عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
محل استقرار
شماره کتابشناسی ملی
شماره
TLpq2395609889
زبان اثر
زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن
انگلیسی
عنوان و نام پديدآور
عنوان اصلي
Population Genetic Inference with Identity by Descent
نام عام مواد
[Thesis]
نام نخستين پديدآور
Tian, Xiaowen
نام ساير پديدآوران
Browning, Sharon
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
University of Washington
تاریخ نشرو بخش و غیره
2020
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
127
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
Ph.D.
کسي که مدرک را اعطا کرده
University of Washington
امتياز متن
2020
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
Identical-by-descent (IBD) segments carry important information on genetic relatedness between individuals and therefore are used widely for statistical inference in population genetics. In this work, we focus on the inference of the genome-wide mutation rate using IBD segments. The two primary methods for estimating the genome-wide mutation rate have been counting de novo mutations in parent-offspring trios and comparing sequence data between closely related species. With parent-offspring trio analysis it is difficult to control for genotype error, and resolution is limited because each trio provides information from only two meioses. Inter-species comparison is difficult to calibrate due to uncertainty in the number of meioses separating species, and it can be biased by selection and by changing mutation rates over time. Existing IBD-based methods are limited to highly inbred samples, or lack robustness to genotype error and error in the estimated demographic history. In this work, we propose mathematical models based on coalescent theory for an IBD-based method that uses sharing of IBD segments among sets of three individuals to estimate the mutation rate as well as the gene conversion rate. With the application to whole genome sequence data from TOPMed Project, we obtain an estimate of 1.58E-8 mutations per base pair per meiosis based on European descendants and 1.52E-8 based on African descendants.
موضوع (اسم عام یاعبارت اسمی عام)
موضوع مستند نشده
Biostatistics
موضوع مستند نشده
Identity by descent
موضوع مستند نشده
Mutation rate
موضوع مستند نشده
Population genetics
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Browning, Sharon
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Tian, Xiaowen
دسترسی و محل الکترونیکی
نام الکترونيکي
مطالعه متن کتاب وضعیت انتشار
فرمت انتشار
p
اطلاعات رکورد کتابشناسی
نوع ماده
[Thesis]
کد کاربرگه
276903
اطلاعات دسترسی رکورد
سطح دسترسي
a
تكميل شده
Y
