بازنگری موقعیت سیستماتیکی Peganum harmala بر اساس توالی ژن MATK
نام نخستين پديدآور
لیلاموسوی قدیمی قلعه
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
۱۳۹۹
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۷۴ص.
مواد همراه اثر
سی دی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
زیست شناسی علوم گیاهی گرایش سیستماتیک و بوم شناسی
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
در این پژوهش، نواحی DNA کلروپلاستی matK در گونهPeganum harmala از تیره Peganaceae راسته Sapindales توالییابی شد. برای یافتن روابط فیلوژنی بین گونهی مذکور و سایر گونههای جنس Peganum، توالییابی ناحیه کلروپلاست matK و گونههای دیگر این جنس از سایت NCBI اخذ و با استفاده از روشهای maximum parsimony و Neighbor-joining به صورت درختهای فیلوژنتیکی با نرم افزار Mega آنالیزگردید. DNA ژنومی دانه نمونه مورد مطالعه بود و سپس به عنوان الگویی برای واکنش PCR مورد استفاده قرار گرفت. محصولات PCR توسط الکتروفورز بررسی، خالصسازی، تعیین توالی و در پایگاه داده توالی نوکلئوتید GenBank ارسال شد برای تعیین توالی نمونه مربوط به توالی matK از آغازگر دژنره استفاده شد. در مورد تعیین موقعیت سیستماتیکی Peganum harmalaطبق نتایج به دست آمده و با توجه به درختهای فیلوژنتیکی و توالی به دست آمده از cpDNA matK گونه مورد بررسی، Peganum harmala، باید از تیره Zygophyllaceae جدا شود و به تیره Peganaceae به راستهی Sapindalesمنتقل شود.و در میان چهارگونه دیگر از راسته Sapindales رابطه خویشاوندی نزدیکی با N.sphaerocarpa,N.sibirica داشت. سه گونه در یک خوشه قرار گرفتهاند و یک گروه مونوفایلتیک را تشکیل داده اند. بنابراین نتایج به دست آمده از رده بندی مورفولوژیکی و نتایج به دست آمده از آنالیز توالیهای ITS ،F-trnL ، و توالی psbA-trnH و توالی های مکانی rbclو trnL-F که در ترکیب با مورفولوژی، بیوشیمیایی و جنین شناسی با نتایج بدست آمده با توالی ژن matk در این پژوهش مطابقت دارند شد که Peganum harmala از راسته sapindales و از تیره Peganaceae است
متن يادداشت
The systematic position of the genus Peganum has been the subject of discussion.In the currentresearch, the taxonomic statue of Peganum harmala was investinged using analysisof cpDNA matksequence.M & M: Genomic DNA was seed of studied samples and then used as a template for PCR reaction. PCRproducts were checked by electrophoresis, purified, sequenced, and submitted in the GenBank nucleotidesequence database. Degenerate primer was used to determine the sample sequence related to matKsequence.With Mega 6 software phylogenetic trees such as maximum parsimony, Neighbor- joining.The main Results:The obtained phylogenetic trees showed that in both trees the position of peganaceae is inthe order of sapindales should be separated from the genus Zygophyllaceae and transferred to the genusPeganaceae in the order Sapindales.Discussion:Therefore, the results obtained from morphological classification and the results obtained fromthe analysis of ITS, F-trnL, and psbA-trnH sequences and the spatial sequences of rbcl and trnL-F, which incombination with morphology, biochemistry and embryology with the results obtained Are consistent withthe matk gene sequence in this study.Conclusion:The matK gene sequence of P.harmala have closely relationship with N.sibirica,N.sphaerocarpa compared to other Four species Three species are located in a cluster and form amonophyletic group . Peganum harmala order spindales and genus Peganacea
عنوانهای گونه گون دیگر
عنوان گونه گون
A systematic of Peganum harmala based on the matK gene sequence
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )