Investigation of the virulence gene babA polymorphism in bacterial samples that extracted from patients with Gastric cancer
General Material Designation
Dissertation
First Statement of Responsibility
Haider Ali Hajool
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
Natural Science
Date of Publication, Distribution, etc.
1401
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
84p.
Other Physical Details
cd
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
M.S.
Discipline of degree
Cellular and Molecular Biology
Date of degree
1401/04/07
Body granting the degree
Tabriz
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
Helicobacter pylori is one of the main human pathogens and the main causes of gastric cancer. This bacterium, with its various components and various virulence factors, causes various diseases and problems in humans infected with the bacterium. The present study was conducted in the first instance to measure the prevalence of babA disease gene, which is a gene encoding outer membrane protein, in cancer samples of people with gastric cancer infected with H. pylori, and also to study the polymorphism of this gene in the form of point mutation.The results of gel electrophoresis of the PCR product showed that 80% of the samples infected with the bacterium also carry this gene. Also, by sending the PCR product for DNA sequencing, we noticed the presence of a mutation in the 152nd position of the nucleotide of this gene, so that in the reference samples, nucleotide A is present in this position, but in 25 and 42.5% of the samples (i.e. 20 and 34 samples), babA gene contains G and T, respectively. Despite this mutation, the pathogenicity of the gene and bacteria has been preserved and bacterial carcinogenesis is still present, but more studies are needed to make a definitive claim.
Text of Note
چکیده: هلیکوباکتر پیلوری یکی از اصلی ترین پاتوژنز های انسانی و از عوامل اصلی ابتلا به سرطان معده است. این باکتری با داشتن اجزا مختلف و فاکتور های بیماری متنوع، بیماری و مشکلات مختلفی را در انسان های آلوده به باکتری ایجاد میکند. مطالعه حال حاضر در وهله اول به منظور سنجش میزان شیوع ژن بیماری babA که یک ژن کد کننده پروتئین غشای خارجی است، در نمونه های سرطانی افراد مبتلا به سرطان معده آلوده به باکتری اچ پایلوری جمع آوری شده و همچنین بررسی پلی مورفیسم این ژن است که به شکل جهش نقطه ای صورت گرفته است. نتایج حاصل از الکتروفورز ژل حامل محصول پی سی آر شده، نشان داد که ۸۰ درصد نمونه های آلوده به باکتری، این ژن را نیز در خود حمل می کنند. همچنین با ارسال محصول PCR برای سکانسینگ دی ان ای، متوجه وجود جهش در جایگاه ۱۵۲ امین نوکلئوتید این ژن شدیم بدین صورت که در نمونه های رفرنس، در این جایگاه نوکلئوتید A وجود دارد ولی به ترتیب در ۲۵ و ۴۲.۵ درصد از نمونه های حاوی ژن babA (یعنی 20 و 34 تا) ، به ترتیب G و T در این جایگاه وجود دارد. اینکه با وجود این جهش، بیماری زایی ژن و باکتری حفظ شده و هنوز هم سرطان زایی باکتری وجود دارد، قابل توجه است ولی برای ادعای قطعی به مطالعات بیشتری در این زمینه نیاز است
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
بررسی پلی مورفیسم ژن بیماری babA در نمونه های باکتریایی استخراج شده از بیماران مبتلا به سرطان معده
UNCONTROLLED SUBJECT TERMS
Subject Term
H. pylori , PCR , babA gene , DNA polymorphism , DNA sequencing
Subject Term
هلیکوباکتر پیلوری، پی سی آر، ژن babA، پولیمورفیسم دی ان ای، توالی یابی دی ان ای