شناسایی و همسانهسازی نواحی جناحین ناقلهای پلاستیدی سالیکورنیا(.Salicornia spp)
نام نخستين پديدآور
/معصومه حبیبی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: کشاورزی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۵
نام توليد کننده
، میرزائی
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
بیوتکنولوژی کشاورزی
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۵/۱۱/۱۷
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
تکنولوژی انتقال ژن به کلروپلاست گیاهان، یک روش ارزشمند و در حال توسعه در مهندسی ژنتیک است .این امر به دلایل مختلفی مانند سطح بالای بیان پروتئین، نبود اثرات خاموشی ژن، عدم فرار ژن و غیره می-باشد .ناقلصهای کلروپلاستی برای هر گونه گیاهی اختصاصی بوده و این امر به دلیل درج هدایت شدهصی ژن-های مورد نظر در ژنوم کلروپلاستی از طریق پدیدهصی نوترکیبی همتا است که به واسطه حضور توالیصهای مشابه از ژنوم کلروپلاست میزبان، در دو سوی کاست ژنی میصباشد .این نواحی که به عنوان نواحی جناحین شناخته میصشوند، در طراحی و ساخت ناقلصهای انتقال ژن به کلروپلاستصها باید در نظر گرفته شوند .برای تحقق این هدف، با استفاده از نواحی ژنوم پلاستیدی سالیکورنیا و نقشه فیزیکی ژنصهای مستقر در آن، اقدام به تعیین دو ناحیه اختصاصی برای درج ژنص)های (مورد نظر نموده و سپس طراحی آغازگرهای اختصاصی برای تکثیر این نواحی به کمک نرم افزارهایBlast - Primerو Analyzer Oligoصورت پذیرفت .این نواحی، به کمک آغازگرهای اختصاصی و با استفاده از DNA ژنومی کل، که به روش CTAB جدا شده، از طریق PCR تکثیر یافتند .پس از بررسی نتیجه تکثیر توسط الکتروفورز ژل آگاروز و با استفاده از نشانگر وزنی، همسانهصسازی از طریق روش T/A cloning و دستورالعمل کیت مربوطه با استفاده از پلاسمید خطیpTG۱۹ - Tدر باکتری Ecoli سویهصی DH۵ انجام پذیرفت .برای تهیهصی سلولصهای مستعد از روش TSS و برای انجام تراریختی باکتریایی از روش شوک حرارتی استفاده گردید .غربالصگری باکتریصهای تراریخته به روش آبی- سفید در حضور آنتیصبیوتیک آمپیصسیلین، IPTG وgal - xانجام شده و صحت تراریختی باکتریایی از طریق کلنی PCR بررسی شد .از کلنیصهای سفید مثبت به واکنش کلنیPCR ، اقدام به کشت مایع شبانه و استخراج پلاسمید گردید .پلاسمیدهای جداسازی شده پس از تایید آنزیمی طول قطعهصی همسانهصسازی شده، جهت توالیصیابی به شرکت Bioneer ارسال گردیدند .نتایج حاصل از تعیین توالی پس از ارزیابیصهای بیوانفورماتیکی موید این بودند که توالی مربوط به نواحی همسانه سازی شده با توالی ثبت شده در پایگاه اطلاعات نوکلئوتیدی NCBI همولوژی قریب به ۱۰۰ دارد و بنابراین می توان از این قطعات برای ساخت ناقلصهای اختصاصی ترانسپلاستومیک سالیکورنیا استفاده نمود
متن يادداشت
Gene transfer technology into chloroplast of plants is a valuable and developing method in genetic engineering. This is due to various reasons like high level of protein expression, lack of gene silencing effects, lack of gene escape, etc. chloroplast vectors are specific for each species of plant and due to led by inserting desired genes in chloroplast genome by homologous recombination Between plastid genome and vector. These areas are characterized as flanking regions that should be considered in design and construction of vectors in chloroplasts. To achieve this goal, with using plastid genomic regions of salicornia and physical map based on its genes, were determined the specific areas to insert the desired genes and then accurred design specific primers to amplify the regions with softwares Primer- Blast ana Oligo Analyzer. These aeras, using specific primers and total genomic DNA, that isolated CTAB method, proliferated by PCR. After Reviewing the result of amplification by 8 agarose gel electrophoresisand using a weighted indicator, cloning through the procedure T/A cloning and the respective kit instructions,were performed in E.coli bacteria DH5? strains using linear plasmid pTG19-T. TSS method for the preparation of competent cells and heat shock method was used for bacterial transformation.Transgenic bacteria screening done with blue-white method in the presence of ampicillin antibiotic, IPTG and x-gal. Accuracy of bacterial transformation was investigated by colony PCR. Overnightliquid cultures of a positive colony were performed and plasmid extraction was done. Isolated plasmids were digested for confirmation of the presence of desined fragments and was sent for sequencing to the Bioneer Co. The results were analyzed by bioinformatics software. the homology blast of sequencing results with the source reference of this work showed 98 similarity and so these fragments can be used for construction of transplastomic specific vectors of salicornia
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )