عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
محل استقرار
شماره کتابشناسی ملی
شماره
97148P
زبان اثر
زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن
انگلیسی
عنوان و نام پديدآور
عنوان اصلي
GENE PREDICTION IN HETEROLOGOUS PROTEIN EXPRESSION OF CHO-DG44 CELLS USING SYSTEMS BIOLOGY TOOLS AND IN VITRO ASSAYS
عنوان اصلي
پیش‌بینی ژنهای دخیل در بیان پروتئین‌های هترولوگ سلول‌های CHO-DG44 با استفاده از رویکرد سیستم بیولوژی و آزمایش‌های in vitro
نام عام مواد
[Dissertation]
نام نخستين پديدآور
LAMIN SILLAH
نام نخستين پديدآور
لامین صیلاح
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
Tehran University of Medical Sciences, Faculty of Medicine
تاریخ نشرو بخش و غیره
2021
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
74p
ساير جزييات
2021
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
Masters
نظم درجات
Medical biotechnology
امتياز متن
18
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
Aim and ObjectivePrediction of essential genes involved in heterologous protein expression of CHO cell using Mouse genome microRNA databases as well as determining the natural expression level of predicted candidate genes in different stages of CHO-DG44 batch suspension culture via SYBR green RT-qPCR assay.Method A theoretical part of the study was designed using a systems biology approach which consisted of explore the literature on CHO-DG44, a differential expression miRNA based on array databases, microRNA databases, string databases and Cytoscape plugins to predict essential candidate genes. This was followed by the second phase using SYBR green quantitative real-time polymerase chain reactions approached to gather data, analyzed main objectives, specific objectives and answer research questions.Results We identified ten candidate genes CAT, MAPK3, DDX5, HDAC5, CDK2, CDK4, SKP2, CFL2, RAD54L and PSME3 out of 1630 genes with the aid of established microRNA databases of the mouse genome (miwalkv2.0, miRecordv2013 and Mitarbasev7.0), Cytoscape plugins such as (Cytohubba, Bingo and MCODE) which could potentially enhance recombinant therapeutic proteins production in CHO-DG44 cell lines. The results showed 60% of the genes (which selected by a systems biology approach) were stably expressed in the cell cycle as SYBR green real-time polymerase chain reaction revealed.ConclusionThese result revealed that the predicted candidate genes by systems biology were further validated by in vitro assays may be potential genes for enhancement of recombinant protein in the Chinese hamster cell line (CHO-DG44) during protein production in the cellular and secretory pathway processes
متن يادداشت
هدف: هدف از این پایان نامه، پیش‌بینی ژنهای دخیل در بیان پروتئین‌های هترولوگ سلول‌های CHO با استفاده از رویکرد سیستم بیولوژی می‌باشد. برای این منظور، از پایگاه‌های داده مربوط به microRNA ژنوم موش استفاده شد و همچنین، بیان طبیعی ژنهای کاندید پیش‌بینی شده، در مراحل مختلف کشت بچ(Batch) و به صورت سوسپانسیون سلول‌های CHO-DG44، با استفاده از تکنیک SYBR Green RT-qPCR مورد بررسی قرار گرفت.روش کار: رویکرد مطالعه در طراحی آزمایش بر پایه سیستم بیولوژی بود. بدین صورا که ابتدا با استفاده از اطلاعات مقالاتی که روی CHO-DG44 کار کرده بودند، miRNA های مهم در این سل لاین استخراج گردید و سپس، با استفاده از پایگاه‌های داده‌ای miRNA-Gene، ژنهای مرتبط با آنها بدست آمد و شبکه ژنی با استفاده از پایگاه داده‌ی STRING ساخته شد و با آنالیزهای ساختاری برپایه نرم‌افزار Cytoscape، ژنهای اصلی کاندید شدند. به دنبال آن، در فاز بعدی، از روش SYBR Green quantitative real-time polymerase chain reaction استفاده شد، تا داده‌های لازم را جهت آنالیز اهداف اصلی و اختصاصی جمع کنیم و به سوالات پژوهشی پاسخ دهیم.نتیجه گیری: نتایج نشان داد که ژن های پیش‌بینی شده که از روی مطالعات سیستمی ارائه گردیدند، ژنهای بالقوه‌ای جهت افزایش تولید پروتئین‌های نوترکیب در فرایند مسیر‌های سلولی و ترشحی رده سلولی تخمدان همستر چینی (CHO-DG44) به حساب می آیند.
موضوع (اسم عام یاعبارت اسمی عام)
موضوع مستند نشده
Systems Biology
موضوع مستند نشده
پروتئین های هترولوگ
موضوع مستند نشده
سایبر گرین
موضوع مستند نشده
سیستم بیولوژی
موضوع مستند نشده
RT-qPCR
موضوع مستند نشده
رده سلولی تخمدان همستر چینی
موضوع مستند نشده
SYBR green
موضوع مستند نشده
predicted genes
موضوع مستند نشده
Chinese hamster ovary cell lines
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )
کد نقش
, Author
کد نقش
, Author
مستند نام اشخاص تاييد نشده
SILLAH, LAMIN
مستند نام اشخاص تاييد نشده
صیلاح، لامین
نام شخص - ( مسئولیت معنوی درجه دوم )
کد نقش
, Thesis advisor
کد نقش
, Thesis advisor
کد نقش
, Thesis advisor
کد نقش
, Thesis advisor
کد نقش
, Consulting advisor
کد نقش
, Consulting advisor
کد نقش
, Consulting advisor
کد نقش
, Consulting advisor
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Asgari, Yazdan
مستند نام اشخاص تاييد نشده
عسگری، یزدان
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Mazlomi, Mohammad Ali
مستند نام اشخاص تاييد نشده
مظلومی، محمدعلی
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Davami, Fateme
مستند نام اشخاص تاييد نشده
دوامی، فاطمه
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Heidary, Reza
مستند نام اشخاص تاييد نشده
حیدری، رضا
مبدا اصلی
کشور
ایران
تاريخ عمليات
20230214
شماره دستیابی
شماره بازیابی
2173F
دسترسی و محل الکترونیکی
نام الکترونيکي
مطالعه متن کتاب وضعیت انتشار
فرمت انتشار
p
اطلاعات رکورد کتابشناسی
نوع ماده
TL
کد کاربرگه
276903
اطلاعات دسترسی رکورد
سطح دسترسي
a
تكميل شده
Y
