عنوان

بررسی واریانت¬های شایع سه ژن اصلی درگیر در متابولیسم داروهای فلوئورویوراسیل، مرکاپتوپورین، و تاموکسیفن با استفاده از داده های ژنوتایپینگ چهار نژاد کرد، لر، فارس و آذری در جمعیت نرمال ایرانی

شماره

۳۵۱۵پ

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

فارسی

عنوان اصلي

بررسی واریانت¬های شایع سه ژن اصلی درگیر در متابولیسم داروهای فلوئورویوراسیل، مرکاپتوپورین، و تاموکسیفن با استفاده از داده های ژنوتایپینگ چهار نژاد کرد، لر، فارس و آذری در جمعیت نرمال ایرانی

نام عام مواد

[پایان نامه]

عنوان اصلي به زبان ديگر

Investigation of common variants in three main genes involved in Fluorouracil, Mercaptopurine and Tamoxifen metabolism using the genotyping data of four main Iranian races of Kurd, Lure, Fars and Azeri

نام ناشر، پخش کننده و غيره

علوم توان بخشی و سلامت اجتماعیUniversity of Social Walfare and Rehabilitation

تاریخ نشرو بخش و غیره

۱۴۰۱

نام خاص و کميت اثر

۱۵۰ص.

متن يادداشت

پیوست

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

19

نظم درجات

6

زمان اعطا مدرک

۱۴۰۱/۰۹/۲۷

متن يادداشت

مقدمه: علم فارماکوژنتیک به بررسی تاثیر پلی¬مورفیسم¬های مختلف یک ژن در پاسخ به دارو می¬¬پردازد. درک تنوع ژنتیکی هر جمعیت برای بهینه¬سازی داروهای تجویزی آن جمعیت امری ضروری است. ایران با 85 میلیون نفر جمعیت با تنوع قومی و نژادی فراوان، هفدهمین کشور پرجمعیت جهان است.اهداف: هدف این پژوهش تعیین فراوانی پلی¬مورفیسم¬های مهم سه فارماکوژن CYP2D6، DPYD وTPMT در یازده گروه نژادی از جمعیت ایرانی است. این ژن¬ها نقش اساسی در متابولیسم دارو¬های فلوئورویوراسیل، مرکاپتوپورین، و تاموکسیفن دارند؛ که در درمان انواع سرطان بکار می¬روند.روش اجرا: برای انجام روش انتساب و تعیین فراوانی پلی¬مورفیسم¬های سه ژن نامبرده در یازده گروه نژادی از جمعیت ایرانی از نرم افزارهای IMPUTE2 و R استفاده شد. داده¬هایی مرجع و خام این پژوهش به ترتیب شامل داده¬های ژنوتیپی فاز سوم پروژه هزار ژنوم و داده¬های ژنوتیپی 1024 فرد سالم ایرانی است.نمونه¬های DNA جمعیت 1024 نفری مورد مطالعه قبلاً با استفاده از ریزآرایه متراکم Axiom Precision Medicine Research Array با توانایی تعیین بیش از 900 هزار SNP در کل ژنوم، تعیین ژنوتیپ شده بودند. همچنین در جهت تعیین دقیق فراوانی هریک از واریانت¬ها از نتایج پروژه ایرانوم نیز کمک گرفته شد.یافته¬ها: پنج آلل معیوب ژن TPMT با فراوانی¬های (%0.55) TPMT*3A، (0.23%)TPMT*3C ، (0.32%) TPMT*4، (0.046%) TPMT*8 و (%0.25) TPMT*16، دو آلل معیوب ژن DPYD با فراوانی-های (%1.27)Haplotype B3 و (%0.139) DPYD*2A و همچنین شش آلل¬ معیوب ژن CYP2D6 با فراوانی¬های (%0.375) CYP2D6*3، (11.26%) CYP2D6*4، (0.5%) CYP2D6*6، (15.18%) CYP2D6*10، (4.31%) CYP2D6*17 و (%10.02) CYP2D6*41 در جمعیت ایرانی با استفاده از روش انتساب تعیین شدند.نتیجه¬گیری: از نتایج این مطالعه می¬توان برای تهیه پروفایل فارماکوژنتیکی جمعیت ایرانی بهره برد. تطابق بالای نتایج انتساب و توالی¬یابی اگزوم نشان می¬دهد که انتساب می¬تواند یک جایگزین رقابتی و کم هزینه برای توالی¬یابی کل ژنوم باشد. کلید واژه¬ها: CYP2D6، DPYD ،TPMT، IMPUTE2، انتساب، فارماکوژنتیک و ایران.

متن يادداشت

Introduction: The science of pharmacogenetics investigates the effect of various polymorphisms of a gene on the drugs response. Understanding the genetic variety of each population is essential for optimizing prescription drugs for that population. Iran is the 17th most populated country in the world with a population of 85 million people, which has a lot of ethnic and racial diversity. Objectives: The aim of this research is determining the frequency of important polymorphisms of three pharmacogenes CYP2D6, DPYD and TPMT in eleven ethnic groups of the Iranian population. These genes play an essential role in the metabolism of mercaptopurine, fluorouracil, and tamoxifen drugs, which are used in the treatment of various types of cancers.Materials and Methods: IMPUTE2 and R software were used to perform the imputation method and determine the frequency of significant polymorphisms of the above three genes in eleven ethnical groups of Iranian population. The reference and raw data of this research include the genotyping data of the third phase of the 1000 Genome Project and the genotyping data of 1024 healthy Iranian individuals, respectively. the DNA samples of the studied 1024 cases were previously genotyped using the dense microarray technique of Axiom Precision Medicine Research Array with the ability to determine more than 900 thousand SNPs in the whole genome. Furthermore, in order to accurately determine the frequency of each of the variants, the results of the Iranome project were also used.Results: Five defective alleles of TPMT gene with frequencies of TPMT*3A (0.55%), TPMT*3C (0.23%), TPMT*4 (0.32%), TPMT*8 (0.046%) and TPMT*16 (0.25%), two defective allele of the DPYD gene with frequencies of Haplotype B3 (1.27%) and DPYD*2A (0.139%), as well as six defective alleles of the CYP2D6 gene with the frequencies of CYP2D6*3 (0.375%), CYP2D6*4 (11.26%), CYP2D6*6 (0.5%), CYP2D6*10 (15.18%), CYP2D6*17 (4.31%) and CYP2D6*41 (10.02%) were determined in the Iranian population by using the imputation method.Conclusions: The results of this study can be used to prepare the pharmacogenetic profile of the Iranian population. The high concordance of the results of exome sequencing and imputation shows that imputation can be a competitive and low-cost alternative to whole genome sequencing.Keywords: CYP2D6, DPYD, TPMT, IMPUTE2, Imputation, pharmacogenetics and Iran.

موضوع مستند نشده

CYP2D6

مستند نام اشخاص تاييد نشده

محمدی، یوسف

مستند نام اشخاص تاييد نشده

Mohamadi, Yoosef

مستند نام اشخاص تاييد نشده

نجم آبادی، حسین

مستند نام اشخاص تاييد نشده

کهریزی، کیمیا

کشور

ایران

سازمان

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

تاريخ عمليات

20230107

فرمت انتشار

D

نوع ماده

TF

کد کاربرگه

279226

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y