عنوان

بررسی تنوع گونه ای و فیلوژنی قارچ های افیوستوماتوئید مرتبط با میزبان های چوبی در منطقه شمالغرب ایران

شماره

پ۲۸۴۷۹

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

per

عنوان اصلي

بررسی تنوع گونه ای و فیلوژنی قارچ های افیوستوماتوئید مرتبط با میزبان های چوبی در منطقه شمالغرب ایران

نام نخستين پديدآور

مرضیه محرابیون محمدی

نام ناشر، پخش کننده و غيره

کشاورزی

تاریخ نشرو بخش و غیره

۱۴۰۱

نام خاص و کميت اثر

۱۲۲ص.

مواد همراه اثر

سی دی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

دکتری

نظم درجات

رشته بیماری شناسی گیاهی

زمان اعطا مدرک

۱۴۰۱/۱۱/۱۸

متن يادداشت

قارچ های افیوستوماتوئید، یک گروه ناهمگن قارچ¬ها را شامل می¬شوند که بر اساس شباهت¬های ریخت¬شناختی به این نام معروف شده¬اند. این قارچ¬ها در خانواده Ophiostomataceae از راسته Ophiostomatales و خانواده Microascaceae، Graphiaceae، Ceratocystidaceae و Gondwanamycetaceae از راسته Microascales قرار می¬گیرند. این قارچ¬ها به دلیل اینکه دارای مسیلیوم¬های رنگی هستند، باعث تغییر رنگ چوب می¬شوند و روی کمیّت و کیفیت چوب تاثیر می¬گذارند و خسارت جبران ناپذیری در صنعت صادرات و واردات چوب ایجاد می¬کنند. برخی از این گونه¬های قارچی در لیست بیمارگرهای قرنطینه کشور واقع شده¬اند و در صورت واردات چوب¬های آلوده، امکان انتشار آنها در داخل کشور به صورت گسترده وجود دارد. این قارچ¬ها برای ایجاد آلودگی نیاز به زخم دارند و تعداد زیادی از گونه-های Ophiostoma دارای ارتباط همزیستی نزدیک با سوسک¬های پوستخوار می¬باشند. به ویژه، سوسک‌های پوست‌خوار با میکانژیا (اندام‌های استفاده شونده برای حمل قارچ‌های همزیست) به انتشار و نفوذ قارچ به میزبان کمک می¬کنند. آرایه بندی و در نتیجه شناسایی این گروه قارچی تا سطح گونه اغلب به دلیل ویژگی¬های ریخت¬شناختی ساده و هم¬پوشانی این صفات ریخت¬شناختی بین گروه¬های مختلف همواره مشکل¬ساز بوده است. مطالعات اخير بر مبناي داده¬هاي مولکولي نشان مي¬دهد که صفات ریخت¬شناختی معيار خوبي براي آرايه¬بندي این گروه به شمار نمي¬رود. علی¬رغم اهمیت این گروه از قارچ¬ها، تاکنون مطالعات انگشت¬شماری بر روی تنوع زیستی آن¬ها در ایران صورت گرفته است و اغلب محدود به توصيف برخي گونه¬ها از نمونه¬هاي گياهي بوده و در اغلب موارد کشت زنده اين جدايه¬ها براي مطالعات مولکولي موجود نمي-باشد. پژوهش حاضر با هدف بررسی تنوع گونه¬ای گروه قارچ-های افیوستوماتوئید و وابستگان آن در برخی مناطق شمال و شمالغرب کشور روی میزبان¬های چوبی مختلف، بر اساس ترکیبی از معیارهای ریخت¬شناختی و توالی¬یابی چندژنی انجام شد. پس از جداسازی و خالص¬سازی جدایه¬های قارچی از بسترهای مختلف، با استفاده از روش¬های رایج در بیماری¬شناسی گیاهی، شناسایی بر پایه صفات ریخت¬شناختی و تجزیه و تحلیل داده¬های توالی سه ناحیه ITS-rDNA، LSU-rDNA، TEF1-αو Beta-tubulin با استفاده از استنتاج بیژین انجام شد. در این بررسی، 148 جدایه متعلق به سه خانواده Microascaceae، Graphiaceaeو Ophiostomataceae بدست آمد که 9 جدایه متعلق به خانواده Microascaceae (3جنس، 3 گونه)، 42 جدایه متعلق به خانواده Graphiaceae (1جنس،11 گونه) و 97 جدایه متعلق به خانواده Ophiostomataceae (یک جنس، یک گونه) بود. در بین آرایه¬های شناسایی شده گونه¬ O. novo-ulmi از فراوانی و پراکنش بیشتری برخوردار بود. همچنین، 9 گونه جدید برای میکوبیوتای دنیا شامل یک گونه Petriella و هشت گونه Graphiumمعرفی شدند. میزبان¬ها و بستره¬های غذایی جدیدی نیز برای تمامی گونه¬های موجود در این بررسی گزارش شدند. گونه¬های G. basitruncatum، G. euwallaceae و Scedosprorium minutisporum به عنوان گونه¬های جدید برای میکوبیوتای ایران گزارش شدند. جهت بررسی ساختار جمعیتی و تنوع ژنتیکی در جمعیت¬های قارچیOphiostoma ulmi sensu lato از نشانگر مولکولی RAPD-PCR با سه آغازگر OPA-9، OPA-12 و OPA-16 استفاده شد. تجزیه¬ی خوشه¬ای داده¬ها در تلفیق سه اغازگر نشانگر مولکولی RAPD-PCR با استفاده از روش UPGMA و بر اساس ضریب تشابه جاکارد در سطح تشابه 95 درصد، جدایه¬ها را در 7 گروه قرار داد. این تجزیه خوشه¬ای، گروه¬بندی واضحی بر اساس منشا جغرافیایی جدایه¬ها نشان نداد. نتایج حاصل از این بررسی نشان داد که گونه O. ulmi در طی نمونه¬برداری¬ها جداسازی نشده و این به دلیل جایگزینی و انقراض سریع این گونه غیر مهاجم با گونه¬های مهاجم و زیر گونه¬های آن است.

متن يادداشت

Abstract: Ophiostomatoid fungi include a heterogeneous group of fungi that have been named based on their morphological similarities. These fungi are placed in Ophiostomataceae from the order Ophiostomatales and the families Microascaceae, Graphiaceae, Ceratocystidaceae and Gondwanamycetaceae from the order Microascales. Because these fungi have colored mycelium, they change the color of wood and affect the quantity and quality of wood and cause irreparable damage in the wood export and import industry. Some of these fungal species are in the list of quarantine pathogens of the country, and if infected wood is imported, there is a possibility of spreading them widely inside the country. These fungi need a wound to cause infection, and a large number of Ophiostoma species have a close symbiotic relationship with bark beetles. In particular, bark beetles with mycangia (organs used to carry symbiotic fungi) help spread and penetrate the host. Because of simple morphology and overlap of morphological features among different groups, taxonomy and therefore identification of these fungi have always been problematic. Recent studies have proven morphological traits not being appropriate criteria for species delineation in this group. Despite the importance of this group of fungi, few studies have been conducted on their biodiversity in Iran and it is often limited to the description of some species from plant samples and in most of the cases there is no living culture available for molecular studies. The aim of present study was to explore species diversity of the ophiostomatoid fungi and its relatives in some regions of the north and northwest of the country on different woody hosts, based on a combination of morphological criteria and multigene sequencing. After isolation and purification of fungal isolates from different substrates using common methods in plant pathology, identification based on morphological features and analysis of sequence data of three regions of ITS-rDNA, LSU- rDNA, TEF-1α and beta-tubulin gene were performed using Bayesian inference. In this study, 148 isolates belonging to three families (Microascaceae, Graphiaceae and Ophiostomataceae), including 9 isolates belonging to the Microascaceae family (3 genera, 3 species), 42 isolates belonging to the Graphiaceae family (one genus, 11 species) and 97 isolates belonging to the Ophiostomataceae family (one genus, one species) were obtained. Among the identified taxa, O. novo-ulmi had more abundance and distribution. Petriella ulmi was described as new species for science. Several other new species candidates including eight Graphium species were described based on a combination of morphological and multigene sequence data. The species Graphium basitruncatum, Graphium euwallaceae and Scedosporium minutisporum are new reports for the mycobiota of Iran. In order to investigate the population structure and genetic diversity in Ophiostoma ulmi senso lato populations RAPID-PCR molecular marker was used with three primers OPA-9, OPA-12 and OPA-16. Cluster analysis of the data in the combination of three RAPID-PCR molecular marker primers with arithemic average (UPGMA( method and jaccards coefficients for RAPID-PCR marker data grouped Ophiostoma novo-ulmi isolates into 7 clusters with similarity index 95%. No clear grouping was evident according to geographical origin of the isolates. The results of this study showed that O. ulmi species was not isolated during sampling and this is due to the rapid replacement and extinction of this non-invasive species with invasive Ophiostoma novo-ulmi and its subspecies.

عنوان گونه گون

Species diversity and phylogeny of Ophiostomatoid fungi associated with woody hosts in northwestern region of Iran

عنصر شناسه اي

محرابیون محمدی،

ساير عناصر نام

‏مرضیه

کد نقش

تهیه کننده

عنصر شناسه اي

ارزنلو،

عنصر شناسه اي

‏پرتوت،

ساير عناصر نام

‏‏مهدی

ساير عناصر نام

‏ایلاریا

تاريخ

استاد راهنما

تاريخ

استاد مشاور

عنصر شناسه اي

‏تبریز