بررسی تنوع ژنتیکی ارقام توتفرنگی با استفاده از نشانگرهای مولکولی
نام عام مواد
[پایاننامه]
نام نخستين پديدآور
/محمد صدیق کمانگر
وضعیت نشر و پخش و غیره
محل نشرو پخش و غیره
سنندج
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: کشاورزی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۲
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
ح، ۸۱ ص.
ساير جزييات
: مصور، جدول، نمودار
يادداشت کلی
متن يادداشت
زبان: فارسی
یادداشتهای مربوط به کتابنامه ، واژه نامه و نمایه های داخل اثر
متن يادداشت
کتابنامه: ص. ۸۱-۷۰
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
بیوتکنولوژی در کشاورزی
کسي که مدرک را اعطا کرده
کردستان
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
توتفرنگی گیاهی از جنس فراگاریا و خانواده گلسرخیان است که در تمام جهان دارای پراکندگی وسیعی بوده و به خاطر محصول میوه آن بسیار مورد توجه است. بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیتها و گونههای توتفرنگی به عنوان عامل پایداری در برابر تغییرات شرایط زیست محیطی، تنشها و همچنین در جهت ایجاد رقمهای جدید و مطلوب بسیار ضروری است. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی در بین ۴۰ ژنوتیپ توتفرنگی با شجره و خاستگاه متفاوت از ۴۰ آغازگر مربوط به سه نشانگر مولکولی ISSR ،SCoT و IRAP استفاده شد. ۳۶ آغازگر قادر به تشکیل نوارهای تکرارپذیر و قابل نمرهدهی بودند. در کل با استفاده از هر سه آغازگر، ۴۷۳ نوار تشکیل شد که ۴۱۸ نوار ۸۸/۳۷( درصد) از آنها چندشکل بودند. نشانگرهای IRAP و SCoT به ترتیب دارای بیشترین )۰/۴۹( و کمترین )۰/۴۳( مقدار محتوی اطلاعاتی چندشکلی )PIC( بودند. نسبت تنوع ژنتیکی محاسبه شده برای هر سه نوع نشانگر IRAP ،SCoT و ISSR نسبتا نزدیک بود. بر اساس آزمون مانتل همبستگی قابل توجهی )P>۰.۰۰۱( بین این سه نشانگر وجود داشت. با استفاده از دادههای ژنتیکی حاصل از سه نوع نشانگر با هم و تجزیه خوشهای بر مبنای ضریب تشابه دایس و الگوریتم UPGMA ژنوتیپها در ده گروه دستهبندی شدند. دستهبندی ژنوتیپها تا حدود زیادی با خاستگاه و شجره ژنوتیپها مورد بررسی مطابقت داشت. مقایسه الگوهای حاصل از تجزیه خوشهای بر اساس هر سه نشانگر نشان داد که مطابقت گروهها با خاستگاه و شجره بر مبنای آغازگر SCoT بیشتر از دو نشانگر دیگر بوده است. با توجه به هم گروه شدن رقم کردستان (که اطلاع دقیقی از خاستگاه و نام واقعی آن نیست) و رقم آمریکایی هانوی بر اساس اطلاعات حاصل از هر سه نشانگر، این امکان که رقم کردستان منشعب از رقم هانوی یا خویشاوند آن باشد تقویت میشود. نمودار دو بعدی حاصل از تجزیه به مختصات اصلی نیز مطابقت زیادی با نتایج تجزیه خوشهای داشت. بر اساس تجزیه واریانس مولکولی، تفاوت بین خاستگاهها معنیدار بود )P>۰.۰۱( و %۹ از تنوع ژنتیکی، به بین خاستگاهها و %۹۱ تنوع به داخل خاستگاهها اختصاص یافت. آغازگرهای IRAP ،SCoT و ISSR تعداد زیادی نوار چند شکل تولید کردند که در مطالعات شناسایی ژنوتیپها توتفرنگی و بررسی تنوع ژنتیکی میتوانند مفید واقع شوند. کلمات کلیدی: توتفرنگی، تنوع ژنتیکی، ISSR،SCoT ،PIC و IRAP
متن يادداشت
Strawberry that belongs to the family of Rosaceae in the genus Fragaria is widely distributed whole around the world and is noticeable due its fruit products. Assessment of genetic diversity is important in strawberries population and species as a stable factor against environmental variation, stresses and also to characterize new and favorite varieties. Genetic diversity was evaluated among 40 strawberry different cultivars using 40 SCoT, ISSR and IRAP markers. 36 primers were produced scoreable and reproducible bands. All three primers generated 473 bands of which 418 (88.37%) bands were polymorphic. The maximum and minimum polymorphism information content (PIC) value pertained to IRAP (0.49) and SCoT (0.43) markers respectively. Calculated value of genetic diversity was approximately the same for the three SCoT, IRAP and ISSR markers. Based on the Mantel test, there was a significant correlation (p<0.001) between three markers. Using total genetic data, varieties were clustered in ten groups based on Dice similarity coefficient and UPGMA algorithm. Results of Clustering based on three primers especially SCoT, was mainly in accordance with origin and pedigree. Co-localization of Kurdistan variety (which there is no information about its origin and real name) and Hoenoye in the same group based on three markers data reinforced this possibility that Kurdistan is a derivative or a relatedness of Hoenoye. Two dimensional graph of principal coordinate analysis was similar to cluster analysis results. According to molecular variance analysis, 9% and 91% of genetic diversity was among and within origins respectively and there was a significant difference between origins (p< 0.01). In conclusion SCoT, ISSR and IRAP largely amplified polymorphic bands which can be useful in cultivars characterization and genetic diversity assessment in strawberries population. Key words: Strawberry, Genetic diversity, PIC, SCoT, ISSR and IRAP Markers
اصطلاحهای موضوعی کنترل نشده
اصطلاح موضوعی
IRAP
اصطلاح موضوعی
PIC
اصطلاح موضوعی
SCoT
اصطلاح موضوعی
ISSR
اصطلاح موضوعی
تنوع ژنتیکی
اصطلاح موضوعی
توتفرنگی
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )