بررسی تنوع ژنتیکی برخی ارکیدهای دارویی ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی ISSR و SCoT
نام عام مواد
[پایان نامه]
نام نخستين پديدآور
/ سهیلا غلامی
وضعیت نشر و پخش و غیره
محل نشرو پخش و غیره
سنندج
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: دانشگاه کردستان، دانشکده کشاورزی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۷
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
و، ۱۰۲ص
ساير جزييات
: مصور (بخشی رنگی)، جدول، عکس (رنگی)
مواد همراه اثر
+ لوح فشرده
يادداشت کلی
متن يادداشت
چکیده فارسی - انگلیسی
یادداشتهای مربوط به کتابنامه ، واژه نامه و نمایه های داخل اثر
متن يادداشت
کتابنامه: ص. ۸۹-۱۰۲
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
بيو تكنولوژی و ژنتيك مولكولی محصولات
کسي که مدرک را اعطا کرده
کردستان
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
خانواده¬ی ارکید بزرگ¬ترین خانواده گیاهی گلدار در بین نهان¬دانگان است. ارکیدها از لحاظ دارویی گیاهان بسیار ارزشمندی هستند و به دلیل برداشت بیش از حد و تفکیک زیستگاه به شدت در حال انقراض¬اند. هدف از مطالعهی حاضر درک سطح تنوع ژنتیکی در بین و درون جمعیتهای چندین گونه¬ی ارکید مهم ایران است که با استفاده از 15 آغازگر SCoT و 14 آغازگر ISSR انجام شد. در مجموع 254 قطعه SCoT و 310 قطعه ISSR تولید شد. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) برای آغازگرهای نشانگر SCoT برابر با 2618/0، همچنین میانگین شاخص نشانگر ی (MI) برابر با 1927/4 و میانگین قدرت تفکیک¬پذیری (RP) به مقدار 8648/2 برآورد گردید. همچنین برای نشانگر ISSR میانگین محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) برابر با 2174/0 و متوسط شاخص نشانگر ی (MI) برابر با 72/4 و همچنین میانگین قدرت تفکیک-پذیری برابر با 604/2 محاسبه شد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که تنوع درون جمعیتها در مقایسه با تنوع بین جمعیتها در هر دو نشانگر SCoT و ISSR بسیار کمتر بود. میانگین تنوع ژنتیکی نی (h) و شاخص شانون (I) نشان داد که بیشترین تنوع ژنتیکی در بین گونههای Himantoglossum affine و Ophrys scolopax از شهرستان جوانرود در استان کرمانشاه و کمترین تنوع ژنتیکی در بین گونههای Orchis simia در شهرستان پاوه در استان کرمانشاه به دست آمد. نتایج جدول ماتریس فاصله نشان داد که ژنوتیپها ی Ophrys schulzei در شهرستان جوانرود با Orchis simia در شهرستان جوانرود دارای بیشترین فاصله می¬باشند. ترسیم تجزیه خوشهای با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و الگوریتم UPGMA ژنوتیپها را در SCoT به 13 گروه و در ISSR به 16 گروه دستهبندی کرد. نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که ارکیدهای ایران دارای تنوع ژنتیکی کم هستند و جریان ژنی کمی بین جمعیتها نشان دهنده¬ی تفکیک جمعیتها از همدیگر است و همچنین نشانگرهای ISSR و SCoT برای ارزیابی تنوع ژنتیکی گیاه ارکید مناسب است.
متن يادداشت
Orchidaceae is one of biggest flowering plant family among gymnosperms. Orchids are medicinally important species which are under extinction due to their overharvesting. This research aimed to evaluate genetic diversity within and between populations of most important terrestrial orchid species using 15 SCoT and 14 ISSR primers. In total 254 and 310 SCoT and ISSR fragments were produced respectively. In case of SCoT markers, Polymorphism Information Content (PIC), Marker Index (MI) and Resolving Power were 0.2618, 4.1927 and 2.8648, respectively while for ISSR markers they were 0.2174, 4.72 and 2.604, respectively. Based on clustering analysis using Jaccard coefficient and UPGMA method, studied accessions were fallen under 16 groups which was further confirmed by Principle Component Analysis (PCA). Nie genetic diversity (h) and Shanon’s index revealed highest and lowest genetic diversity among Himantoglossum affine and Ophrys schulzei Javanrood population (Kermanshah province) and Orchis simia Pave population (Kermanshah province), respectively. Based on distance matrix table, there was highest genetic distance between accessions of Ophrys schulzei from Javanrood with accessions of Orhis simia. Clustering analysis of SCoT data using Jaccard coefficient and UPGMA algorithm, grouped all accessions to 16 cluster and sub-clusters. In conclusion, our results revealed relatively low genetic diversity and low gene flow among Iranian terrestrial orchid species. Meanwhile, SCoT and ISSR marker could discriminate genetic diversity and relationships among studied orchid accessions.
خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه
fa
خط فهرستنویسی و خط اصلی شناسه
ba
اصطلاحهای موضوعی کنترل نشده
اصطلاح موضوعی
Terrestrial Orchids
اصطلاح موضوعی
Gene Flow
اصطلاح موضوعی
Genetic Diversity
اصطلاح موضوعی
SCoT
اصطلاح موضوعی
ISSR
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )