بررسی بیان lncRNA NORAD و تاثیر ناک داون آن توسط siRNA در سلول های سرطان معده
نام نخستين پديدآور
نگین راعی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
۱۴۰۰
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۹۰ص.
مواد همراه اثر
سی دی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دکتری
نظم درجات
ژنتیک مولکولی
زمان اعطا مدرک
۱۴۰۰/۱۱/۱۷
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
زمینه: سرطان معده یکی از بدخیمی های شایع در کشور های آسیای شرقی و به عنوان دومین عامل مرگ و میر می باشد. در اکثر بیماران، سرطان معده در مراحل پیشرفته شناسایی می شود که تهاجم و متاستاز رخ داده است. پیشرفت در زمینه های درمانی مناسب به منظور افزایش بقا انجام می شود، بنابراین شناسایی یک سری مکانیسم های مولکولی که منجر به پیشرفت سرطان معده می شود در تشخیص راهکار درمانی مناسب یک امر ضروری می باشد. امروزه یک سری RNA هایی شناسایی شده اند که تحت عنوان RNA های بلند غیر کد کننده یا lncRNA هستند و نقش اساسی در سرطان زایی و رشد تومور دارند. در این مطالعه تغییرات بیانی و نقش LncRNA NORAD در سرطان معده بررسی شده است. مواد و روش ها: 70 جفت نمونه بافت توموری معده و بافت سالم حاشیه تومور جمع آوری شدند. به منظور بررسی بیان NORAD استخراج RNA تام سلولی، سنتز cDNA و Real Time PCR برای تمامی نمونه ها انجام شد. برای انجام آزمایشات سلولی طراحی si-NORAD، کشت سلول های AGS و الکتروپوریشن si-NORAD انجام شد و برای ارزیابی تاثیر si-NORAD بر سلول های AGS، تست MTT، تست فلوسایتومتری، تست خراش و تست وسترن بلات انجام شد.نتیجه گیری و بحث: مطالعات بر روی 140 نمونه انجام شد که شامل 70 بافت توموری و 70 بافت سالم حاشیه تومور بود. 80% از جامعه آماری مرد و 20% زن بودند. 85.71% از بیماران سن بيشتر و مساوی 55 داشتند و 14.29% سن پائین تر از 55 داشتند. از لحاظ خاستگاه 47.14% کاردیا، 11.43% کاردیا و غیر کاردیا و 41.43% غیر کاردیا بودند و از لحاظ پاتولوژی 31.43% از نوع پراکنده و 60% از نوع روده ای و 8.57% سایر موارد بودند. ژنNORAD در بافت توموری معده بیان بیش از حد داشته(Expression ratio=3.72 و P-value<0.0001) و نتایج تست حساسیت و اختصاصیت نیز تائید کننده ی نقش انکوژنی این ژن می باشد(P-value<0.0001 ). نتایج بخش سلولی نشان داد که ناک داون ژن NORAD در ارتباط مستقیم با کاهش زیست پذیری (P-value<0.0001)، افزایش میزان آپوپتوز (P-value<0.0001) و همچنین کاهش مهاجرت (P-value=0.0022) در سلول های AGS می باشد. کاهش بیان ژن NORAD در سلول های AGS ارتباط مستقیم با افزایش بیان فاکتور آپوپتوزی Bax و کاهش بیان فاکتور آنتی آپوپتوزی Bcl-2 دارد و همچنین منجر به افزایش بیان فاکتورهای EMT از جمله PTEN و E-cadherin می شود. بنابراین با توجه به نتایج به دست آمده lncRNA NORAD به عنوان یک فاکتور و بیومارکر تشخیصی احتمالی در سرطان معده می تواند باشد و ناک داون NORAD ممکن است در ارتباط با آپوپتوز و مهاجرت سلول های سرطان معده باشد.
متن يادداشت
Background: Gastric cancer (GC) is one of the most common malignancies in East Asian countries and is the second leading cause of death. In most patients, gastric cancer is diagnosed in advanced stages where invasion and metastasis have occurred. Advances in appropriate therapies are done in order to increase survival, so identifying a range of molecular mechanisms that lead to the progression of GC is essential in determining the appropriate treatment strategy. Recently, a large number of RNAs have been known that are called long non-coding RNAs or lncRNAs and play a key role in carcinogenesis and tumor growth. In this study, the expression changes and the role of LncRNA NORAD has been investigated.Methods: 70 paires of gastric tumor tissues and their adjacent normal tissues were collected. In order to evaluate the expression of NORAD, total RNA extraction, cDNA synthesis, and Real Time PCR for all the samples was conducted. To perform cellular assays, si-NORAD designe, AGS cell culture, and si-NORAD electeroporation was done and to obtaine the effect od si-NORAD in AGS cells, MTT assay, flowcytometery assay, wound healing assay, and western blot assay was conducted.Results and conclusion: Studies were performed on 140 samples, including 70 tumor tissues and 70 adjacent normal tissues. 80% of samples were males and 20% were females. 85.71% of patients had the age of 55 and more, 14.29% of patients had the age of less than 55. 47.14%, 11.43%, and 41.43% of patients were recognized with cardia cancer, cardia and non-cardia cancer, and non-cardia cancer, respectively. 60%, 31.43%, and 8.57% of tumors were intestinal-type GC, diffuse-type GC, and other types of GC, respectively. NORAD gene was overexpressed in tumor tissues (P-value<0.0001and Expression ratio=3.72). The sensitivity and specificity tests results indicated that NORAD can be known as an oncogene (P-value<0.0001). Cellular assays results showed that NORAD gene knockdown directly decreased cell viability (P-value<0.0001), increased apoptosis (P-value<0.0001), and decreased cell migration (P-value=0.0022) in AGS cells. Decreased NORAD expression in AGS cells lead to increased expression of apoptotic factor Bax and decreased expression of Bcl-2 and also increased expression of EMT factors including; PTEN and E-cadherin. Therefore, according to the obtained results, lncRNA NORAD can be known as factor and probable diagnostic biomarker in GC.
عنوانهای گونه گون دیگر
عنوان گونه گون
A survey on expression of lncRNA NORAD, and the effect of its siRNA knock down in gastric cancer cells
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )