عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
محل استقرار
شماره کتابشناسی ملی
شماره
TL9qb8c96h
زبان اثر
زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن
انگلیسی
عنوان و نام پديدآور
عنوان اصلي
Statistical and computational methods for single-cell transcriptome sequencing and metagenomics
نام عام مواد
[Thesis]
نام نخستين پديدآور
Perraudeau, Fanny
نام ساير پديدآوران
Dudoit, Sandrine
وضعیت نشر و پخش و غیره
تاریخ نشرو بخش و غیره
2018
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
کسي که مدرک را اعطا کرده
Dudoit, Sandrine
امتياز متن
2018
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
I propose statistical methods and software for the analysis of single-cell transcriptome sequencing (scRNA-seq) and metagenomics data. Specifically, I present a general and flexible zero-inflated negative binomial-based wanted variation extraction (ZINB-WaVE) method, which extracts low-dimensional signal from scRNA-seq read counts, accounting for zero inflation (dropouts), over-dispersion, and the discrete nature of the data. Additionally, I introduce an application of the ZINB-WaVE method that identifies excess zero counts and generates gene and cell-specific weights to unlock bulk RNA-seq differential expression pipelines for zero-inflated data, boosting performance for scRNA-seq analysis. Finally, I present a method to estimate bacterial abundances in human metagenomes using full-length 16S sequencing reads.
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Perraudeau, Fanny
نام شخص - ( مسئولیت معنوی درجه دوم )
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Perraudeau, Fanny
شناسه افزوده (تنالگان)
مستند نام تنالگان تاييد نشده
UC Berkeley
دسترسی و محل الکترونیکی
نام الکترونيکي
مطالعه متن کتاب وضعیت انتشار
فرمت انتشار
p
اطلاعات رکورد کتابشناسی
نوع ماده
[Thesis]
کد کاربرگه
276903
اطلاعات دسترسی رکورد
سطح دسترسي
a
تكميل شده
Y
