بازنگری موقعیت سیستماتیکی گلپر persicum Heracleum براساس توالی ژن Matk
First Statement of Responsibility
ناریلا ناصر نیساری
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
علوم طبیعی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۳۹۹
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۵۰ص.
Accompanying Material
سی دی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
رشته ی زیست شناسی گیاهی گرایش بوم شناسی- سیستماتیک
Date of degree
۱۳۹۹/۱۱/۲۸
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
کی از بهترین ژنها برای بررسی روابط فیلوژنی بین تاکسونهای مختلف، ژن کلروپالستی matK میباشد به کار گیری اطالعاتحاصل از داده های توالی ژن کلروپالستی matK توانسته است به اصالح الگوهای تکاملی و روابط فیلوژنی بپردازد و همچنین سبب بازنگریموقعیت سیستماتیکی تاکسونها شود. روابط فیلوژنی گونهی persicum Heracleum بر اساس توالی ژن matk با سایر گونههایHeracleum مجهول میباشد. در این پژوهش توالی ژن matk را در گونهی persicum. H به دست آورده و با توالی سایر گونههایHeracleum که از سایت NCBI استخراج کردیم مقایسه کردیم. در طول مقایسه با متد Disatance فواصل ژنتیکی بین گونه .Hpersicum با سایر گونهها محاسبه شد که مطابق با اطالعات به دست آمده کمترین فاصله ژنتیکی مربوط به persicum. H باmantegazzianum Heracleum به اندازه 128/0 میباشد و همچنین بیشترین فاصله ژنتیکی مربوط به persicum. H با دوگونهیmillefolium Heracleum و candicans Heracleum به اندازه 141/0 میباشد. با استفاده از دادههای مولکولی با متدهایjoining-Neighbor و parsimony maximum به رسم درخت فیلوژنی پرداختیم. در درخت رسم شده به روش -Neighborjoining شاهد دو کالد هستیم که یکی از این کالدها دو خوشه تشکیل میدهدکه هردو مربوط به گونههای برون گروه میباشند و کالد دیگرنیز دو خوشه تشکیل میدهد که یک خوشه مربوط به persicum. H و دیگری مربوط به سایر گونههایpersicum میباشد. در درختparsimony maximum دو کالد تشکیل شده است که یک کالد شامل دو خوشه میباشد که در یکی از این خوشهها persicum. H باgeyeri Lomatium با ارزش حمایتی55 %قرار گرفتهاند و خوشهی دیگر مربوط به سایر گونههای Heracleum میباشد. با توجه به نتایجبه دست آمده از روابط خویشاوندی بین گونهی persicum. H با سایر گونهها بر اساس ژن کلروپالستی matK و مقایسه نتایج با یافتههایمولکولی حاصل از توالی ناحیه ITS2, ITS1 و هچنین ناحیهی8s/5 ریبوزومی متوجه تفاوت در یافتههای مولکولی میشویم
Text of Note
One of the best genes to investigate the phylogenetic relationships between differenttaxons is matK chloroplasty gene, using data obtained from matK chloroplast gene sequencingdata has been able to modify evolutionary patterns and phylogenetic relationships and also toreview the systematic position of taxons. Phylogenetic relationships of Heracleum persicumspecies are unknown based on matk gene sequence with other Heracleum species. In this study,matk gene sequencing in H. Persicum was obtained and compared with the sequence of otherHeracleum species we extracted from the NCBI site. During comparison with disatance method,genetic distances between H. persicum and other species were calculated that according to theobtained data, the lowest genetic distance was related to H. persicum and Heracleummantegazzianum was 0.128 and the highest genetic distance was related to H. Persicum withheracleum millefolium and Heracleum candicans is 0.141. Using molecular data with Neighborjoining and maximum parsimony methods, we plotted phylogenetic tree. In the tree plotted byneighbor-joining method, we see two Clads, one of which is two clusters, both of which arerelated to the out-group species, and the other is two clusters, one cluster is related to H. persicumand the other is related to other persicum species. In the maximum parsimony tree, two clads areformed, one of which consists of two clusters, in one of these clusters H. Persicum is located withLomatium geyeri with a supporting value of 55%, and the other cluster is related to otherHeracleum species. According to the results of kinship relationships between H. Persicum species.with other species based on matK chloroplasty gene and comparison of the results with molecularfindings obtained fromITS2, ITS1 and 5.8 riboseumi regions, we notice differences in molecular findings.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
A systematic revision of Heracleum persicum based on the matK gene sequence