عنوان

بررسي اپیدمیولوژی مولكولي ویروس سینسشیال تنفسي انساني (hRSV) و ردیابي موتاسیون های ژن Fدر ناحیه اثرکننده آنتي بادی مونوکلونال Palivizumab

شماره

۹۳۹۶۸پ

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

فارسی

زبان اثر اصلي

فارسی

عنوان اصلي

بررسي اپیدمیولوژی مولكولي ویروس سینسشیال تنفسي انساني (hRSV) و ردیابي موتاسیون های ژن Fدر ناحیه اثرکننده آنتي بادی مونوکلونال Palivizumab

نام عام مواد

[پایان نامه]

نام نخستين پديدآور

شقایق رزاقی پور

نام ناشر، پخش کننده و غيره

دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی

تاریخ نشرو بخش و غیره

۱۳۹۷

نام خاص و کميت اثر

۱۰۹ص.

ساير جزييات

جدول نمودار

مواد همراه اثر

سی دی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

میکروب شناسی پزشکی

متن يادداشت

ویروس سینسشیال تنفسی انسان پاتوژنی مطرح در نوزادان و کودکان و عامل عمده عفونت حاد دستگاه تنفسی تحتانی کودکان در سراسر دنیا می باشد. با توجه به نقش پروتئین سطحی فیوژن در پاتوژنز، ایجاد پاسخ های سیستم ایمنی و استراتژیهای پیشگیری، اطلاعات اندکی در زمینه تکامل مولکولی این پروتئین در نمونه های بالینی وجود دارد که دلیل کندی پیشرفت تولید واکسن و راهکارهای درمانی hRSV محسوب می شود. هدف این مطالعه ارائه اطلاعات در خصوص تغییرات تکاملی پروتئینF، گزارش سویه های در گردش در نمونه های بالینی در ایران، ردیابی موتاسیون در سایت اتصال آنتی بادی مونوکلونال Palivizumab، با هدف پيش بيني عملکرد واكسن نوترکیب نسل آینده در جمعیت ایران می باشد. مطالعه حاضر بر پایه تعیین سکانس کامل ژن F، تعیین ژنوتایپ ویروس، بررسی تغییرات نوکلئوتیدی، تغییرات اسیدهای آمینه و آنالیز فیلوژنتیک طراحی شده است. مواد و روش کار: از RNA استخراج شده از نمونه های بالینی، جهت سنتز cDNA، PCR ژن نوکلئوپروتئین (N) به منظور تایید ویروس در نمونه ها و تکثیر آمپلیکونهای ژن فیوژن (F) با پرایمرهای اختصاصی استفاده گردید. تعیین سکانس کامل ژن F با سكانس دو طرفه توالي (Bidirectional sequencing) انجام شد. سکانس ها تعیین ژنوتایپ شدند. تغییرات نوکلئوتیدی و تغییرات آمینواسیدی در نواحی مهم سکانس های F در مقایسه با سه سویه رفرانس Long، A2 و ON1 بررسی شد. به منظور مقایسه فواصل تکاملی، درختهای فیلوژنتیک برای سکانس های ما و سکانس های ثبت شده RSVA-F در سایر مناطق جغرافیایی، رسم شدند. نتایج: ژنوتایپ تمام سکانسهای این مطالعه ON1 بود. تغییرات نوکلئوتیدی و آمینواسیدی سکانسها، هومولوژی بالا و اختلاف ژنتیکی کم بین سکانس ها با هم و با سویه های رفرانس را نشان داد. در سایت اتصال آنتی بادی مونوکلونال Palivizumab، هیچ موتاسیونی نداشتیم ولی موتاسیونهایی در اپی توپ های اختصاصی آنتی بادی ها و Cytotoxic T-lymphocytes به چشم خورد. بیشترین موتاسیون ها در مناطق not defined2، not defined4 و Heptad repeat domain2 رخ داده بود. سکانس های ما به همراه سایر سکانس های ON1 ثبت شده در جهان در 6 Lineage و 5 Sublineage قرار گرفتند. هیچ سایتی در سکانسها با فشار گزینش کننده مثبت مشاهده نشد ولی سایت هایی با فشار گزینش کننده منفی وجود داشتند. بحث: تغییر الگوی ژنوتایپیک شایع hRSV در ایران و گزارش سویه ON1 برای اولین بار نشان می دهد که ژنوتایپ ON1 سویه ای Emergent بوده و در حال حاضر در جمعیت ایران غالب شده است. وجود Herd immunity در برابر ژنوتایپ های شایع قبلی و یا سازگاری بهتر ژنوتایپ جدید با محیط و سیستم ایمنی میزبان می تواند توجیهی بر غالب شدن ژنوتایپ ON1 در ایران باشد. عدم وجود موتاسیون در سایت هدف آنتی بادی مونوکلونال Palivizumab، اثربخشی دارو در بیماران با عفونت حاد تنفسی ناشی از hRSV در صورت ورود به ایران را تایید کرده و همچنین این سایت را به عنوان اپی توپ مناسبی در طراحی واکسن نسل آینده معرفی می کند.

موضوع مستند نشده

ویروس سینسشیال تنفسی انسانی

موضوع مستند نشده

پروتئین F

موضوع مستند نشده

Palivizumab

موضوع مستند نشده

تغییرپذیری ژن F

موضوع مستند نشده

آنالیز فیلوژنتیک

موضوع مستند نشده

اپیدمیولوژی مولکولی

موضوع مستند نشده

واکسن نوترکیب

کد نقش

، پدیدآور

مستند نام اشخاص تاييد نشده

رزاقی پور، شقایق

کد نقش

، استاد راهنما

کد نقش

، استاد مشاور

کد نقش

، استاد مشاور

مستند نام اشخاص تاييد نشده

بنکدار هاشمی، فرهاد

مستند نام اشخاص تاييد نشده

سلیمی، وحید

مستند نام اشخاص تاييد نشده

شاطی زاده ملک شاهی، سمیه

عنصر شناسه اي

دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی

کشور

ایران

تاريخ عمليات

20230226

شماره بازیابی

۱۸۲۹ف

شماره فيلد فرمت مبدا

دانشگاه علوم پزشکی تهران، کتابخانه دانشکده پزشکی

فرمت انتشار

p

نوع ماده

TF

کد کاربرگه

92029

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y