تعیین میزان DNA متیله پروموتر ژنBox ۲۱ (SOX۲۱) -SRYدر نمونهصهای مدفوع و پلاسمای بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال بعنوان بیومارکر غیر تهاجمی تشخیصی
عنوان اصلي به زبان ديگر
Quantitative detection of SRY-Box ۲۱ (SOX۲۱) gene promoter methylation in the stool and plasma samples of patients with colorectal cancer as a noninvasive diagnostic biomarker
نام نخستين پديدآور
/کیوان مرادی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۸
نام توليد کننده
، افشاری
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۱۳۲ص
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی - الکترونیکی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دکتری
نظم درجات
زیست شناسی گرایش بیوشیمی
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۸/۰۳/۰۷
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
در سالصهای اخیر، مطالعه بیومارکرهای اپیصژنتیکی در مدفوع و خون بهصعنوان یک رویکرد تحقیقاتی جذاب برای تشخیص غیر تهاجمی سرطان کولورکتال (CRC) بوده است .هدف از پژوهش حاضر، بررسی قابلیت بیومارکری متیلاسیون پروموتر ژنBox ۲۱ (SOX۲۱) - SRYدر نمونهصهای مدفوع و پلاسمای بیماران CRC جهت افتراق بیماران سرطانی از افراد سالم میصباشد .مواد و روشصها :از تکنیک MethyLight جهت بررسی وضعیت متیلاسیون پروموتر ژن SOX۲۱ در مجموعا ۲۶۴ نمونه شامل ۱۰۲ :بافت توموری CRC و بافتصهای سالم مجاور، ۱۰۰ نمونه مدفوع بیماران CRC و مدفوع افراد سالم، و ۶۲ نمونهص پلاسمای بیماران CRC و افراد سالم، استفاده شد .همچنین، تست خون مخفی مدفوع (FOBT) و تست آنتیصژن کارسینوامبریونیک (CEA) بهصترتیب در ۱۰۰ نمونه مدفوع) شامل بیماران CRC و افراد سالم (و ۶۲ نمونهص پلاسما) شامل بیماران CRC و افراد سالم (بررسی شد .میزان متیلاسیون نمونهصها بر اساس percentage of methylated reference (PMR) محاسبه گردید .همچنین، جهت آنالیز آماری دادهصها از نرمصافزار SPSS استفاده شد .نتایج :مقادیر PMR در بافتصهای توموری، مدفوع و پلاسمای بیماران CRC بهصترتیب بالاتر از بافتصهای نرمال مجاور، مدفوع افراد سالم و پلاسمای افراد سالم بود) در هر سه گروه .P<۰.۰۰۱) :حساسیت و ویژگی حاصل از بررسی متیلاسیون پروموتر ژن SOX۲۱ در نمونهصهای بافت، مدفوع و پلاسما بهصترتیب ۴/۸۰ و ۱۰۰ ، ۷۲ و ۱۰۰ ، ۸/۶۸ و ۱۰۰ ، بود .بعلاوه، هیچگونه اختلاف معنیصدار آماری بین وضعیت متیلاسیون پروموتر ژن مذکور با ویژگیصهای دموگرافی و کلینیکوپاتولوژیکی بیماران در هر سه گروه بافت، مدفوع و پلاسما مشاهده نگردید .(P>۰.۰۵) همچنین، حساسیت حاصل از تست FOBT و CEA پایینصتر از حساسیت متیلاسیون پروموتر ژن SOX۲۱ بود .نتیجهصگیری :در مجموع، در این پژوهش نشان داده شد که سنجش کمی متیلاسیون پروموتر ژن SOX۲۱ در نمونه-های بافت توموری، مدفوع و پلاسمای بیماران CRC از حساسیت و ویژگی نسبتا بالایی در تشخیص بیماری این افراد برخوردار میصباشد .نتایج پژوهش حاضر ضمن اینکه تأییدکننده مطالعات پیشین انجام شده بر روی متیلاسیون پروموتر ژن مذکور میصباشد نوید دهنده مطالعاتی خواهد بود که در آینده بهصمنظور اثبات هر چه بیشتر کارایی آن بهصعنوان یک بیومارکر مولکولی و یک ابزار غیر تهاجمی در تشخیص اولیه CRC صورت خواهد گرفت
متن يادداشت
In recent years, the study of potential epigenetic biomarkers in stool and blood samples has been an attractive research approach for non-invasive diagnosis of colorectal cancer (CRC). The aim of this study was to evaluate the stool and plasma-based DNA methylation potential of SRY-Box 21 (SOX21) gene promoter as a candidate biomarker for differentiating colorectal cancer patients and healthy subjects. Methods: The MethyLight method was performed to analyze the methylation status of SOX21 gene promoter in a total of 264 samples including; 102 CRC tumor tissues and their adjacent normal tissues, 100 stool samples from CRC patients and healthy controls, and 62 plasma samples from CRC patients and healthy controls. In addition, Fecal Occult Blood Test (FOBT) and Carcinoembryonic antigen (CEA) test was performed in 100 stool samples (from CRC patients and healthy controls) and in 62 plasma samples (from CRC patients and healthy controls), respectively. The methylation rate of SOX21 gene promoter in each sample was calculated based on percentage of methylated reference (PMR). Statistical data analysis was carried out using SPSS software. Results: The PMR values in tumor tissues, stool and plasma samples of CRC patients were higher than that of adjacent normal tissues, stool and plasma samples of healthy controls, respectively (in all three groups: P<0.001). The obtained sensitivity and specificity of SOX21 gene promoter methylation analysis in tissue, stool and plasma samples were 80.4 and 100 , 72 and 100 , and 68.8 and 100 , respectively. Moreover, there were no significant association between methylation status and demographic/clinicopathological features (in all three groups: P>0.05). In addition, the sensitivity of FOBT and CEA tests were lower than that of SOX21 gene promoter methylation analysis. Conclusions: In summary, the results of the present study demonstrated that the stool and plasma-based assay of SOX21 gene promoter methylation has a relatively high sensitivity and specificity for diagnosis of colorectal cancer. These results are in compatible with previous studies conducted on SOX21 gene promoter methylation and would be promising for future studies in order to prove its efficacy as a molecular biomarker and a non-invasive tool in the initial diagnosis of colorectal cancer
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
Quantitative detection of SRY-Box ۲۱ (SOX۲۱) gene promoter methylation in the stool and plasma samples of patients with colorectal cancer as a noninvasive diagnostic biomarker
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )