Investigation of AmpC β-lactamase gene promoter mutations in Klebsiella pneumonia isolated from the urine of antibiotic resistant patients
General Material Designation
Dissertation
First Statement of Responsibility
Ahmed Ata
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
Natural Science
Date of Publication, Distribution, etc.
1401
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
87p.
Other Physical Details
cd
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
M.S.
Discipline of degree
Cellular and Molecular Biology
Date of degree
1401/04/07
Body granting the degree
Tabriz
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
This study was performed to identify mutations in the promoter region of the bla-ampC gene of Klebsiella pneumoniae, which was extracted from the urine of people with urinary tract infections. Klebsiella pneumoniae is one of the main causes of this type of infection and the prevalence of antibacterial resistance genes in this type of bacteria makes the treatment of this infection challenging.In this study, we have collected 100 urine samples and using bacterial culture methods, first identified samples infected with Klebsiella pneumoniae and then measured the resistance of bacteria in infected samples using antibacterial resistance tests. The result was that 31 of our samples were infected with Klebsiella pneumoniae and approximately 74 to 87% of the samples were resistant to the antibiotics ceftazidime, cefixime, ceftriaxone, cefotaxime and colistin. The highest resistance was to ceftazidime. Then, by doing PCR, we amplified the DNA extracted from the cultured samples and sent the product to sequencing, and then examined the mutations that occurred in the box-10 (promoter region) of the bla-ampC gene. The result was that in position -12, there are 4 mutations G to A and in region -10, there are 11 mutations T to C. These findings, with statistical comparisons of other researches and the study of antibacterial resistance in a higher number of samples, can introduce us to new patterns of antibiotic use.
Text of Note
این پژوهش برای شناسایی جهش های رخ داده در ناحیه پروموتری ژن bla-AmpC باکتری کیلیبسیلا پنومونیه که از ادرار افراد مبتلا به عفونت مجاری ادراری استخراج شده بود، صورت گرفت. کلیبسیلا پنومونیه یکی از عوامل اصلی ابتلا به این نوع عفونت می باشد و شیوع ژن های مقاومت به آنتی باکتریال در این نوع باکتری ها درمان این نوع عفونت ها را با چالش مواجهه میکند.در این پژوهش 100 نمونه ادرار جمع آوری شده از بیماران مبتلا به عفونت مجاری ادرار با استفاده از روش های کشت باکتری، ابتدا نمونه های آلوده به کلیبسیلا پنومونیه را شناسایی کرده و سپس با استفاده از تست های مقاومت به آنتی باکتریال، مقاومت باکتری های موجود در نمونه های آلوده را به دارو های آنتی باکتریال سنجیدیم. نتیجه این کار این شد که 31 تا از نمونه های ما آلوده به کلیبسیلا پنومونیه بوده و حدودا بین 74 تا 87 درصد از نمونه ها به آنتی بیوتیک های سفتازیدیم، سفیکسیم، سسفتریاکزون، سفاتوکسیم و کولیستین مقاوم بودند. بیشترین میزان مقاومت به سفتازیدیم بود. سپس با انجام پی سی آ، بخش مورد نظر از دی ان ای استخراج شده از نمونه های کشت داده شده را افزایش دادیم و برای سکانسینگ ارسال کردیم؛ سپس جهش های رخ داده در باکس -10 (ناحیه پروموتری) ژن bla-ampC را بررسی کردیم. نتیجه این شد که در جایگاه -12، 4 تا جهش G به A و در ناحیه -10، 11 تا جهش T به C وجود دارد. این یافته های با مقایسه های آماری سایر پژوهشگران و بررسی میزان مقاومت به آنتی باکتری در تعداد نمونه های بالاتر، میتواند الگو های مصرف آنتی بیوتیکی جدید را به ما معرفی کند.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
بررسی جهش های پروموتر ژن AmpC β-lactamase در باکتری های Klebsiella pneumonia استخراج شده از ادرار بیماران مقاوم به آنتی بیوتیک