¬ها در پاتوژنز MS است که آن¬ها را به عنوان نشانگرهای زیستی بالقوه برای پیش بینی سیر بیماری پیشنهاد می¬کند. همچنین برای بررسی تفاوت بین دو گروه از independed t-test استفاده شد که بر این اساس تفاوت معنی داری در بیان این دو ژن بین زنان و مردان و همچنین سابقه خانوادگی مشاهده نشد. با این حال، تفاوت بیان معنی‌داری را میان بیان ژن HAR1A گروههای سنی مختلف مشاهده کردیم (p-value=0.034). همچنین با P-value برابر با 0.02 بیان ژن HAR1A با سه زیرگروه بیماری MS دارای ارتباط معنی داری می باشد(RR, SP, PP) و با توجه به تجزیه¬و¬تحلیل منحنی ROC با AUC %78 ، lncRNA، HAR1A را می¬توان به عنوان یک نوع نشانگر زیستی بالقوه در بیماری MS معرفی کرد

متن يادداشت

Multiple sclerosis (MS) is a chronic immune-mediated disorder of the central nervous system (CNS) characterized by inflammation, demyelination, and axonal damage. Clinically, three different MS subtypes have been described as relapsing-remitting (RR), secondary progressive (SP), and primary progressive (PP), and within each subtype, a considerable individual variation in disease course could occur. Iran is well known for its high prevalence of MS in the world, whereas 15 years ago, it was assumed that Iran could be a low-risk area. MS is most often diagnosed in young adults, therefore, understanding the causes of the disease has a significant priority. Despite all the efforts, the cause of multiple sclerosis is still unknown. Multiple genetic and environmental factors can trigger the onset and progression of MS. In the last few years, several pieces of evidence supporting the key role of epigenetic changes in MS pathogenesis have been highlighted. Among these, long non-coding RNAs (lncRNAs) have been recently reported to participate in the regulation of immune responses. Consequently, aberrant expression of lncRNAs has been suggested as an underlying cause of MS. Emerging evidence has linked HAR1 lncRNAs to neurological and psychiatric disorders as well as different types of cancers. In the present case-control study, we aimed at evaluating the expression of HAR1A and HAR1B in the circulating blood cells of 100 Iranian multiple sclerosis patients compared with 100 healthy subjects. Peripheral blood was collected from all participants. Total RNA was isolated by the Trizol protocol. Extracted RNA was subjected to complementary DNA (cDNA) using a cDNA synthesis kit, and after synthesis, real-time PCR was performed. Statistical analyses were performed using SPSS version 26 and GraphPad Prism. P values of less than 0.05 were considered significant. Statistical analyses showed significant downregulation of HAR1A expressions in MS patients while there was no significant upregulation of HAR1B lncRNA in patients compared with controls, with P< 0.0001 and P-value=0.06 respectively. Such differential expression in lncRNAs would imply their role in the pathogenesis of MS and suggest them as potential biomarkers for the prediction of disease course. In addition, for analysis of differences between the two groups, an independent t-test was used. There was no significant difference in the expression of these two genes between men and women, and family history. However, we found significant differences in HAR1A expression in patients aged above 40 (P = 0.034). Furthermore, with a P-value of 0.02, HAR1A expression shows a difference between three subtypes of Multiple Sclerosis (RR, SP, PP). Due to the analysis of the ROC curve with 78% AUC, HAR1A lncRNA can be introduced as a fair type of biomarker in multiple sclerosis.

عنوان گونه گون

Investigation of Long non-coding RNA HAR1A and HAR1B Gene Expression in Multiple Sclerosis disease

عنصر شناسه اي

اکبرزاده،

ساير عناصر نام

‏‏ سما

کد نقش

تهيه کننده

عنصر شناسه اي

‏حسین پورفیضی،

عنصر شناسه اي

‏صفرعلیزاده،

ساير عناصر نام

‏‏محمدعلی

ساير عناصر نام

‏رضا

تاريخ

تهيه کننده

تاريخ

استاد راهنما

عنصر شناسه اي

‏تبریز