بررسی کارآیی برخی آنزیم های برشی در تهیه مخزن ژنومی کلروپلاست سیب Malus domestica.Borkh))
نام نخستين پديدآور
/نورعلی قیاسی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
تبریز: دانشگاه تبریز،دانشکده کشاورزی ، گروه زراعت واصلاح نباتات
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به کتابنامه ، واژه نامه و نمایه های داخل اثر
متن يادداشت
واژه نامه بصورت زیرنویس
متن يادداشت
کتابنامه ص.: ۹۶-۹۹
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
مهندسی کشاورزی- بیوتکنولوژی
زمان اعطا مدرک
۱۳۸۸/۰۷/۰۵
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز: دانشگاه تبریز،دانشکده کشاورزی ، گروه زراعت واصلاح نباتات
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
سیب یکی از میوه هایی است که به خاطر داشتن ارزش غذایی بالا و ترکیبات آنتی اکسیدانتی رنگیزه های مفید از جمله کارتنوئیدها و آنتوسیانین ها در بین درختان میوه از جایگاه ویژه ای برخوردار می باشد بنابراین هرگونه بهبود در کیفیت ویا کمیت مواد موثره این گیاه ضرورت مطالعه روی آنرا آشکار می سازد .از آنجا که کلروپلاست اندامک مهمی برای متابولیسم مرتبط با این موضوع می باشد دستورزی ژنتیکی آن با ارزش بوده و اولین گام در تحقق هدف فوق دسترسی به ژنوم کلروپلاست در این گیاه می باشد تا بتوان از آن بعنوان مرجع تغییرات بیوشیمیایی مورد انتظار استفاده نمود .در این پژوهش روشهای مختلف جداسازی و خالص سازی کلروپلاست از بافتهای برگی ودسترسی به کلروپلاست با کیفیت وکمیت مطلوب و همچنین روشهای مختلف لیز کردن کلروپلاستهای بدست آمده برای دستیابی به DNA مطلوب بررسی شده است .پس از دستیابی به DNA کلروپلاست با کیفیت مناسب اقدام به تیمار آن با تعدادی از آنزیم های برشی به منظور تهیه مخزن ژنومی گردید .در این فرایند ابتدا هضم ناقصDNA ی کلروپلاستی انجام گرفته و قطعات برش یافته ناقص آنزیمی بر روی ناقل پلاسمیدی pUC۱۹ همسانه سازی شدند.پس از تراریخته سازی باکتریایی کلنی های تراریخته بوسیله تست آبی-سفید در محیط حاوی القاگر IPTG وپیش مادهgal X - و آنتی بیوتیک، شناسایی و پس از شمارش کلنی های مثبت تعدادی از آنها بطور تصادفی انتخاب و در محیط LB تلقیح شده و پلاسمید استخراج شده از آنها برای حضور قطعات DNA درجی کلروپلاست تجزیه و تحلیل شدند .در این کار تحقیقاتی برای اولین بار دستورالعمل جداسازی کلروپلاست و DNA کلروپلاستی در درخت سیب گزارش گردیده است وکارآیی کلیه آنزیم های بکار رفته برای تهیه مخزن ژنومی کلروپلاست مورد مقایسه قرار گرفتند.در نهایت با توجه به تعداد کلونی های مثبت اخذ شده از آنزیم های مختلف ،آنزیم EcoRI به عنوان آنزیم برشی مناسب معرفی گردید.
متن يادداشت
Apple is one of the fruits that has got special importance due to containing high nutrient value, anti oxidant compounds and useful pigments such as carotenoids and antocianes. Therefore any improvement in quality and quantity of efficient ingredients discloses the essentiality of research on this fruit. Since the chloroplast is an important organelle for relevant metabolism in this case, it's genetic manipulation is valuable and the first step to achieve for this goal is access to chloroplast genome in this plant so that it could be used as a source of biochemical improvement. In this research different methods were investigated for isolation and purification of chloroplast from leaf tissues and access to high quality and quantity of desired chloroplast as well as different methods for chloroplast lysis to obtain good quality ctDNA. After isolation of high quality ctDNA, it was treated by some restriction enzymes for preparing genomic library. In this process, at first partial digestion of ctDNA was performed and partial restricted fragments was cloned in pUC19 vector. Transformed clones was identified by white-blue test using medium containing IPTG inducer, X-gal precursor and antibiotic, and after counting of positive clones some of them was randomly elected and inoculated in LB medium and plasmid extraction carried out from this colonies and analyzed for inserted ctDNA fragments. In this research ctDNA isolation protocol from apple was reported for first time and the efficiency of restriction enzymes used for preparing chloroplast genomic library was compared, and with considering the number of positive colonies obtained from enzymes, the EcoRI could be introduced as an appropriate one.
موضوع (اسم عام یاعبارت اسمی عام)
موضوع مستند نشده
Malus domestica
موضوع مستند نشده
Borkh
موضوع مستند نشده
Apple
موضوع مستند نشده
Restriction enzymes
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )