عنوان

Meta-analysis of gene expression data in the hippocampus tissue of human temporal lobe epilepsy

شماره

T25281

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

انگلیسی

عنوان اصلي

Meta-analysis of gene expression data in the hippocampus tissue of human temporal lobe epilepsy

نام عام مواد

Dissertation

نام نخستين پديدآور

Hamze kamaran

نام ناشر، پخش کننده و غيره

Natural Sciences

تاریخ نشرو بخش و غیره

1400

نام خاص و کميت اثر

84p.

ساير جزييات

cd

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

Master of science

نظم درجات

Animal Biology

زمان اعطا مدرک

1400/06/23

متن يادداشت

Temporal lobe epilepsy (TLE) is the most prevalent type of epilepsy which characterized by recurrent, sudden and unprovoked seizure and also hippocampal sclerosis. The molecular mechanism underlying the development of epilepsy remains largely unknown, which hinders the discovery of effective anti-epileptogenic drugs therefore, current treatments of epilepsy alleviant symptoms and are unable to cure epilepsy. In this study, we built a systems-level analytic framework which integrates gene meta-signatures, gene coexpression network and cellular regulatory network to unveil the evolution landscape of epileptogenic process and to identify key regulators that govern the transition of brain from control to epileptic state. By considering hippocampus important role in epilepsy and epileptogenesis we select the gene expression data which compared control and epileptic hippocampus tissue. This study was also designed to examine laterality of hippocampus tissue which compare sensitivity of left and right hippocampus in human TLE. we compared more than 500 genes expression between control and epileptic tissues by considering the lateralization and our results confirmed Ca2+ regulation, apoptosis, dopamine synthesis, neural plasticity pathways affected in epileptogenesis as previously were discussed also. While we find some new pathways such as proteins folding pathway, ER stress and removing of misfolded proteins that are involved in epilepsy development and were not discussed previously. Molecular network also confirmed similarity of epilepsy to some viral infectious such as herps simplex which mainly affected nervous system. Our findings provide a landscape of the gene network dynamics underlying epileptogenesis and uncovered candidate regulators that may serve as potential targets for future anti-epileptogenic therapy development.

متن يادداشت

صرع لوب گیجگاهی (TLE) شایع ترین نوع صرع است که با تشنج مکرر ، ناگهانی و بدون علت و همچنین اسکلروز هیپوکامپ شناخته میشود. مکانیسم مولکولی نحت توسعه صرع تا حد زیادی ناشناخته است ، که مانع از آن می شو. بنابراین ، کشف داروهای موثر ضد صرع ، درمانهای فعلی تسکین دهنده صرع علائم را نشان می دهد و قادر به درمان صرع نیست. در این مطالعه ، ما یک تجزیه و تحلیل سطح سیستم ایجاد کردیم چارچوبی که متا امضای ژن ، شبکه بیان همزمان ژن و سلولی را ادغام می کند شبکه نظارتی برای افشای چشم انداز تکامل فرآیند صرع و شناسایی کلید تنظیم کننده هایی که انتقال مغز را از حالت کنترل به حالت صرع کنترل می کنند. با در نظر گرفتن هیپوکامپ نقش مهمی در صرع و صرع ما داده های بیان ژن را انتخاب می کنیم که بافت هیپوکامپ کنترل و صرع را مقایسه کرد. این مطالعه نیز به گونه ای طراحی شده است که بررسی جانبی بافت هیپوکامپ که حساسیت هیپوکامپ چپ و راست را مقایسه می کند در TLE انسانی ما بیش از 500 بیان ژن را بین کنترل و صرع مقایسه کردیم بافت ها با در نظر گرفتن جانبی شدن و نتایج ما تنظیم Ca2 را تأیید کرد ، آپوپتوز ، سنتز دوپامین ، مسیرهای پلاستیسیته عصبی تحت تأثیر صرع به عنوان قبلا نیز مورد بحث قرار گرفت در حالی که ما برخی از مسیرهای جدید مانند تا شدن پروتئین ها را پیدا می کنیم مسیر ، استرس ER و حذف پروتئین های تا نشده که در صرع نقش دارند توسعه و قبلا مورد بحث قرار نگرفت. شبکه مولکولی نیز تأیید شده است شباهت صرع به برخی از عفونت های ویروسی مانند هرپس سیمپلکس که عمدتا تحت تأثیر قرار می گیرند سیستم عصبی. یافته های ما چشم اندازی از پویایی شبکه ژنی را ارائه می دهد زمینه ساز صرع و تنظیم کننده های نامزد کشف نشده که ممکن است به عنوان بالقوه برای اهداف توسعه درمان ضد صرع در آینده عمل کنند.

عنوان گونه گون

فرا تحدیل (متا-آنالیز) بررسی داده اای بیان ژن بافت ایپوکامپ در صرع لوب تمپورال انسانی

اصطلاح موضوعی

epilepsy, hippocampus, meta-analysis, differential gene expression

اصطلاح موضوعی

صرع، هیپوکمپ، فرا تحلیل، بیان ژن افتراقی

عنصر شناسه اي

kamaran,

ساير عناصر نام

Hamze

کد نقش

Producer

عنصر شناسه اي

Sadeghi,

عنصر شناسه اي

Khalaj-Kondori,

ساير عناصر نام

Leila

ساير عناصر نام

Mohammad

کد نقش

Thesis advisor

کد نقش

Consulting advisor

عنصر شناسه اي

Tabriz

کشور

ایران

سازمان

central library of tabriz

تاريخ عمليات

20220608

شماره بازیابی

ارشد پایاننامه QL351.K2 1400

نام الکترونيکي

فرمت انتشار

e

نوع ماده

TL

کد کاربرگه

276903

سطح دسترسي

a

تكميل شده

Y