شناسایی، جداسازی و تعیین ویژگی برخی از ژنهای ممانعت کننده احتمال گلدهی از سیب (Malus domestica) و بررسی بیان آنها به روش RT-PCR و Real-Time PCR
نام نخستين پديدآور
/نعیمه مقصودی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: کشاورزی
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دکترا
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۳/۱۲/۱۸
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
سیب با نام علمی Malus .domestica Brokh یکی از رایجصترین میوه کشت شده در مناطق معتدله میصباشد که طول دوره نونهالی آن بر حسب رقم ۵ تا ۱۲ سال میصباشد .اصلاح صفت طول دوره نونهالی دانهال-های سیب در درجه اول اهمیت قرار دارد، چرا که این صفت باعث افزایش زمان و هزینه لازم برای اصلاح ژنوتیپ های مختلف سیب می شود .کوتاه کردن دوره نونهالی درختان میوه میتواند از طریق مهندسی ژنتیک با خاموش کردن یا کاهش تظاهر ژنصهای ممانعت کننده گلدهی عملی شود .در این راستا، در این تحقیق برخی ژنصهای احتمالی ممانعت کننده درگیر در مسیر گلدهی سیب از جمله همولوگصهای AtSEF و AtTEM شناسایی و الگوی بیان آنصها و نیز ژنصهای احتمالی پایین دست آنها (MdSOC۱ و MdFT) در بافتصهای مختلف بررسی شد .بررسیصهای بیوانفورماتیک مشخص کرد کهMdSEF۱ ، MdSEF۲ و MdSEF۳ به عنوان همولوگصهایAtSEF ، در سیب به ترتیب ۶۴ ، ۶۵ و ۶۵ با AtSEF شباهت داشتند .بررسی همردیفی MdSEF۱با توالیصهای دیگر نشان داد که Pyrus bretschneideri ۹۲ شباهت دارد BLASTp .توالی اسید آمینه ای ژن TEM آرابیدوپسیس با سیب ۲ توالی بسیار مشابهMdTEM۱ و MdTEM۲ را به ترتیب با شباهت ۶۰ و ۶۱ با AtTEM ، نشان داد .نواحی رمزآور ۷۷۶ جفت بازی MdSEF۱و ۱۲۲۸ جفت بازی MdTEM۱ برای اولین بار جداسازی و همسانه سازی شد .بررسی نیمه کمی بیان ژن، وجود رونوشت MdSEF۱ و MdSEF۲را در تمام بافتصها بجز ریشه ثابت کرد .بررسی بیان کمی نشان داد که بیان MdSEF۱ در برگ نونهال در مقایسه با سایر بافتصها بیشتر است .در حالیکه بیشترین میزان بیان MdSEF۲ در بافت میوه مشاهده شد .همچنین مشخص شد که بیان MdSOC۱ در بافت برگ بیشترین مقدار است .بررسی نیمه کمی MdTEM۱ بیان آن را در تمام بافتصها نشان داد اما MdTEM۲ در بافت ریشه مشاهده نشد .بررسی کمی بیان MdTEM۱ نشان داد که در بافت برگ نونهال بیشترین مقدار را دارد .درحالیکه بیشترین بیان MdTEM۲ در ساقه بالغ بوده است .بررسی کمی بیان ژن های مورد مطالعه، همچنین، نشان داد که بیان ژن MdFT در بافت میوه بیشترین مقدار را دارد در حالیکه در بافتصهای برگ بالغ و نونهال و ساقه نونهال بیان آن فوق العاده کم بوده است
متن يادداشت
bretschneideri. BLASTp assessments, also, recognized that MdTEM1 and MdTEM2 as AtTEM homologues demonstrated 60 and 61 similarity with AtTEM, in that order. For the first time, a 776 bp fragment for MdSEF1 and a 1228 bp fragment for MdTEM1 were isolated and cloned. Semi-quantitative examination revealed that transcriptions of MdSEF1 and MdSEF2 present in all of tissues except root. qRT-PCR analysis demonstrated that MdSEF1 expiration in juvenile leaf is more than another tissues. Also it was publicized that MdSOC1 expiration level in leaves is the utmost. Semi-quantitative analysis showed MdTEM1 expression in all of the studied tissues, whereas MdTEM2 expression was not observed in root. qRT-PCR analysis confirmed that MdTEM1 expression was the most in juvenile leaves, Whereas MdTEM2 expression level was the most in mature stems. Also, Quantitative investigation showed MdFT expression was the maximum in fruit tissues while there was a litter expression in leaves and juvenile stems Apple (Malus x domestica Brokh.), main cultivated fruit trees in temperate regions, has 5-12 years juvenility periods. Modification and breeding in duration of juvenility at apple seedlings have the first degree of importance as this attribute determines years and area occupied by fruit trees without yield. Genetics engineering is a way to shorten this period regardless of classic breeding. Gene silencing and reduction in genes expression of flowering inhibitor genes are two methods in this sense. Thus, current study investigated identification of some inhibitor genes in apple flowering pathways like homologues of AtSEF and AtTEM and their expression patterns as well their downstream genes (MdSOC1 and MdFT) at different plant tissues using RT-PCR and qRT-PCR. Bioinformatics assessments identified that MdSEF1, MdSEF2 and MdSEF3 as AtSEF homologues demonstrated 64, 65 and 65 similarity with AtSEF, respectively. MdSEF1 simulation study with other sequences revealed that 92 similarity observed with Pyrus
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )