شماره کتابشناسی ملی
شماره
۲۳۷۴۴پ
زبان اثر
زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن
per
عنوان و نام پديدآور
عنوان اصلي
همسانه سازی ژن سوپراکسید دیسموتاز حاوی مس /روی (CSD۱) به روشPCR - RTاز گیاهSalicornia europaea
عنوان اصلي به زبان ديگر
cloning suproxide dismutase gene containing copper/zinc (CSD۱)using RT-PCR method in Salicornia europaea
نام نخستين پديدآور
/کمال مردان اربط
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: کشاورزی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۶
نام توليد کننده
، میرزائی
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۶۱ص
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی - الکترونیکی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
بیوتکنولوژی کشاورزی
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۶/۱۱/۱۶
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
رادیکال‌صهای آزاد اکسیژن مهم‌صترین عامل تنش گیاهان به شمار می‌صروند .آنزیم‌صهای سوپراکسید دیسموتاز به عنوان اولین سد دفاعی گیاهان در مقابل سمیت اکسیژن، رادیکال های سوپراکسید را تجزیه می‌صنمایند .این آنزیم ها برای حیات هوازی ضروری بوده و در فرآیند مقاومت در برابر تنش‌صها و طول عمر گیاه نقش موثری ایفا می نمایند .گیاه سالیکورنیا از جمله گیاهان هالوفیتی است که به‌صدلیل تحمل بالا به شوری خاک، دارای فعالیت مناسبی از آنزیم‌صهای مس /روی سوپراکسید دیسموتاز می‌صباشد و دستیابی به ژن رمزگردان آن در این تحقیق هدف‌صگذاری شد .بدین منظور مطالعات بیوانفورماتیکی ژن هدف انجام و با استفاده از نرم‌صافزارهای Primer Blast و Oligo Analyzer آغازگرهای اختصاصی برای دستیابی به ژن رمزگردان مورد نظر طراحی و سفارش گردید. در این پروژهRNA ی کل به روش ترایزول استخراج و پس از تایید کمی و کیفی آن در ژل الکتروفورز آگارز، از آنزیم ترانس‌صکریپتاز معکوس، آغازگر معکوس و Oligo dT برای سنتز رشته اول cDNA استفاده بعمل آمد .سپس cDNA ی حاصل برای واکنش PCR ص از طریق آغازگر اختصاصی مستقیم و معکوس استفاده گردید و پس از تایید محصول PCR در الکتروفورز ژل آگارز۸/۰ ، عملیات همسانه‌صسازی با روش T/A و در سویه‌صی DH۵ باکتری E.coli و در ناقل خطیpTG۱۹ - Tانجام گرفت .برای تهیه سلول‌صهای مستعد از روش TSS و برای انجام تراریختی باکتری‌صها از شوک حرارتی استفاده شد .غربالگری باکتری‌صهای تراریخته نوترکیب در حضور آنتی‌صبیوتیک آمپی‌صسیلین صورت گرفته و برای آنالیز آن‌صها از کلنی PCR و روش برش آنزیمی استفاده شد .پس از موفقیت در همسانه‌صسازی و تایید حضور نواحی جناحین ژنوم کلروپلاستی در ناقل پلاسمیدی، توالی یابی آن توسط شرکت Bioneer کره جنوبی انجام گرفته و با دسترسی به این اطلاعات، نسبت به تایید مولکولی آن از طریق نرم افزار بیوانفورماتیکی اقدام شد .این بررسی‌صها ضمن تایید صحت قطعه همسانه‌صسازی شده، موید این بود که توالی نوکلئوتیدی قطعه کلون شده از اکوتیپ نواحی ساحلی دریاچه ارومیه با توالی مندرج در بانک اطلاعاتی نوکلئوتیدی قریب به شباهت ۹۹ درصدی داشتند .بنابراین می‌صتوان از این قطعه در بررسی‌صهای بیانی و مقاوم‌صسازی گیاهان ارزشمند و حساس به تنش های اکسیداتیو بهره‌صگیری نمود
متن يادداشت
Free oxygen radicals are the main cause of stress in plants. Superoxide dismutase enzymes, as the first defensive barrier of plants against oxygen toxicity, decompose superoxide radicals. These enzymes are necessary for plants aerobic life and play an important role in both resistance process against stresses and length of plants life. Salicornia plant is one of the halophyte plants and due to its high tolerance to soil salinity, has a good activity regarding copper / zinc enzymes in superoxide dismutase .So, obtaining its encoder gene was targeted in this research. For this purpose, the bioinformatics studies of the target gene was performed and by using Primer Blast and Oligo Analyzer software, specific primers were designed and ordered to obtain the desired decoder gene. In this project, the total RNA was extracted by the Tryzol method, and after quantitative and qualitative confirmation in agarose gel electrophoresis, reverse transcriptase enzyme, reverse primer, and Oligo dT were used to synthesize the first strand of cDNA. Then, through specific Forward and Reverse primer, the resulting cDNA was used for PCR reaction. After confirmation of PCR product in 0/8 agarose gel electrophoresis, cloning was done using T/A method in DH5 strain of E. coli bacteria and linear pTG19-T vector. The TSS method was used to prepare susceptible cells and heat shock was used to transform the bacteria. Screening of recombinant transgenic bacteria was carried out in the presence of Ampicillin antibiotic and PCR colony and enzymatic digestion were employed in the analysis of them. Following successful cloning and confirmation of the presence of the flanking regions of the chloroplast genome in the plasmid vector, its sequencing was carried out by Bioneer, a South Korean company. By accessing this information, molecular confirmation was made through bioinformatics software. These experiments confirmed the accuracy of the cloned segment and also proved that the nucleotide sequence of the cloned segment from the ecotype of the coastal areas of Lake Urmia is approximately 99 similar to the sequence listed in the nucleotide database. Therefore, this segment can be used in examination of gene expression and empowering the plants that are valuable and sensitive to oxidative stresses
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
cloning suproxide dismutase gene containing copper/zinc (CSD۱)using RT-PCR method in Salicornia europaea
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )
مستند نام اشخاص تاييد نشده
مردان اربط، کمال
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Arbat Mardan, Kamal
دسترسی و محل الکترونیکی
يادداشت عمومي
سیاه و سفید
وضعیت فهرست نویسی
وضعیت فهرست نویسی
نمایه‌سازی قبلی
